Фактор трилистника 3 - Trefoil factor 3

TFF3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E9T, 1PE3
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF3, ITF, P1B, TFI, фактор трилистника 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 600633 MGI: 104638 ГомолоГен: 2427 Генные карты: TFF3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.3 Начните 42,311,667 бп[1] Конец 42,315,651 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 15,8 см Начните 31,125,306 бп[2] Конец 31,129,646 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточный • внеклеточная область • секреторная гранула Биологический процесс • лечение раны • регулирование процесса обмена глюкозы • поддержание желудочно-кишечного эпителия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7033	21786
Ансамбль	ENSG00000160180	ENSMUSG00000024029
UniProt	Q07654	Q62395
RefSeq (мРНК)	NM_003226	NM_011575
RefSeq (белок)	NP_003217	NP_035705
Расположение (UCSC)	Chr 21: 42.31 - 42.32 Мб	Chr 17: 31.13 - 31.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор трилистника 3 это белок что у людей кодируется TFF3 ген.^[5][6][7]

Функция

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотив трилистника, 40-аминокислотный домен, содержащий три консервативных дисульфидные связи. Это стабильные секреторные белки, экспрессирующиеся в слизистой оболочке желудочно-кишечного тракта. Их функции разнообразны, включая защиту слизистой оболочки, сгущение слизи и увеличение скорости заживления эпителия. Этот ген является маркером столбчатого эпителия и экспрессируется в различных тканях, включая бокаловидные клетки кишечника и толстой кишки. Этот ген и два других родственных гена члена семейства трилистников обнаружены в кластере на хромосоме 21.^[7]

Связывание гликанов

Все три фактора трилистника человека лектины которые специфически взаимодействуют с дисахаридом GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Этот дисахарид представляет собой необычный гликотоп, который, как известно, существует только на больших, сильно гликозилированных, муцины в слизистой оболочке. Путем сшивки муцины за счет двухвалентного связывания этого гликотопа факторы трилистника затем могут обратимо изменять толщину и вязкость слизи.^[8]

В грудном молоке

Факторы трилистника (TFF) представляют собой секреторные продукты клеток, продуцирующих муцин. Они играют ключевую роль в поддержании целостности поверхности слизистой оболочки полости рта и ускоряют заживление слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта с помощью процесса, называемого реституцией. TFF включает желудочные пептиды (TFF1 ), спазмолитический пептид (TFF2 ), и фактор трилистника кишечника (TFF3, этот белок). Они играют важную и необходимую роль в восстановлении эпителия желудочно-кишечного тракта. Значительное количество TFF присутствует в материнском молоке. Были представлены доказательства того, что TFF3, выделенный из молока, сильно коррелирует с подавлением Ил-6 и Ил-8 в эпителиальных клетках кишечника человека. С другой стороны, TFF3 активировал эпителиальные клетки в культуре, чтобы продуцировать бета-дефенсины 2 (hBD2) и бета-дефенсины 4 (hBD4). Эти данные предполагают, что TFF может активировать эпителиальные клетки кишечника и может активно участвовать в иммунной системе грудных детей, индуцируя производство пептидов, связанных с врожденной защитой, таких как дефенсины.^[9]

Активация рецепторов PAR-2

Были описаны два основных механизма активации PAR-2: (A) посредством специфического расщепления, которое демаскирует рецептор-активирующую пептидную последовательность, присутствующую во внеклеточном N-концевом домене каждого PAR, что приводит к передаче клеточных сигналов через взаимодействие экспонированных связанных лиганд с телом самого рецептора; и (B) синтетическими пептидами, такими как SLIGKV, которые связываются с рецептором, имитируя действие протеаз-агонистов.^[10] Во время лактации TFF3, секретируемый с грудным молоком, может активировать эпителиальные клетки кишечника через рецепторы PAR-2, что, в свою очередь, индуцирует экспрессию hBD2 и hBD4 и регуляцию цитокинов.^[10]

