УБР5 - UBR5

УБР5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1I2T, 2QHO, 3PT3
Идентификаторы
Псевдонимы	УБР5, DD5, EDD, EDD1, HYD, убиквитин протеинлигаза, компонент E3, n-распознавание 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 608413 MGI: 1918040 ГомолоГен: 9295 Генные карты: УБР5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 8 (человек)
Конец	102,412,759 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	38,078,854 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность убиквитин-протеинтрансферазы; • активность убиквитин-убиквитинлигазы; • связывание убиквитина; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК; • связывание ионов цинка; • связывание ионов металлов; • трансферазная активность; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • мембрана; • цитозоль; • перинуклеарная область цитоплазмы; • макромолекулярный комплекс;
Биологический процесс	• отрицательное регулирование восстановления двухцепочечных разрывов; • отрицательная регуляция убиквитинирования гистона H2A K63; • полиубиквитинирование белков; • сигнальный путь рецептора прогестерона; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • убиквитинирование белков; • клеточная пролиферация; • Ремонт ДНК; • положительная регуляция экспрессии генов; • GO: 0022415 вирусный процесс; • убиквитинирование, связанное с белком K48; • положительная регуляция импорта белка в ядро;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51366
	70790
	ENSG00000104517
	ENSMUSG00000037487
	O95071
	Q80TP3
	NM_001282873; NM_015902
	NM_001081359; NM_001112721; NM_027553
	NP_001269802; NP_056986
	NP_001074828; NP_001106192
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза UBR5 является фермент что у людей кодируется УБР5 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует индуцированный прогестином белок, который принадлежит к семейству HECT (гомология карбоксильному концу E6-AP). Белки семейства HECT функционируют как убиквитин-протеиновые лигазы E3, нацеленные на специфические белки для убиквитин-опосредованного протеолиза. Этот ген локализован в хромосоме 8q22, которая нарушена при различных формах рака. Этот ген потенциально играет роль в регуляции пролиферации или дифференцировки клеток.^[7]

Взаимодействия

UBR5 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104517 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037487 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Каллаган М.Дж., Рассел А.Дж., Вуллатт Э., Сазерленд Г.Р., Сазерленд Р.Л., Уоттс К.К. (март 1999 г.). «Идентификация белка семейства HECT человека с гомологией гиперпластическим дискам гена супрессора опухолей Drosophila». Онкоген. 17 (26): 3479–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1202249. PMID 10030672.
^ Тасаки Т., Малдер Л.С., Ивамацу А., Ли М.Дж., Давыдов И.В., Варшавский А., Муесинг М., Квон Ю.Т. (август 2005 г.). "Семейство убиквитин-лигаз E3 млекопитающих, которые содержат бокс-мотив UBR и распознают N-дегроны". Mol Cell Biol. 25 (16): 7120–36. Дои:10.1128 / MCB.25.16.7120-7136.2005. ЧВК 1190250. PMID 16055722.
^ ^а ^б "Ген Entrez: убиквитин-протеинлигаза EDD1 E3, домен HECT, 1".
^ ^а ^б Хендерсон MJ, Рассел AJ, Hird S, Muñoz M, Clancy JL, Lehrbach GM, Calanni ST, Jans DA, Sutherland RL, Watts CK (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. PMID 12011095.
^ Эблен С.Т., Кумар Н.В., Шах К., Хендерсон М.Дж., Уоттс К.К., Шокат К.М., Вебер М.Дж. (апрель 2003 г.). «Идентификация новых субстратов ERK2 с использованием сконструированной киназы и аналогов АТФ». J. Biol. Chem. 278 (17): 14926–35. Дои:10.1074 / jbc.M300485200. PMID 12594221.
^ Хонда Й, Тодзё М., Мацудзаки К., Анан Т., Мацумото М., Андо М., Сая Х., Накао М. (февраль 2002 г.). «Взаимодействие HECT-домена убиквитинлигазы hHYD и ДНК-топоизомеразы II-связывающего белка для ответа на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (5): 3599–605. Дои:10.1074 / jbc.M104347200. PMID 11714696.

