VPS24 - VPS24

CHMP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2XZE, 3FRT, 3FRV, 2ГД5
Идентификаторы
Псевдонимы	CHMP3, NEDF, VPS24, CGI-149, заряженный мультивезикулярный белок 3 тела
Внешние идентификаторы	OMIM: 610052 MGI: 1913950 ГомолоГен: 6368 Генные карты: CHMP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п11.2 Начните 86,503,430 бп[1] Конец 86,563,479 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 C1 | 6 32,17 см Начните 71,543,797 бп[2] Конец 71,582,609 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилхолина • активность гомодимеризации белков • связывание убиквитин-специфической протеазы • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • клеточная мембрана • эндосома • мембрана поздней эндосомы • внеклеточная экзосома • ESCRT III комплекс • цитозоль • внутриклеточный • поздняя эндосома • цитоплазматический пузырек • мультивезикулярное тело Биологический процесс • GO: 0000046 Созревание аутофагосомы • GO: 0019067 жизненный цикл вируса • полимеризация белков • мультивезикулярная сборка тела • клеточный цикл • деление клеток • регуляция сборки митотического веретена • эндосомный транспорт • регуляция удвоения центросом • апоптотический процесс • гетероолигомеризация белков • вакуолярный транспорт • разделение клеток после цитокинеза • транспорт белка • ядро организации • конгресс митотической метафазной пластинки • мультивезикулярный путь сортировки тела • регуляция экзосомальной секреции • макроавтофагия • мультивезикулярное слияние лизосом и тельца • регуляция транспорта от ранних эндосом к поздним • транспорт • почкование вируса через комплекс ESCRT хозяина • транспорт эндосом через мультивезикулярный путь сортировки тел • поздний перенос эндосомы в вакуоль • опущение средней части тела Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51652	66700
Ансамбль	ENSG00000115561	ENSMUSG00000053119
UniProt	Q9Y3E7	Q9CQ10
RefSeq (мРНК)	NM_001005753 NM_001193517 NM_016079	NM_025783 NM_001355674 NM_001355675 NM_001361405
RefSeq (белок)	NP_001005753 NP_001180446 NP_057163	NP_080059 NP_001342603 NP_001342604 NP_001348334
Расположение (UCSC)	Chr 2: 86,5 - 86,56 Мб	Chr 6: 71,54 - 71,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Заряженный мультивезикулярный белок тела 3 это белок что у людей кодируется VPS24 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует белок, который действует при сортировке трансмембранных белков в лизосомы / вакуоли через мультивезикулярный путь тельца (MVB). Этот белок, наряду с другими растворимыми белками, содержащими спиральную спираль, образует часть белкового комплекса ESCRT-III, который связывается с эндосомальной мембраной и привлекает дополнительные кофакторы для сортировки белков в MVB. Этот белок может также коиммунопреципитировать с членом суперсемейства IFG-связывающих белков. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

VPS24 был показан взаимодействовать с участием IGFBP7.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115561 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000053119 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wilson EM, Oh Y, Hwa V, Rosenfeld RG (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие IGF-связывающего белка, родственного белку 1, с новым белком, фактором нейроэндокринной дифференцировки, приводит к нейроэндокринной дифференцировке клеток рака простаты». J Clin Endocrinol Metab. 86 (9): 4504–11. Дои:10.1210 / jc.86.9.4504. PMID  11549700.
6. Уитли П., Ривз Б.Дж., Хашимото М., Райли А.М., Поттер Б.В., Холман Г.Д. (сентябрь 2003 г.). «Идентификация Vps24p млекопитающих как эффектора фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфат-зависимой компартментализации эндосом». J Biol Chem. 278 (40): 38786–95. Дои:10.1074 / jbc.M306864200. PMID  12878588.
7. «Ген Entrez: VPS24 вакуолярный гомолог 24 сортировки белков (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Лай Ч., Чжоу Ц.Ю., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (2000). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Бабст М., Кацманн Д.Д., Эстепа-Сабаль Э.Дж., Меерлоо Т., Эмр С.Д. (2002). «Escrt-III: связанный с эндосомами гетероолигомерный белковый комплекс, необходимый для сортировки mvb». Dev. Ячейка. 3 (2): 271–82. Дои:10.1016 / S1534-5807 (02) 00220-4. PMID  12194857.
