UHRF1 - UHRF1

UHRF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2FAZ, 2L3R, 2LGG, 2ЛГК, 2LGL, 2ПБ7, 3ASK, 3ASL, 3BI7, 3CLZ, 3DB3, 3DB4, 3DWH, 3FL2, 3ШБ, 3СОУ, 3SOW, 3SOX, 3T6R, 3ZVY, 3ЗВЗ, 4GY5, 4 квартала, 5C6D, 5IAY
Идентификаторы
Псевдонимы	UHRF1, ICBP90, Np95, RNF106, hNP95, hhuNp95, TDRD22, убиквитин, подобный доменам PHD и безымянного пальца 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607990 MGI: 1338889 ГомолоГен: 7866 Генные карты: UHRF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начните 4,903,080 бп[1] Конец 4,962,154 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 Д Начните 56,303,321 бп[2] Конец 56,323,486 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • гемиметилированная ДНК-связывание • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание метил-CpG • GO: 0001158 Связывание с ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание нуклеосомных гистонов • связывание метилированного гистона • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • трансферазная активность • связывание ионов цинка • связывание гистонов Сотовый компонент • эухроматин • ядерная матрица • вилка репликации • гетерохроматин • ядерный гетерохроматин • ядерный хроматин • ядро клетки Биологический процесс • моноубиквитинирование гистонов • положительная регуляция клеточного метаболизма белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • поддержание метилирования ДНК • положительная регуляция активности ДНК-топоизомеразы (АТФ-гидролизирующая) • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция зависимого от метилирования молчания хроматина • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • убиквитинирование белков • клеточный цикл • клеточная пролиферация • убиквитинирование гистонов • Ремонт ДНК • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • аутоубиквитинирование белков • организация хроматина • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • регуляция пролиферации эпителиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	29128	18140
Ансамбль	ENSG00000276043	ENSMUSG00000001228
UniProt	Q96T88	Q8VDF2
RefSeq (мРНК)	NM_001048201 NM_001290050 NM_001290051 NM_001290052 NM_013282	NM_001111078 NM_001111079 NM_001111080 NM_010931
RefSeq (белок)	NP_001041666 NP_001276979 NP_001276980 NP_001276981 NP_037414	NP_001104548 NP_001104549 NP_001104550 NP_035061
Расположение (UCSC)	Chr 19: 4.9 - 4.96 Мб	Chr 17: 56,3 - 56,32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-подобный, содержащий домены пальца PHD и RING, 1, также известен как UHRF1, это белок который у человека кодируется UHRF1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует члена подсемейства Безымянный палец тип Убиквитин-лигазы E3. Белок связывается с полуметилированной ДНК во время S-фазы и рекрутирует основной белок ДНК-метилтрансферазы, DNMT1, чтобы регулировать структуру хроматина и экспрессию генов. Его экспрессия достигает пика в поздней фазе G1 и продолжается во время фаз G2 и M клеточный цикл. Он играет важную роль в переходе G1 / S и функционирует в p53 -зависимая контрольная точка повреждений ДНК. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. Первоначально он был идентифицирован как прямой регулятор топоизомеразы 2a, но впоследствии это было опровергнуто. Uhrf1 широко изучался in vivo с использованием рыбок данио.

Клиническое значение

UHRF1 недавно был идентифицирован как роман онкоген при гепатоцеллюлярной карциноме, основном типе рака печени.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000276043 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001228 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: убиквитиноподобный UHRF1, содержащий домены пальца PHD и RING, 1».
6. Хопфнер Р., Мусли М., Елч Дж. М., Вулгарис А., Лутц И., Марин С., Беллок Дж. П., Аудет П., Броннер С. (январь 2000 г.). «ICBP90, новый человеческий CCAAT-связывающий белок, участвующий в регуляции экспрессии топоизомеразы IIalpha». Исследования рака. 60 (1): 121–8. PMID  10646863.
7. Мудбхари, Ракша; Хосида, Юджин; Чернявская, Елена; Иаков, Винита; Вильянуэва, Аугусто; Фил, М. Изабель; Чен, Синьтун; Кодзима, Кенсуке; Thung, Лебедь; Бронсон, Родерик Т .; Лахенмайер, Аня; Ревилл, Кейт; Альсине, Клара; Сачиданандам, Рави; Десаи, анальный; Сенбанерджи, Сучарита; Укомаду, Чинвейке; Llovet, Josep M .; Сэдлер, Кирстен С. (2014). «Сверхэкспрессия UHRF1 вызывает гипометилирование ДНК и гепатоцеллюлярную карциному». Раковая клетка. 25 (2): 196–209. Дои:10.1016 / j.ccr.2014.01.003. ЧВК  3951208. PMID  24486181.