Клиническое значение

Используя TFF3 в качестве маркера столбчатого эпителия, был разработан процесс с использованием съедобного устройства для отбора проб из пищевода (Cytosponge) в сочетании с иммуноцитохимическим анализом фактора трилистника 3 для повышения точности и приемлемости обнаружения / скрининга пищевода Барретта.^[11]Однако клиническая применимость такого теста может быть ограничена частым окрашиванием TFF3 в кардиальном отделе желудка и последующим риском ложноположительных результатов.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160180 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024029 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тим Л., Волдайк Х. Ф., Нильсен П. Ф., Кристенсен М., Линч-Девани К., Подольский Д. К. (май 1995 г.). «Характеристика фактора трилистника кишечника человека и крысы, продуцируемого дрожжами». Биохимия. 34 (14): 4757–64. Дои:10.1021 / bi00014a033. PMID  7718582.
6. Готт П., Бек С., Мачадо Дж. К., Карнейро Ф., Шмитт Х., Блин Н. (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. Дои:10.1159/000472224. PMID  9043862. S2CID  25235589.
7. «Энтрез Ген: фактор трилистника TFF3 3 (кишечник)».
8. Ярва М.А., Лингфорд Дж. П., Джон А., Солер Н. М., Скотт Н. Э., Годдард-Боргер ED (май 2020 г.). «Факторы трилистника разделяют лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи». Nature Communications. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. Дои:10.1038 / s41467-020-16223-7. ЧВК  7221086. PMID  32404934.
9. Баррера Дж., Санчес Дж., Гонсалес Дж. Э. (ноябрь 2012 г.). «Фактор трилистника, выделенный из грудного молока человека, подавляет активность цитокинов (IL8 и IL6) и способствует экспрессии человеческого бета-дефенсина (hBD2 и hBD4) в эпителиальных клетках кишечника HT-29». Боснийский J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. Дои:10.17305 / bjbms.2012.2448. ЧВК  4362502. PMID  23198942.
10. Баррера Дж. Дж., Тортолеро Г. С. (2016). «Фактор трилистника 3 (TFF3) из грудного молока человека активирует рецепторы PAR-2 ​​эпителиальных клеток кишечника HT-29, регулируя цитокины и дефенсины». Братиславске ЛекаРске Листы. 117 (6): 332–9. Дои:10.4149 / bll_2016_066. PMID  27546365.
11. Кадри С.Р., Лао-Сириейкс П., О'Донован М., Дебирам И., Дас М., Блейзби Дж. М., Эмери Дж., Буссиутас А., Моррис Х., Уолтер Ф. М., Фароа П., Хардвик Р. Х., Фитцджеральд Р. «Приемлемость и точность неэндоскопического скринингового теста пищевода Барретта в первичной медико-санитарной помощи: когортное исследование». BMJ. 341: c4372. Дои:10.1136 / bmj.c4372. ЧВК  2938899. PMID  20833740.
12. Peitz U, Kouznetsova I, Wex T, Gebert I, Vieth M, Roessner A, Hoffmann W, Malfertheiner P (2004). «Экспрессия TFF3 в пищеводно-желудочном соединении увеличивается при гастроэзофагеальной рефлюксной болезни (ГЭРБ)». Пептиды. 25 (5): 771–7. Дои:10.1016 / j.peptides.2004.01.018. PMID  15177871. S2CID  23122603.

