УБР4 - UBR4

УБР4
Идентификаторы
Псевдонимы	УБР4, RBAF600, ZUBR1, p600, убиквитин протеинлигаза компонент E3 n-распознавание 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 609890 MGI: 1916366 ГомолоГен: 10804 Генные карты: УБР4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.13 Начинать 19,074,510 бп[1] Конец 19,210,266 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начинать 139,352,609 бп[2] Конец 139,489,588 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание кальмодулина • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • центросома • цитоскелет • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль • клеточная мембрана • специфическая гранулированная мембрана • мембрана третичных гранул • мембрана гранул, богатая фиколином-1 Биологический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • убиквитинирование белков • дегрануляция нейтрофилов • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23352	69116
Ансамбль	ENSG00000127481	ENSMUSG00000066036
UniProt	Q5T4S7	A2AN08
RefSeq (мРНК)	NM_020765	NM_001160319
RefSeq (белок)	NP_065816	NP_001153791
Расположение (UCSC)	Chr 1: 19.07 - 19.21 Мб	Chr 4: 139,35 - 139,49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза UBR4 является фермент что у людей кодируется УБР4 ген.^[5][6][7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127481 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066036 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ота Т, Сузуки Й, Нисикава Т, Оцуки Т, Сугияма Т, Ириэ Р., Вакамацу А, Хаяши К., Сато Х, Нагаи К., Кимура К., Макита Х, Секин М, Обаяши М, Ниси Т, Сибахара Т, Танака Т , Ishii S, Yamamoto J, Saito K, Kawai Y, Isono Y, Nakamura Y, Nagahari K, Murakami K, Yasuda T., Iwayanagi T, Wagatsuma M, Shiratori A, Sudo H, Hosoiri T, Kaku Y, Kodaira H, Kondo H, Sugawara M, Takahashi M, Kanda K, Yokoi T, Furuya T., Kikkawa E, Omura Y, Abe K, Kamihara K, Katsuta N, Sato K, Tanikawa M, Yamazaki M, Ninomiya K, Ishibashi T, Yamashita H, Муракава К., Фудзимори К., Танай Х, Кимата М, Ватанабэ М, Хираока С., Чиба Й, Исида С., Оно Й, Такигути С., Ватанабэ С., Йосида М., Хотута Т., Кусано Дж., Канехори К., Такахаши-Фуджи А., Hara H, Tanase TO, Nomura Y, Togiya S, Komai F, Hara R, Takeuchi K, Arita M, Imose N, Musashino K, Yuuki H, Oshima A, Sasaki N, Aotsuka S, Yoshikawa Y, Matsunawa H, Ichihara T , Шиохата Н., Сано С., Мория С., Момияма Х, Сато Н., Таками С., Терашима Й, Судзуки О, Накагава С., Сено А, Мидзогути Х, Гото Y, Симидзу Ф, Вакебе Х, Хишигаки Х, Ватанабэ Т, Сугияма А, Такемото М, Каваками Б, Ямадзаки М, Ватанабэ К., Кумагаи А, Итакура С, Фукузуми Й, Фудзимори Й, Комияма М, Таширо Х, Танигами А , Fujiwara T, Ono T, Yamada K, Fujii Y, Ozaki K, Hirao M, Ohmori Y, Kawabata A, Hikiji T, Kobatake N, Inagaki H, Ikema Y, Okamoto S, Okitani R, Kawakami T, Noguchi S, Itoh Т, Сигета К., Сенба Т, Мацумура К., Накадзима Й, Мидзуно Т, Моринага М, Сасаки М, Тогаши Т, Ояма М, Хата Х, Ватанабэ М, Комацу Т, Мидзусима-Сугано Дж, Сато Т, Сираи Й, Такахаси Й, Накагава К., Окумура К., Нагасе Т., Номура Н., Кикучи Х., Масухо Ю., Ямасита Р., Накай К., Яда Т., Накамура И., Охара О, Исогай Т., Сугано С. (декабрь 2003 г.). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Нат Жене. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
6. Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
7. Тасаки Т., Малдер Л.С., Ивамацу А., Ли М.Дж., Давыдов И.В., Варшавский А., Муэсинг М., Квон Ю.Т. (август 2005 г.). «Семейство убиквитинлигаз E3 млекопитающих, которые содержат UBR-бокс-мотив и распознают N-дегроны». Mol Cell Biol. 25 (16): 7120–7136. Дои:10.1128 / MCB.25.16.7120-7136.2005. ЧВК  1190250. PMID  16055722.
8. «Entrez Gene: цинковый палец ZUBR1, UBR1 тип 1».

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–113. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т. и др. (1998). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК Res. 4 (5): 345–349. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID  9455484.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ха К.В., Демаси Дж., Огава Х. и др. (2005). "Ассоциация онкопротеина E7 вируса папилломы человека типа 16 с фактором, связанным с белком ретинобластомы 600 кДа, p600". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (32): 11492–11497. Дои:10.1073 / pnas.0505337102. ЧВК  1182135. PMID  16061792.
• Накатани Й., Кониши Х., Василев А. и др. (2005). «p600, уникальный белок, необходимый для морфогенеза мембран и выживания клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (42): 15093–15098. Дои:10.1073 / pnas.0507458102. ЧВК  1247991. PMID  16214886.
• Леннерц В., Фато М., Джентилини С. и др. (2005). «Ответ аутологичных Т-клеток на меланому человека определяется мутировавшими неоантигенами». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (44): 16013–16018. Дои:10.1073 / pnas.0500090102. ЧВК  1266037. PMID  16247014.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.