дальнейшее чтение

Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О, Нагасе Т. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID 10048485.
Deo RC, Зоненберг Н., Берли СК (2001). «Рентгеновская структура белка гиперпластических дисков человека: ортолог C-концевого домена поли (A) -связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (8): 4414–9. Дои:10.1073 / pnas.071552198. ЧВК 31849. PMID 11287654.
Хонда Й, Тодзё М., Мацузаки К., Анан Т., Мацумото М., Андо М., Сая Х., Накао М. (2002). «Взаимодействие HECT-домена убиквитинлигазы hHYD и ДНК-топоизомеразы II-связывающего белка для ответа на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (5): 3599–605. Дои:10.1074 / jbc.M104347200. PMID 11714696.
Хендерсон MJ, Рассел AJ, Hird S, Muñoz M, Clancy JL, Lehrbach GM, Calanni ST, Jans DA, Sutherland RL, Watts CK (2002). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. PMID 12011095.
Эблен С.Т., Кумар Н.В., Шах К., Хендерсон М.Дж., Уоттс К.К., Шокат К.М., Вебер М.Дж. (2003). «Идентификация новых субстратов ERK2 с использованием сконструированной киназы и аналогов АТФ». J. Biol. Chem. 278 (17): 14926–35. Дои:10.1074 / jbc.M300485200. PMID 12594221.
Чжан С., Дауд Д.Р., Стаал А., Гу С., Лиан Дж.Б., ван Вейнен А.Дж., Стейн Г.С., Макдональд П.Н. (2003). «Ядерный коактиватор-62 кДа / Ski-взаимодействующий белок представляет собой коактиватор, связанный с ядерным матриксом, который может связывать опосредованную рецептором витамина D транскрипцию и сплайсинг РНК». J. Biol. Chem. 278 (37): 35325–36. Дои:10.1074 / jbc.M305191200. PMID 12840015.
Клэнси Дж. Л., Хендерсон М. Дж., Рассел А. Дж., Андерсон Д. В., Бова Р. Дж., Кэмпбелл И. Г., Чунг Д. Ю., Макдональд Г. А., Манн Г. Дж., Нолан Т., Брэди Дж., Олопаде О. И., Вуллатт Е., Дэвис М. Дж., Сегара Д., Хакер Н. Ф., Хеншал С. М. , Сазерленд Р.Л., Уоттс К.К. (2003). «EDD, человеческий ортолог гена супрессора опухоли гиперпластических дисков, амплифицируется и сверхэкспрессируется при раке». Онкоген. 22 (32): 5070–81. Дои:10.1038 / sj.onc.1206775. PMID 12902990.
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК 1459365. PMID 16565220.
Хендерсон М.Дж., Муньос М.А., Сондерс Д.Н., Клэнси Д.Л., Рассел А.Дж., Уильямс Б., Паппин Д., Ханна К.К., Джексон С.П., Сазерленд Р.Л., Уоттс К.К. (2007). «EDD опосредует активацию CHK2, вызванную повреждением ДНК» (PDF). J. Biol. Chem. 281 (52): 39990–40000. Дои:10.1074 / jbc.M602818200. PMID 17074762. S2CID 25298222.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

внешние ссылки

Ubr5: Обзор белков: страницы молекул UCSD-Nature
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O95071 (Убиквитин-протеинлигаза E3 UBR5) на PDBe-KB.

Эта белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104517 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037487 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10030672-5] Каллаган М.Дж., Рассел А.Дж., Вуллатт Э., Сазерленд Г.Р., Сазерленд Р.Л., Уоттс К.К. (март 1999 г.). «Идентификация белка семейства HECT человека с гомологией гиперпластическим дискам гена супрессора опухолей Drosophila». Онкоген. 17 (26): 3479–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1202249. PMID 10030672.

[pmid16055722-6] Тасаки Т., Малдер Л.С., Ивамацу А., Ли М.Дж., Давыдов И.В., Варшавский А., Муесинг М., Квон Ю.Т. (август 2005 г.). "Семейство убиквитин-лигаз E3 млекопитающих, которые содержат бокс-мотив UBR и распознают N-дегроны". Mol Cell Biol. 25 (16): 7120–36. Дои:10.1128 / MCB.25.16.7120-7136.2005. ЧВК 1190250. PMID 16055722.

[entrez-7] а ^б "Ген Entrez: убиквитин-протеинлигаза EDD1 E3, домен HECT, 1".

[pmid12011095-8] а ^б Хендерсон MJ, Рассел AJ, Hird S, Muñoz M, Clancy JL, Lehrbach GM, Calanni ST, Jans DA, Sutherland RL, Watts CK (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. PMID 12011095.

[pmid12594221-9] Эблен С.Т., Кумар Н.В., Шах К., Хендерсон М.Дж., Уоттс К.К., Шокат К.М., Вебер М.Дж. (апрель 2003 г.). «Идентификация новых субстратов ERK2 с использованием сконструированной киназы и аналогов АТФ». J. Biol. Chem. 278 (17): 14926–35. Дои:10.1074 / jbc.M300485200. PMID 12594221.

[pmid11714696-10] Хонда Й, Тодзё М., Мацудзаки К., Анан Т., Мацумото М., Андо М., Сая Х., Накао М. (февраль 2002 г.). «Взаимодействие HECT-домена убиквитинлигазы hHYD и ДНК-топоизомеразы II-связывающего белка для ответа на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (5): 3599–605. Дои:10.1074 / jbc.M104347200. PMID 11714696.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]