UXT - UXT

UXT
Идентификаторы
Псевдонимы	UXT, ART-27, STAP1, повсеместно экспрессируемый префолдин-подобный шаперон
Внешние идентификаторы	OMIM: 300234 MGI: 1277988 ГомолоГен: 40902 Генные карты: UXT
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.23 Начните 47,651,796 бп[1] Конец 47,659,180 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A1.3 Начните 20,941,722 бп[2] Конец 20,962,017 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание микротрубочек • связывание актиновой нити • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание бета-тубулина • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • центросома • гамма-тубулин комплекс • цитоскелет • ядро клетки • центр организации микротрубочек • полюс шпинделя • нуклеоплазма • хроматин Биологический процесс • транспорт митохондрий по микротрубочкам • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • организация цитоскелета микротрубочек • транскрипция, ДНК-шаблон • центросомный цикл • апоптотический процесс • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8409	22294
Ансамбль	ENSG00000126756	ENSMUSG00000001134
UniProt	Q9UBK9	Q9WTZ0
RefSeq (мРНК)	NM_004182 NM_153477	NM_013840
RefSeq (белок)	NP_004173 NP_705582	NP_038868 NP_038868
Расположение (UCSC)	Chr X: 47.65 - 47.66 Мб	Chr X: 20.94 - 20.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок UXT (Повсеместно экспрессируемый белок транскрипта), также известный как клон 27, захваченный рецептором андрогенов (ART-27) белок - это белок что у людей кодируется UXT ген.^[5][6][7]

Функция

UXT взаимодействует с N-конец из рецептор андрогенов и играет роль в облегчении активации транскрипции, индуцированной рецептором. Также вероятно, что он участвует в онкогенезе, так как в большом количестве экспрессируется в опухолевых тканях. Этот ген является частью кластера генов на хромосоме Xp11.23. В результате альтернативного сплайсинга получается 2 варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Вариант транскрипта 2 имеет длину 575 п.н. и кодирует полипептидную последовательность длиной 157 аминокислот (~ 18 кДа). Было показано, что он взаимодействует с двумя доменами активации N-конца AR, которые оба необходимы для полной активации транскрипции.^[8] Кроме того, он в значительной степени локализован в ядре и сильно экспрессируется в эпителиальных клетках простаты человека, а также в тканях груди. ART-27, вероятно, служит для связывания AR с более крупным комплексом факторов транскрипции, о чем свидетельствует его связь с рядом белков, включая РНК pol II субъединица 5, пара префолдин β-субъединицы, и ТАТА-связывающие белки, взаимодействующие с белками.^[9] Он также демонстрирует гомологию с префолдинами, которые представляют собой белки с небольшой молекулярной массой, которые собираются в комплексы молекулярных шаперонов, чтобы влиять на укладку белка.^[8]

Показано, что ART-27 подвержен регуляции как клеточного типа, так и развития у людей. Его экспрессия связана с обилием дифференцированных эпителиальных клеток простаты и регулируется экспрессией в клетки рака простаты приводит к снижению пролиферации клеток. Важно отметить, что, поскольку пониженные уровни ART-27 постоянно обнаруживаются в клетках рака простаты, он, вероятно, играет роль в стимулировании дифференцировки эпителия через подавление пролиферативных путей.^[10] Более поздние исследования более определенно определили ART-27 как корепрессор AR.^[11] Тот факт, что усиление транскрипции гена, проявляющееся при истощении ART-27, требует присутствия AR, подразумевает, что он специфически функционирует как корепрессор этого рецептора. Несмотря на отсутствие информации о механизмах подавления, ART-27, вероятно, играет несколько ролей, ингибирующих AR-опосредованную транскрипцию. В отсутствие андрогенов ART-27 может связывать N-конец AR и тем самым предотвращать AR-зависимую активацию генов, участвующих в пролиферации клеток. Другие механизмы могут включать в себя привлечение АРТ-27 к ARE или ингибирование метилирование гистонов что в противном случае позволяет увеличить транскрипцию генов-мишеней.

