Фактор трилистника 2 - Trefoil factor 2

TFF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DYZ, 2DZ0, 2DZ1
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF2, SML1, SP, фактор трилистника 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 182590 MGI: 1306805 ГомолоГен: 3956 Генные карты: TFF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.3 Начните 42,346,357 бп[1] Конец 42,350,997 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 15,8 см Начните 31,141,049 бп[2] Конец 31,144,282 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с хемокиновым рецептором CXCR4 Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • лечение раны • поддержание желудочно-кишечного эпителия • отрицательная регуляция секреции желудочного сока • хемокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7032	21785
Ансамбль	ENSG00000160181	ENSMUSG00000024028
UniProt	Q03403	Q03404 Q9QX97
RefSeq (мРНК)	NM_005423	NM_009363
RefSeq (белок)	NP_005414	NP_033389
Расположение (UCSC)	Chr 21: 42.35 - 42.35 Мб	Chr 17: 31.14 - 31.14 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор трилистника 2 это белок что у людей кодируется TFF2 ген.^[5][6][7]

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотива трилистника, домена из 40 аминокислот, который содержит три консервативных дисульфиды. Они стабильные секреторные белки выражено в желудочно-кишечный слизистая оболочка. Их функции не определены, но они могут защищать слизистую от повреждений, стабилизировать слой слизи и влиять на заживление эпителий. Кодируемый белок подавляет Желудочный сок секреция. Эта ген и два других родственных гена члена семейства трилистников обнаружены в кластере на хромосома 21.^[7]

Связывание гликанов

Все факторы человеческого трилистника лектины которые специфически взаимодействуют с дисахаридом GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Этот дисахарид представляет собой необычный гликотоп, который, как известно, существует только на больших, сильно гликозилированных, муцины в слизистой оболочке. Путем сшивки муцины за счет двухвалентного связывания этого гликотопа факторы трилистника затем могут обратимо изменять толщину и вязкость слизи.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160181 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024028 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tomasetto C, Rockel N, Mattei MG, Fujita R, Rio MC (сентябрь 1992 г.). «Ген, кодирующий человеческий спазмолитический белок (SML1 / hSP), находится в 21q 22.3, физически связан с гомологичным маркером генов рака груди BCEI / pS2». Геномика. 13 (4): 1328–30. Дои:10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID  1505966.
6. Готт П., Бек С., Мачадо Дж. К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. Дои:10.1159/000472224. PMID  9043862. S2CID  25235589.
7. «Ген Entrez: фактор трилистника TFF2 2 (спазмолитический белок 1)».
8. Ярва М.А., Лингфорд Дж. П., Джон А., Солер Н. М., Скотт Н. Э., Годдард-Боргер ED (май 2020 г.). «Факторы трилистника разделяют лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи». Nature Communications. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. Дои:10.1038 / s41467-020-16223-7. ЧВК  7221086. PMID  32404934.

дальнейшее чтение

• Advenier C, Lagente V, Boichot E (1997). «Роль антагонистов тахикининовых рецепторов в профилактике гиперреактивности бронхов, воспаления дыхательных путей и кашля». Евро. Респир. J. 10 (8): 1892–906. Дои:10.1183/09031936.97.10081892. PMID  9272936.
• Лангер Г., Ягла В., Беренс-Бауманн В. и др. (2003). «Глазные TFF-пептиды: новые ассоциированные со слизью секреторные продукты бокаловидных клеток конъюнктивы». Adv. Exp. Med. Биол. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 506 (Pt A): 313–6. Дои:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. ISBN  978-1-4613-5208-2. PMID  12613926.
• Tomasetto C, Rio MC, Gautier C, et al. (1990). «hSP, доменный гомолог белка pS2, коэкспрессируется с pS2 в желудке, но не в карциноме груди». EMBO J. 9 (2): 407–14. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08125.x. ЧВК  551681. PMID  2303034.
• Бхогал Н., Доннелли Д., Финдли Дж. Б. (1994). «Сайт связывания лиганда рецептора нейрокинина 2. Сайт-направленный мутагенез и идентификация остатков связывания нейрокинина А в рецепторе нейрокинина 2 человека». J. Biol. Chem. 269 (44): 27269–74. PMID  7961636.
• Ханби А.М., Поулсом Р., Сингх С. и др. (1993). «Спазмолитический полипептид представляет собой главный антральный пептид: распределение трилистниковых пептидов человеческого спазмолитического полипептида и pS2 в желудке». Гастроэнтерология. 105 (4): 1110–6. Дои:10.1016 / 0016-5085 (93) 90956-д. PMID  8405856.
• Ито Х, Томита М, Учино Х и др. (1996). «Клонирование кДНК крысиного пептида pS2 и экспрессия трилистниковых пептидов при колите, вызванном уксусной кислотой». Biochem. J. 318 (3): 939–44. Дои:10.1042 / bj3180939. ЧВК  1217708. PMID  8836141.
• May FE, Westley BR (1997). «Тесная физическая связь генов, кодирующих белок pNR-2 / pS2 и человеческий спазмолитический белок (hSP)». Гм. Genet. 99 (3): 303–7. Дои:10.1007 / s004390050362. PMID  9050913. S2CID  22603186.
• Сейб Т., Блин Н., Хильгерт К. и др. (1997). «Три гена трилистника человека TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области 55 т.п.н. на хромосоме 21q22.3». Геномика. 40 (1): 200–2. Дои:10.1006 / geno.1996.4511. PMID  9070946.
• Каядемир Т., Сильва Эдос С., Пуш С. и др. (1998). «Новый тандемный повтор из 25 п.н. в гене пептида трилистника человека TFF2 в 21q22.3: полиморфизм и эволюция млекопитающих». Евро. J. Hum. Genet. 6 (2): 121–8. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200166. PMID  9781055.
• Брунеллески С., Бордин Дж., Коланджело Д., Виано I (1999). «Рецепторы тахикинина на моноцитах человека: их участие в ревматоидном артрите». Нейропептиды. 32 (3): 215–23. Дои:10.1016 / S0143-4179 (98) 90040-3. PMID  10189055. S2CID  40222022.
• Мэй FE, Семпл Дж. И., Ньютон Дж. Л., Уэстли Б. Р. (2000). «Белок двухдоменного трилистника человека, TFF2, гликозилируется in vivo в желудке». Кишечник. 46 (4): 454–9. Дои:10.1136 / гут.46.4.454. ЧВК  1727891. PMID  10716671.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Берри А., Скотт Х.С., Кудо Дж. И др. (2001). «Уточненная локализация локуса аутосомно-рецессивной несиндромной глухоты DFNB10 с использованием 34 новых микросателлитных маркеров, геномной структуры и исключения шести известных генов в регионе». Геномика. 68 (1): 22–9. Дои:10.1006 / geno.2000.6253. PMID  10950923.
• Булитта С.Дж., Флеминг СП, Райчоудхури Р. и др. (2002). «Для аутоиндукции промотора фактора трилистника 2 (TFF2) требуется расположенный выше цис-действующий элемент». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (1): 366–74. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00199-7. PMID  12054609.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ху GY, Yu BP, Dong WG и др. (2003). «Экспрессия TFF2 и инфекции Helicobacter pylori в канцерогенезе слизистой оболочки желудка». Мир J. Гастроэнтерол. 9 (5): 910–4. Дои:10.3748 / wjg.v9.i5.910. ЧВК  4611396. PMID  12717829.