USP47 - USP47

USP47
Идентификаторы
Псевдонимы	USP47, TRFP, убиквитинспецифическая пептидаза 47
Внешние идентификаторы	OMIM: 614460 MGI: 1922246 ГомолоГен: 9929 Генные карты: USP47
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.3 Начинать 11,841,423 бп[1] Конец 11,959,323 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F1 Начинать 112,023,504 бп[2] Конец 112,111,661 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание домена с повторением WD40 • пептидазная активность • гидролазная активность • активность пептидазы цистеинового типа • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 1904265 активность убиквитинилгидролазы • активность эндопептидазы цистеинового типа Сотовый компонент • цитоплазма • SCF убиквитин-лигазный комплекс • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеолиз • отрицательная регуляция апоптотического процесса • клеточный ответ на УФ • отрицательная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на повреждение ДНК • Ремонт ДНК • положительное регулирование роста клеток • деубиквитинирование моноубиквитинированного белка • базисно-эксцизионная пластика • отрицательная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла • ответ на наркотик • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • деубиквитинирование белков • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • регулирование стабильности белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55031	74996
Ансамбль	ENSG00000170242	ENSMUSG00000059263
UniProt	Q96K76	Q8BY87
RefSeq (мРНК)	NM_001282659 NM_017944 NM_001330208	NM_133758 NM_177249 NM_001357952
RefSeq (белок)	NP_001269588 NP_001317137 NP_060414 NP_001359020 NP_001359021 NP_001359022 NP_001359023 NP_001359024 NP_001359025 NP_001359026 NP_001359027 NP_001359028 NP_001359029 NP_001359030 NP_001359031 NP_001359032	NP_598519 NP_796223 NP_001344881
Расположение (UCSC)	Chr 11: 11.84 - 11.96 Мб	Chr 7: 112.02 - 112.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитинкарбоксил-терминальная гидролаза 47 является фермент что у людей кодируется USP47 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170242 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059263 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин С. (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Нат Рев Жене. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
6. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 47 USP47».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния и др. (2003). «Идентификация медиаторных субъединиц млекопитающих с подобием дрожжевых медиаторных субъединиц Srb5, Srb6, Med11 и Rox3». J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–7. Дои:10.1074 / jbc.C300054200. PMID  12584197.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния и др. (2004). "Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster интерсекс у млекопитающих является субъединицей комплекса медиатора млекопитающих". J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID  14576168.
• Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, et al. (2004). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кесада V, Диас-Пералес А., Гутьеррес-Фернандес А. и др. (2004). «Клонирование и ферментативный анализ 22 новых убиквитин-специфических протеаз человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 314 (1): 54–62. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.050. PMID  14715245.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.