дальнейшее чтение

• Ku DH, Chang CD, Koniecki J, Cannizzaro LA, Boghosian-Sell L, Alder H, Baserga R (апрель 1991 г.). «Новая комплементарная ДНК, регулируемая ростом, с последовательностью предполагаемого трансактивирующего фактора». Рост и дифференциация клеток. 2 (4): 179–86. PMID  1868030.
• Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Е., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра M (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Геномные исследования. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549. Проверить значения даты в: | год = / | дата = несоответствие (Помогите)
• Хопфнер Р., Мусли М., Елч Дж. М., Вулгарис А., Лутц И., Марин С., Беллок Дж. П., Аудет П., Броннер С. (январь 2000 г.). «ICBP90, новый человеческий CCAAT-связывающий белок, участвующий в регуляции экспрессии топоизомеразы IIalpha». Исследования рака. 60 (1): 121–8. PMID  10646863.
• Хопфнер Р., Мусли М., Гарнье Дж. М., Редон Р., дю Мануар С., Чаттон Б., Гизелинк Н., Ауде П., Броннер С. (март 2001 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование гена, кодирующего ICBP90, белка, участвующего в регуляции экспрессии гена топоизомеразы IIalpha». Ген. 266 (1–2): 15–23. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00371-7. PMID  11290415.
• Мусли М., Хопфнер Р., Аббади А.К., Монте Д., Жанблан М., Ауде П., Луи Б., Броннер С. (июль 2003 г.). «ICBP90 принадлежит к новому семейству белков с нарушенной регуляцией экспрессии в раковых клетках». Британский журнал рака. 89 (1): 120–7. Дои:10.1038 / sj.bjc.6601068. ЧВК  2394215. PMID  12838312.
• Читтерио Э., Папаит Р., Никассио Ф., Векки М., Гомьеро П., Мантовани Р., Ди Фьоре П. П., Бонапас И. М. (март 2004 г.). «Np95 - это гистон-связывающий белок, наделенный убиквитинлигазной активностью». Молекулярная и клеточная биология. 24 (6): 2526–35. Дои:10.1128 / MCB.24.6.2526-2535.2004. ЧВК  355858. PMID  14993289.
• Арима Ю., Хирота Т., Броннер К., Мусли М., Фудзивара Т., Нива С., Исикава Н., Сая Н. (февраль 2004 г.). «Понижающая регуляция ядерного белка ICBP90 с помощью сигналов контрольной точки p53 / p21Cip1 / WAF1-зависимого повреждения ДНК способствует остановке клеточного цикла при переходе G1 / S». Гены в клетки. 9 (2): 131–42. Дои:10.1111 / j.1356-9597.2004.00710.x. PMID  15009091. S2CID  23980129.
• Abbady AQ, Bronner C, Trotzier MA, Hopfner R, Bathami K, Muller CD, Jeanblanc M, Mousli M (декабрь 2003 г.). «Экспрессия ICBP90 подавляется в клетках Jurkat, индуцированных апоптозом». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1010: 300–3. Дои:10.1196 / летопись.1299.052. PMID  15033738. S2CID  32581931. Проверить значения даты в: | год = / | дата = несоответствие (Помогите)
• Бранденбергер Р., Вэй Х, Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природа Биотехнологии. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390. Проверить значения даты в: | год = / | дата = несоответствие (Помогите)
• Тротзер М.А., Броннер С., Батами К., Матье Э., Аббади А.К., Жанблан М., Мюллер С.Д., Рошетт-Эгли С., Мусли М. (июнь 2004 г.). «Фосфорилирование ICBP90 протеинкиназой A увеличивает экспрессию топоизомеразы IIalpha». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 319 (2): 590–5. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.05.028. PMID  15178447.
• Юноки М., Нисидате Т., Накамура И. (октябрь 2004 г.). «ICBP90, мишень E2F-1, рекрутирует HDAC1 и связывается с метил-CpG через свой домен SRA». Онкоген. 23 (46): 7601–10. Дои:10.1038 / sj.onc.1208053. PMID  15361834.
• Abbady AQ, Bronner C, Bathami K, Muller CD, Jeanblanc M, Mathieu E, Klein JP, Candolfi E, Mousli M (август 2005 г.). «Путь TCR включает подавление гена ICBP90 через сайты связывания E2F». Биохимическая фармакология. 70 (4): 570–9. Дои:10.1016 / j.bcp.2005.05.012. PMID  15964557.
• Jeanblanc M, Mousli M, Hopfner R, Bathami K, Martinet N, Abbady AQ, Siffert JC, Mathieu E, Muller CD, Bronner C (ноябрь 2005 г.). «Ген ретинобластомы и его продукт нацелены на ICBP90: ключевой механизм перехода G1 / S во время клеточного цикла». Онкоген. 24 (49): 7337–45. Дои:10.1038 / sj.onc.1208878. PMID  16007129.
• Дженкинс Ю., Марковцов В., Ланг В., Шарма П., Пирсол Д., Уорнер Дж., Фрэнси К., Хуанг Б., Хуанг Дж., Ям Г.С., Вистан Дж. П., Пали Е., Виалард Дж., Джаникот М., Лоренс Дж. Б., Паян Д. Г., Хитоши Ю. (Декабрь 2005 г.). «Критическая роль убиквитинлигазной активности UHRF1, ядерного белка пальца кольца RING, в росте опухолевых клеток». Молекулярная биология клетки. 16 (12): 5621–9. Дои:10.1091 / mbc.E05-03-0194. ЧВК  1289407. PMID  16195352. Проверить значения даты в: | год = / | дата = несоответствие (Помогите)
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г.) ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Муто М., Фудзимори А., Неной М., Дайно К., Мацуда Й., Куроива А., Кубо Е., Канари И., Уцуно М., Цудзи Х., Укай Х., Мита К., Такахаги М., Тацуми К. (ноябрь 2006 г.). «Выделение и характеристика нового гена радиочувствительности человека, NP95». Радиационные исследования. 166 (5): 723–33. Дои:10.1667 / RR0459.1. PMID  17067204. S2CID  85418126.