• Су З.З., Кан Д.К., Чен Ю., Пекарская О., Чао В., Вольский Д. Д., Фишер ПБ (2003). «Идентификация генных продуктов, подавленных инфекцией вируса иммунодефицита человека типа 1 или воздействием gp120 на первичные человеческие астроциты путем быстрой гибридизации с вычитанием». J. Neurovirol. 9 (3): 372–89. Дои:10.1080/13550280390201263. PMID  12775420. S2CID  12205568.
• Strack B, Calistri A, Craig S, Popova E, Göttlinger HG (2003). «AIP1 / ALIX является партнером по связыванию p6 ВИЧ-1 и p9 EIAV, функционирующих в процессе отпочкования вируса». Ячейка. 114 (6): 689–99. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID  14505569. S2CID  10733770.
• фон Шведлер Великобритания, Стучелл М., Мюллер Б., Уорд Д.М., Чунг Х.Й., Морита Э., Ван Х.Э., Дэвис Т., Хе Г.П., Симбора Д.М., Скотт А., Краусслих Г.Г., Каплан Дж., Морхам С.Г., Сандквист В.И. (2003). «Белковая сеть почкования ВИЧ». Ячейка. 114 (6): 701–13. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID  14505570. S2CID  16894972.
• Мартин-Серрано Дж., Яровой А., Перес-Кабальеро Д., Bieniasz PD, Яравой А (2003). «Дивергентные ретровирусные домены с поздним почкованием привлекают факторы сортировки вакуолярных белков с помощью альтернативных адаптерных белков». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (21): 12414–9. Bibcode:2003ПНАС..10012414М. Дои:10.1073 / pnas.2133846100. ЧВК  218772. PMID  14519844.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Лин И, Кимплер Л.А., Нейсмит ТВ, Лауэр Дж. М., Хэнсон П. И. (2005). «Взаимодействие эндосомального сортировочного комплекса млекопитающих, необходимого для транспорта (ESCRT) III белка hSnf7-1, с самим собой, мембранами и AAA + ATPase SKD1». J. Biol. Chem. 280 (13): 12799–809. Дои:10.1074 / jbc.M413968200. PMID  15632132.
• Ян К., Хант П.Р., Фрелин Л., Вида Т.А., Певснер Дж., Бин А.Дж. (2005). «mVps24p функционирует в сортировке / доставке рецептора EGF из ранней эндосомы». Exp. Cell Res. 304 (1): 265–73. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.11.003. PMID  15707591.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Уокер Г.Е., Антонионо Р.Дж., Росс Г.Дж., Пейсли Т.Е., Ой Y (2006). «Нейроэндокриноподобная дифференцировка немелкоклеточной карциномы легких: регуляция с помощью цАМФ и взаимодействия mac25 / IGFBP-rP1 и 25.1». Онкоген. 25 (13): 1943–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1209213. PMID  16302002.
• Bache KG, Stuffers S, Malerød L, Slagsvold T, Raiborg C, Lechardeur D, Wälchli S, Lukacs GL, Brech A, Stenmark H (2006). «Субъединица ESCRT-III hVps24 необходима для деградации, но не для подавления рецептора эпидермального фактора роста». Мол. Биол. Ячейка. 17 (6): 2513–23. Дои:10.1091 / mbc.E05-10-0915. ЧВК  1474783. PMID  16554368.
• Цанг Х. Т., Коннелл Дж. В., Браун С. Е., Томпсон А., Рид Е., Сандерсон С. М. (2006). «Систематический анализ человеческих взаимодействий с белками CHMP: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с множеством компонентов человеческого комплекса ESCRT III». Геномика. 88 (3): 333–46. Дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID  16730941.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Zamborlini A, Usami Y, Radoshitzky SR, Popova E, Palu G, Göttlinger H (2007). «Освобождение от аутоингибирования превращает компоненты ESCRT-III в мощные ингибиторы почкования ВИЧ-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (50): 19140–5. Дои:10.1073 / pnas.0603788103. ЧВК  1748189. PMID  17146056.