USP15 - USP15

USP15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1W6V, 3LMN, 3PPA, 3PV1, 3T9L, 4A3O, 4A3P, 5JJW
Идентификаторы
Псевдонимы	USP15, UNPH-2, UNPH4, убиквитинспецифическая пептидаза 15
Внешние идентификаторы	OMIM: 604731 MGI: 101857 ГомолоГен: 101542 Генные карты: USP15
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[1] Группа 10 | 10 D2 Начинать 123,105,006 бп[1] Конец 123,196,995 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гистонов, зависящее от модификации убиквитина • активность пептидазы цистеинового типа • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • идентичное связывание с белками • преобразование связывания бета-рецептора фактора роста • активность эндопептидазы цистеинового типа • Привязка SMAD • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • цитозоль • митохондрия Биологический процесс • ограниченное путями фосфорилирование белка SMAD • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • деубиквитинирование моноубиквитинированного белка • BMP сигнальный путь • протеолиз • гистон H2B консервативное деубиквитинирование лизина на С-конце • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • деубиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9958	14479
Ансамбль	ENSG00000135655	ENSMUSG00000020124
UniProt	Q9Y4E8	Q8R5H1
RefSeq (мРНК)	NM_001252078 NM_001252079 NM_006313	NM_001301628 NM_027604
RefSeq (белок)	NP_001239007 NP_001239008 NP_006304 NP_001338088 NP_001338089 NP_001338090 NP_001338091 NP_001338092 NP_001338093 NP_001338094 NP_001338095	NP_001288557 NP_081880
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 10: 123.11 - 123,2 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 15 является фермент что у людей кодируется USP15 ген.^[4][5]

Убиквитин (MIM 191339), высококонсервативный белок, участвующий в регуляции внутриклеточного распада белка, регуляции клеточного цикла и стрессовой реакции, высвобождается из деградированных белков путем разборки полиубиквитиновых цепей. Процесс разборки опосредуется убиквитин-специфическими протеазами (USP). См. Также USP1 (MIM 603478). [Поставляется OMIM]^[5]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020124 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
5. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 15 USP15».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• де Йонг Р.Н., Аб Э., Диркс Т. и др. (2006). «Структура раствора человеческого домена DUSP убиквитин-специфической протеазы 15». J. Biol. Chem. 281 (8): 5026–31. Дои:10.1074 / jbc.M510993200. PMID  16298993.
• Хетфельд Б.К., Хельфрих А., Капелари Б. и др. (2005). «Цинковый палец ассоциированного с CSN деубиквитинирующего фермента USP15 необходим для спасения E3-лигазы Rbx1». Curr. Биол. 15 (13): 1217–21. Дои:10.1016 / j.cub.2005.05.059. PMID  16005295. S2CID  15396259.
• Соболева Т.А., Янс Д.А., Джонсон-Салиба М, Бейкер Р.Т. (2005). "Ядерно-цитоплазматическое перемещение онкогенного мышиного фермента деубиквитилирования UNP / USP4". J. Biol. Chem. 280 (1): 745–52. Дои:10.1074 / jbc.M401394200. PMID  15494318.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ангелатс С., Ван XW, Джермийн Л.С. и др. (2003). «Выделение и характеристика убиквитин-специфической протеазы мыши Usp15». Мамм. Геном. 14 (1): 31–46. Дои:10.1007 / s00335-002-3035-0. PMID  12532266. S2CID  23215004.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Baker RT, Wang XW, Woollatt E, et al. (1999). «Идентификация, функциональная характеристика и хромосомная локализация USP15, новой человеческой убиквитин-специфической протеазы, связанной с онкобелком UNP, и систематическая номенклатура человеческих убиквитин-специфических протеаз». Геномика. 59 (3): 264–74. Дои:10.1006 / geno.1999.5879. PMID  10444327.
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.