дальнейшее чтение

• Баррера Дж. Дж., Санчес Дж., Гонсалес Дж. Э. (2012). «Фактор трилистника, выделенный из грудного молока человека, подавляет активность цитокинов (IL8 и IL6) и способствует экспрессии человеческого бета-дефенсина (hBD2 и hBD4) в эпителиальных клетках кишечника HT-29». Боснийский J Basic Med Sci. 12 (4): 256–64. Дои:10.17305 / bjbms.2012.2448. ЧВК  4362502. PMID  23198942.
• Хоффманн В., Ягла В., Вид А. (2001). «Молекулярная медицина TFF-пептидов: от кишечника до мозга». Histol. Гистопатол. 16 (1): 319–34. PMID  11193208.
• Хоффманн В., Ягла В. (2002). «Специфическая экспрессия секреторных пептидов TFF: совместная локализация с муцинами и синтез в головном мозге». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 213: 147–81. Дои:10.1016 / S0074-7696 (02) 13014-2. ISBN  978-0-12-364617-0. PMID  11837892.
• Лангер Г., Ягла В., Беренс-Бауманн В. и др. (2003). «Глазные TFF-пептиды: новые ассоциированные со слизью секреторные продукты бокаловидных клеток конъюнктивы». Adv. Exp. Med. Биол. 506 (Pt A): 313–6. Дои:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. PMID  12613926.
• Сейб Т., Дули С., Велтер С. (1995). «Характеристика геномной структуры и промоторной области фактора трилистника кишечника человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 214 (1): 195–9. Дои:10.1006 / bbrc.1995.2274. PMID  7669039.
• Подольский Д.К., Геркен Г., Эйкинг А., Карио Е. (2009). «Колит-ассоциированный вариант TLR2 вызывает нарушение восстановления слизистой оболочки из-за дефицита TFF3». Гастроэнтерология. 137 (1): 209–20. Дои:10.1053 / j.gastro.2009.03.007. ЧВК  2812790. PMID  19303021.
• Хаузер Ф., Поулсом Р., Чинери Р. и др. (1993). «hP1.B, человеческий пептид Р-домена, гомологичный фактору трилистника кишечника крысы, экспрессируется также в клоне клеток, связанных с язвой, и в матке». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (15): 6961–5. Bibcode:1993PNAS ... 90.6961H. Дои:10.1073 / пнас.90.15.6961. ЧВК  47055. PMID  8346203.
• Подольский Д.К., Линч-Девани К., Стоу Дж. Л. и др. (1993). «Идентификация фактора трилистника кишечника человека. Специфическая для бокаловидных клеток экспрессия пептида, нацеленного на апикальную секрецию». J. Biol. Chem. 268 (9): 6694–702. PMID  8454642.
• Schmitt H, Wundrack I, Beck S и др. (1996). «Третий ген пептида P-домена (TFF3), фактор трилистника кишечника человека, соответствует 21q22.3». Cytogenet. Cell Genet. 72 (4): 299–302. Дои:10.1159/000134208. PMID  8641134.
• Чинери Р., Уильямсон Дж., Поулсом Р. (1997). «Ген, кодирующий фактор трилистника кишечника человека (TFF3), расположен на хромосоме 21q22.3, сгруппированной с другими членами семейства пептидов трилистника». Геномика. 32 (2): 281–4. Дои:10.1006 / geno.1996.0117. PMID  8833157.
• Пробст Дж. К., Цецше Т., Вебер М. и др. (1997). «Фактор трилистника кишечника человека экспрессируется в гипоталамусе и гипофизе человека: доказательства нового нейропептида». FASEB J. 10 (13): 1518–23. Дои:10.1096 / fasebj.10.13.8940297. PMID  8940297. S2CID  34974159.
• Сейб Т., Блин Н., Хильгерт К. и др. (1997). «Три гена трилистника человека TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области 55 т.п.н. на хромосоме 21q22.3». Геномика. 40 (1): 200–2. Дои:10.1006 / geno.1996.4511. PMID  9070946.
• Тан XD, Лю QP, Hsueh W. и др. (1999). «Фактор трилистника кишечника связывается с эпителиальными клетками кишечника и индуцирует выработку оксида азота: прайминг и усиление эффектов муцина». Biochem. J. 338 (3): 745–51. Дои:10.1042/0264-6021:3380745. ЧВК  1220112. PMID  10051448.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Берри А., Скотт Х.С., Кудо Дж. И др. (2001). «Уточненная локализация локуса аутосомно-рецессивной несиндромной глухоты DFNB10 с использованием 34 новых микросателлитных маркеров, геномной структуры и исключения шести известных генов в регионе». Геномика. 68 (1): 22–9. Дои:10.1006 / geno.2000.6253. PMID  10950923.
• Виде А., Хинц М., Канцлер Э. и др. (2001). «Синтез и локализация муцин-ассоциированных TFF-пептидов в матке человека». Клеточная ткань Res. 303 (1): 109–15. Дои:10.1007 / s004410000297. PMID  11235998. S2CID  35516062.
• Ямачика Т., Вертера Дж. Л., Бодиана С. и др. (2002). «Фактор трилистника кишечника: маркер плохого прогноза при раке желудка». Clin. Рак Res. 8 (5): 1092–9. PMID  12006524.
• Кимура Ю., Люнг П.С., Кенни Т.П. и др. (2002). «Дифференциальная экспрессия фактора трилистника кишечника в билиарных эпителиальных клетках первичного билиарного цирроза». Гепатология. 36 (5): 1227–35. Дои:10.1053 / jhep.2002.36157. PMID  12395334. S2CID  23931292.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q07654 (Фактор трилистника 3) на PDBe-KB.