VCPIP1 - VCPIP1

VCPIP1
Идентификаторы
Псевдонимы	VCPIP1, DUBA3, VCIP135, валозин-содержащий белок (p97) / p47 комплекс взаимодействующий белок 1, валозин-содержащий белок взаимодействующий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611745 MGI: 1917925 ГомолоГен: 11814 Генные карты: VCPIP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q13.1 Начните 66,628,487 бп[1] Конец 66,667,231 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 A2 Начните 9,718,622 бп[2] Конец 9,748,382 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность • пептидазная активность • активность пептидазы цистеинового типа • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • Стек Гольджи • аппарат Гольджи • эндоплазматический ретикулум • просвет эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • слияние мембран эндоплазматического ретикулума • деубиквитинирование белка K48 • Организация Гольджи • убиквитинирование белков • деубиквитинирование, связанное с белком K11 • протеолиз • Повторная сборка Гольджи • GO: 0007067 митотический клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	80124	70675
Ансамбль	ENSG00000175073	ENSMUSG00000045210
UniProt	Q96JH7	Q8CDG3
RefSeq (мРНК)	NM_025054	NM_173443
RefSeq (белок)	NP_079330	NP_775619
Расположение (UCSC)	Chr 8: 66.63 - 66.67 Мб	Chr 1: 9.72 - 9.75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Деубиквитинирующий белок VCIP135 это белок что у людей кодируется VCPIP1 ген.^[5][6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175073 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045210 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О. (апрель 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 8 (2): 85–95. Дои:10.1093 / днарес / 8.2.85. PMID  11347906.
6. Ficarro S, Chertihin O, Westbrook VA, White F, Jayes F, Kalab P, Marto JA, Shabanowitz J, Herr JC, Hunt DF, Visconti PE (март 2003 г.). «Фосфопротеомный анализ конденсированных сперматозоидов человека. Доказательства фосфорилирования тирозина белка 3, заякоренного киназой, и белка, содержащего валозин / p97, во время каппитации». Журнал биологической химии. 278 (13): 11579–89. Дои:10.1074 / jbc.M202325200. PMID  12509440.
7. «Ген Entrez: белок, содержащий валозин VCPIP1 (p97) / комплекс белка 1, взаимодействующий с p47».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Uchiyama K, Jokitalo E, Kano F, Murata M, Zhang X, Canas B, Newman R, Rabouille C, Pappin D, Freemont P, Kondo H (декабрь 2002 г.). «VCIP135, новый важный фактор для p97 / p47-опосредованного слияния мембран, необходим для сборки Гольджи и ER in vivo». Журнал клеточной биологии. 159 (5): 855–66. Дои:10.1083 / jcb.200208112. ЧВК  2173386. PMID  12473691.
• Ван И, Сато А., Уоррен Г., Мейер Х. Х., Ван И (март 2004 г.). «VCIP135 действует как деубиквитинирующий фермент во время p97-p47-опосредованной повторной сборки митотических фрагментов Гольджи». Журнал клеточной биологии. 164 (7): 973–8. Дои:10.1083 / jcb.200401010. ЧВК  2172062. PMID  15037600.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.