UBE1DC1 - UBE1DC1

UBA5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3GUC, 3H8V, 5ХХ
Идентификаторы
Псевдонимы	UBA5, THIFP1, UBE1DC1, убиквитиноподобный модификатор, активирующий фермент 5, SCAR24, EIEE44
Внешние идентификаторы	OMIM: 610552 MGI: 1913913 ГомолоГен: 11738 Генные карты: UBA5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q22.1 Начинать 132,654,446 бп[1] Конец 132,678,097 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F1 Начинать 104,046,599 бп[2] Конец 104,063,134 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • убиквитин-подобный модификатор, активирующий ферментативную активность • Связывание АТФ • связывание ионов металлов • Активность фермента, активирующего UFM1 Сотовый компонент • цитоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки • цитозоль • аппарат Гольджи Биологический процесс • регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • уфмилирование белка K69 • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума • уфмилирование белков • нервно-мышечный процесс • модификация белка путем конъюгации малых белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79876	66663
Ансамбль	ENSG00000081307	ENSMUSG00000032557
UniProt	Q9GZZ9	Q8VE47
RefSeq (мРНК)	NM_024818 NM_198329 NM_001320210 NM_001321238 NM_001321239	NM_025692
RefSeq (белок)	NP_001307139 NP_001308167 NP_001308168 NP_079094 NP_938143	NP_079968
Расположение (UCSC)	Chr 3: 132,65 - 132,68 Мб	Chr 9: 104.05 - 104.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-подобный модификатор-активирующий фермент 5 это белок что у людей кодируется UBA5 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства E1-подобных активирующих ферментов. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000081307 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032557 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
6. Комацу М., Чиба Т., Тацуми К., Иемура С., Танида И., Окадзаки Н., Уэно Т., Коминами Э., Нацуме Т., Танака К. (май 2004 г.). «Новая система конъюгирования с белком для Ufm1, модификатора убиквитинового сворачивания». EMBO J. 23 (9): 1977–86. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600205. ЧВК  404325. PMID  15071506.
7. «Ген Entrez: UBE1DC1 убиквитин-активирующий фермент E1-домен, содержащий 1».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Доу Т., Гу С., Лю Дж. И др. (2006). «Выделение и характеристика убиквитин-активирующего фермента E1-домена, содержащего 1, UBE1DC1». Мол. Биол. Представитель. 32 (4): 265–71. Дои:10.1007 / s11033-005-4822-у. PMID  16328888. S2CID  24569517.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9GZZ9 (Человеческий убиквитин-подобный модификатор, активирующий фермент 5 (UBE1DC1)) на PDBe-KB.