UBE4B - UBE4B - Wikipedia

UBE4B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2KRE, 3L1X, 3L1Z
Идентификаторы
Псевдонимы	UBE4B, E4, HDNB1, UBOX3, UFD2, UFD2A, фактор убиквитинирования E4B
Внешние идентификаторы	OMIM: 613565 MGI: 1927086 ГомолоГен: 107623 Генные карты: UBE4B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.22 Начинать 10,032,832 бп[1] Конец 10,181,239 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 E2 | 4 79,08 см Начинать 149,328,416 бп[2] Конец 149,426,749 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • Связывание АТФазы • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание ферментов • Связывание АТФ • трансферазная активность • активность убиквитин-убиквитинлигазы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • убиквитинлигазный комплекс • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • катаболический процесс клеточного белка • моноубиквитинирование белков • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума • морфогенез миокарда трабекулы желудочков • убиквитинирование белков • развитие проекции нейрона • гранзим-опосредованный апоптотический сигнальный путь • ответ на УФ • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • аутоубиквитинирование белков • полиубиквитинирование белков • убиквитин-зависимый путь ERAD • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10277	63958
Ансамбль	ENSG00000130939	ENSMUSG00000028960
UniProt	O95155	Q9ES00
RefSeq (мРНК)	NM_001105562 NM_006048	NM_022022
RefSeq (белок)	NP_001099032 NP_006039	NP_071305
Расположение (UCSC)	Chr 1: 10.03 - 10.18 Мб	Chr 4: 149.33 - 149.43 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор конъюгации убиквитина E4 B это белок что у людей кодируется UBE4B ген.^[5][6][7]

Модификация белков с помощью убиквитин является важным клеточным механизмом для нацеливания на аномальные или короткоживущие белки для деградации. Убиквитинирование включает как минимум три класса ферментов: убиквитин-активирующие ферменты, или E1s, убиквитин-конъюгирующие ферменты, или E2s, и убиквитин-протеиновые лигазы, или E3s.

Этот ген кодирует дополнительный фактор конъюгации, Е4, который участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи. Этот ген также является самым сильным кандидатом в нейробластома гены-супрессоры опухолей.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130939 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028960 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
6. Koegl M, Hoppe T, Schlenker S, Ulrich HD, Mayer TU, Jentsch S (апрель 1999 г.). «Новый фактор убиквитинирования, Е4, участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи». Клетка. 96 (5): 635–44. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80574-7. PMID  10089879.
7. «Ген Entrez: фактор убиквитинирования UBE4B E4B (гомолог UFD2, дрожжи)».

дальнейшее чтение

• Оньянго П., Лубьева Б., Гарделлин П. и др. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36». Геномика. 50 (2): 187–98. Дои:10.1006 / geno.1997.5186. PMID  9653645.
• Охира М., Кагеяма Х., Михара М. и др. (2000). «Идентификация и характеристика гомозиготно удаленной области размером 500 т.п.н. в 1p36.2-p36.3 в клеточной линии нейробластомы». Онкоген. 19 (37): 4302–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1203786. PMID  10980605.
• Махони Дж. А., Один Дж. А., Уайт С. М. и др. (2002). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора полиубиквитинирования Ufd2p расщепляется каспазой 6 и гранзимом B во время апоптоза». Biochem. J. 361 (Pt 3): 587–95. Дои:10.1042/0264-6021:3610587. ЧВК  1222341. PMID  11802788.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Канеко С., Хатакеяма С., Мацумото М. и др. (2003). «Характеристика мышиного гена убиквитинлигазы U-бокса UFD2a». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 300 (2): 297–304. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02834-6. PMID  12504083.
• Krona C, Ejeskär K, Abel F и др. (2003). «Скрининг генных мутаций в области кандидата-супрессора опухоли нейробластомы размером 500 т.п.н. в хромосоме 1р; мутации и стадийно-специфическая экспрессия в UBE4B / UFD2». Онкоген. 22 (15): 2343–51. Дои:10.1038 / sj.onc.1206324. PMID  12700669.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Окумура Ф., Хатакеяма С., Мацумото М. и др. (2005). «Функциональная регуляция FEZ1 убиквитинлигазой E4B U-бокса способствует нейритогенезу». J. Biol. Chem. 279 (51): 53533–43. Дои:10.1074 / jbc.M402916200. PMID  15466860.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Спинетт С., Махони Дж. А., Розен А. (2006). «Домен MPAC представляет собой новый митотически регулируемый домен, удаляемый апоптотическим расщеплением протеазой во время гибели клетки». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 347 (4): 1103–12. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.06.194. PMID  16870146.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.

внешняя ссылка

• UBE4B расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• UBE4B детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.