Взаимодействия

UXT был показан взаимодействовать с участием Рецептор андрогенов.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126756 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001134 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Schroer A, Schneider S, Ropers H, Nothwang H (май 1999 г.). «Клонирование и характеристика UXT, нового гена Xp11 человека, который широко и широко экспрессируется в опухолевой ткани». Геномика. 56 (3): 340–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5712. PMID  10087202.
6. Чжао Х., Ван Ц., Чжан Х., Лю Ц., Ду Х, Рихтер М., Грин М.И. (ноябрь 2005 г.). «UXT - новый центросомный белок, необходимый для жизнеспособности клеток». Клетка Mol Biol. 16 (12): 5857–65. Дои:10.1091 / mbc.E05-08-0705. ЧВК  1289427. PMID  16221885.
7. «Ген Entrez: UXT-транскрипт, экспрессируемый повсеместно».
8. Маркус С.М., Танежа С.С., Логан С.К., Ли В., Ха С., Хиттельман А.Б., Рогацкий И., Гарабедян М.Дж. (февраль 2002 г.). «Идентификация и характеристика ART-27, нового коактиватора N-конца рецептора андрогенов». Мол. Биол. Ячейка. 13 (2): 670–82. Дои:10.1091 / mbc.01-10-0513. ЧВК  65658. PMID  11854421.
9. Нвачукву Дж.К., Ли В., Пинеда-Торра И., Хуанг Х.Й., Руофф Р., Шапиро Е., Танежа СС, Логан С.К., Гарабедян М.Дж. (декабрь 2007 г.). «Транскрипционная регуляция клона-27, кофактора андрогенного рецептора, уловленного рецептором андрогена». Мол. Эндокринол. 21 (12): 2864–76. Дои:10.1210 / me.2007-0094. PMID  17761951.
10. Танежа СС, Ха С., Свенсон Н.К., Торра И.П., Рим С., Уолден П.Д., Хуанг Х.Й., Шапиро Э., Гарабедян М.Дж., Логан С.К. (апрель 2004 г.). «ART-27, коактиватор рецепторов андрогенов, регулируемый при развитии простаты и раке». J. Biol. Chem. 279 (14): 13944–52. Дои:10.1074 / jbc.M306576200. PMID  14711828.
11. Нвачукву Дж. К., Мита П., Руофф Р., Ха С., Ван К., Хуанг С. Дж., Танеджа СС, Браун М., Джеральд В. Л., Гарабедян М. Дж., Логан С. К. (апрель 2009 г.). «Влияние потери клона-27, захваченного рецептором андрогена, на регулируемую андрогеном транскрипцию в клетках рака простаты». Рак Res. 69 (7): 3140–7. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-3738. ЧВК  2702238. PMID  19318562.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Вайнманн А.С., Ян П.С., Оберли М.Дж. и др. (2002). «Выделение мишеней человеческого фактора транскрипции путем сочетания иммунопреципитации хроматина и анализа микроматрицы CpG-островков». Genes Dev. 16 (2): 235–44. Дои:10.1101 / gad.943102. ЧВК  155318. PMID  11799066.
• Лю Л., МакКихан В.Л. (2002). «Анализ последовательности LRPPRC и его партнеров по взаимодействию домена SEC1 предполагает роль в организации цитоскелета, везикулярном переносе, ядерно-цитозольном перемещении и активности хромосом». Геномика. 79 (1): 124–36. Дои:10.1006 / geno.2001.6679. ЧВК  3241999. PMID  11827465.
• Thiselton DL, McDowall J, Brandau O, et al. (2002). «Интегрированная, функционально аннотированная генная карта интервала DXS8026-ELK1 на человеческом Xp11.3-Xp11.23: потенциальная горячая точка для нейрогенетических расстройств». Геномика. 79 (4): 560–72. Дои:10.1006 / geno.2002.6733. PMID  11944989.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Лю Л., Эми В., Лю Г., Маккихан В. Л. (2003). «Новый комплекс, объединяющий митохондрии и микротрубочковый цитоскелет с ремоделированием хромосом и опухолевым супрессором RASSF1, выведенный с помощью анализа гомологии in silico, клонирования взаимодействия в дрожжах и совместной локализации в культивируемых клетках». Клетка in vitro. Dev. Биол. Аним. 38 (10): 582–94. Дои:10.1290 / 1543-706X (2002) 38 <582: NCIMAT> 2.0.CO; 2. ЧВК  3225227. PMID  12762840.
• Гштайгер М., Люк Б., Гесс Д. и др. (2003). «Контроль программ транскрипции, чувствительных к питательным веществам, с помощью нетрадиционного префолдинового URI». Наука. 302 (5648): 1208–12. Дои:10.1126 / science.1088401. PMID  14615539.
• Rayala HJ, Kendirgi F, Barry DM, et al. (2004). «Фактор экспорта мРНК Gle1 человека взаимодействует с белком комплекса ядерных пор Nup155». Мол. Cell. Протеомика. 3 (2): 145–55. Дои:10.1074 / mcp.M300106-MCP200. PMID  14645504.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Мосс Т.Н., Во А., Маккихан В.Л., Лю Л. (2007). «UXT (повсеместно выраженный транскрипт) вызывает агрегацию митохондрий». Клетка in vitro. Dev. Биол. Аним. 43 (3–4): 139–46. Дои:10.1007 / s11626-007-9016-6. ЧВК  3229262. PMID  17554592.
• Sun S, Tang Y, Lou X и ​​др. (2007). «UXT - новый и важный кофактор в транскрипционной энхансоме NF-kappaB». J. Cell Biol. 178 (2): 231–44. Дои:10.1083 / jcb.200611081. ЧВК  2064443. PMID  17620405.