USP13 - USP13

USP13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2L80, 2LBC
Идентификаторы
Псевдонимы	USP13, ISOT3, IsoT-3, убиквитинспецифическая пептидаза 13 (изопептидаза Т-3), убиквитинспецифическая пептидаза 13
Внешние идентификаторы	OMIM: 603591 MGI: 1919857 ГомолоГен: 68372 Генные карты: USP13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q26.33 Начинать 179,653,040 бп[1] Конец 179,789,401 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 A3 Начинать 32,817,546 бп[2] Конец 32,938,071 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность пептидазы цистеинового типа • привязка шаперона • связывание ионов цинка • Связывание комплекса BAT3 • связывание ионов металлов • GO: 1904454, GO: 1904455 убиквитин-подобная протеин-специфическая протеазная активность • связывание протеасомы • пептидазная активность • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-подобной протеинлигазы • гидролазная активность • связывание убиквитин-протеин-лигазы • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа Сотовый компонент • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • положительная регуляция пути ERAD • протеолиз • аутофагия • регуляция аутофагии • деубиквитинирование, связанное с белком K63 • поддержание развернутого белка, участвующего в пути ERAD • клеточная пролиферация • дифференцировка меланоцитов • деубиквитинирование белков • деубиквитинирование, связанное с белком К29 • К6-связанное деубиквитинирование • стабилизация белка Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8975	72607
Ансамбль	ENSG00000058056	ENSMUSG00000056900
UniProt	Q92995	Q5BKP2
RefSeq (мРНК)	NM_003940	NM_001013024
RefSeq (белок)	NP_003931	NP_001013042
Расположение (UCSC)	Chr 3: 179,65 - 179,79 Мб	Chr 3: 32,82 - 32,94 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 13 является фермент что у людей кодируется USP13 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000058056 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056900 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
6. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 13 USP13 (изопептидаза Т-3)».

дальнейшее чтение

• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Тиммс К.М., Ансари-Лари М.А., Моррис В. и др. (1998). «Геномная организация изопептидазы Т-3 (ISOT-3), нового члена семейства убиквитинспецифических протеаз (UBP)». Ген. 217 (1–2): 101–6. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00341-2. PMID  9841226.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H и др. (2002). «Мышечно-специфический RING finger-1 взаимодействует с тайтином для регулирования саркомерной M-линии и структуры толстых филаментов и может выполнять ядерные функции посредством взаимодействия с глюкокортикоидным модулирующим элементом, связывающим белок-1». J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. Дои:10.1083 / jcb.200108089. ЧВК  2173255. PMID  11927605.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.