USP14 - USP14

USP14
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2АЙН, 2AYO
Идентификаторы
Псевдонимы	USP14, TGT, убиквитинспецифическая пептидаза 14
Внешние идентификаторы	OMIM: 607274 MGI: 1928898 ГомолоГен: 3780 Генные карты: USP14
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 18 (человек)[1] Группа 18p11.32 Начинать 158,383 бп[1] Конец 214,629 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 A1 | 18 4,91 см Начинать 9,993,066 бп[2] Конец 10,045,119 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность пептидазы цистеинового типа • связывание протеасомы • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа • активность ингибитора эндопептидазы • гидролазная активность • тРНК гуанилилтрансферазная активность Сотовый компонент • мембрана • клеточная мембрана • синапс • поверхность клетки • протеасомный комплекс • внеклеточная экзосома • цитоплазма • цитозоль • цитоплазматический пузырек • ядро клетки Биологический процесс • регуляция катаболического процесса протеасомных белков • регуляция хемотаксиса • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеолиз • отрицательная регуляция ER-ассоциированного убиквитин-зависимого катаболического процесса белков • химическая синаптическая передача • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • деубиквитинирование белков • иммунная система • врожденная иммунная система • обработка 5'-конца тРНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9097	59025
Ансамбль	ENSG00000101557	ENSMUSG00000047879
UniProt	P54578	Q9JMA1
RefSeq (мРНК)	NM_005151 NM_001037334	NM_001038589 NM_021522 NM_001360884
RefSeq (белок)	NP_001032411 NP_005142	NP_001033678 NP_067497 NP_001347813
Расположение (UCSC)	Chr 18: 0,16 - 0,21 Мб	Chr 18: 9.99 - 10.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитин-специфическая протеаза 14 является фермент что у людей кодируется USP14 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член семейства протеаз убиквитин-специфического процессинга (UBP), который является деубиквитинирующий фермент (DUB) с доменами His и Cys. Этот белок находится в цитоплазма и раскалывает убиквитин часть из слитых с убиквитином предшественников и убиквитинилированных белков. Мыши с мутацией, которая приводит к снижению экспрессии ортолога этого белка, отстают в росте, у них развивается тяжелый тремор в возрасте 2–3 недель с последующим параличом задних конечностей и смертью в возрасте 6–10 недель. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

USP14 был показан взаимодействовать с CXCR4.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101557 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047879 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин C (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
6. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 14 USP14 (тРНК-гуанинтрансгликозилаза)».
7. Mines MA, Goodwin JS, Limbird LE, Cui FF, Fan GH (февраль 2009 г.). «Деубиквитинирование CXCR4 с помощью USP14 имеет решающее значение как для индуцированной CXCL12 деградации CXCR4, так и для хемотаксиса, но не для активации ERK». J. Biol. Chem. 284 (9): 5742–52. Дои:10.1074 / jbc.M808507200. ЧВК  2645827. PMID  19106094.

дальнейшее чтение

• Уилсон С.М., Бхаттачарья Б., Рэйчел Р.А., Коппола В., Тессаролло Л., Хаусхолдер Д. Б., Флетчер К. Ф., Миллер Р. Дж., Коупленд Н. Г., Дженкинс Н. А. (2002). «Синаптические дефекты у мышей с атаксией являются результатом мутации в Usp14, кодирующем убиквитин-специфическую протеазу». Природа Генетика. 32 (3): 420–425. Дои:10,1038 / ng1006. PMID  12368914. S2CID  23542012.
• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Deshpande KL, Seubert PH, Tillman DM, Farkas WR, Katze JR (1996). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей кроличью тРНК-гуанинтрансгликозилазу 60-килодальтонную субъединицу». Arch. Biochem. Биофизы. 326 (1): 1–7. Дои:10.1006 / abbi.1996.0039. PMID  8579355.
• Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, Zhi Y, Herterich S, Hoehn H, Gross HJ, Joenje H, Hoatlin ME, Mathew CG, Huber PA (2003). «Двухгибридный скрининг дрожжей подразумевает участие белков анемии Фанкони в регуляции транскрипции, передаче сигналов в клетках, окислительном метаболизме и клеточном транспорте». Exp. Cell Res. 289 (2): 211–21. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00261-1. PMID  14499622.
• Деннехи Б.К., Гатчес Д.Г., МакКонки Э.Х., Краутер К.С. (2004). «Инверсия, дупликация и изменения в контексте генов связаны с эволюцией хромосомы 18 человека». Геномика. 83 (3): 493–501. Дои:10.1016 / j.ygeno.2003.08.017. PMID  14962675.
• Ху М., Ли П, Сонг Л., Джеффри П.Д., Ченова Т.А., Уилкинсон К.Д., Коэн Р.Э., Ши Й. (2005). "Структура и механизмы деубиквитинирующего фермента, ассоциированного с протеасомами USP14". EMBO J. 24 (21): 3747–56. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600832. ЧВК  1276716. PMID  16211010.
• Синдзи С., Наито З., Ишивата С., Исивата Т., Танака Н., Фурукава К., Сузуки Х., Сея Т., Мацуда А., Кацута М., Тадзири Т. (2006). «Экспрессия убиквитин-специфической протеазы 14 при колоректальном раке связана с метастазами в печень и лимфатические узлы». Онкол. Представитель. 15 (3): 539–43. Дои:10.3892 / или 15.3.539. PMID  16465409.
• Crimmins S, Jin Y, Wheeler C, Huffman AK, Chapman C, Dobrunz LE, Levey A, Roth KA, Wilson JA, Wilson SM (2006). «Трансгенное спасение мышей с атаксией с нейронально-специфической экспрессией убиквитин-специфической протеазы 14». J. Neurosci. 26 (44): 11423–31. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.3600-06.2006. ЧВК  6674543. PMID  17079671.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P54578 (Убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 14) на PDBe-KB.