Victivallis vadensis - Victivallis vadensis
| Victivallis vadensis | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Тип: | Lentisphaerae |
| Учебный класс: | Лентисфаерия |
| Заказ: | Victivallales |
| Семья: | Victivallaceae |
| Род: | Victivallis |
| Разновидность: | vadensis |
| Биномиальное имя | |
| Victivallis vadensis | |
Victivallis vadensis это Грамотрицательный кокковидные бактерии, обнаруженные в пищеварительном тракте человека.[1] Его диаметр составляет примерно 0,5–1,3 микрометра, он неподвижен, хемоорганотрофен и не образует спор.[2] Victivallis vadensis является строго анаэробным, как и 90 процентов бактерий в желудочно-кишечной системе человека.[3]
История
Victivallis vadensis изначально был известен как штамм CelloТ, так как он может использовать целлобиозу в качестве источника углерода (Прокариоты), но был переименован в область в Нидерланды известная как продовольственная долина, недалеко от ученых Университет Вагенингена, который первым идентифицировал организм. Victus по-латыни означает «еда», vallis по-латыни означает «долина»; «Пищевая долина» относится к Вагенингену «Food Valley »В Нидерландах, где наука о продуктах питания является одним из нескольких популярных направлений исследований. Vada of vadensis относится к Вагенингену.[2]
Разнообразие
Victavallis vadensis является факультативным анаэробом, как и большинство кишечных микробов. На сегодняшний день он был получен только из человеческих фекалий, и поэтому известно, что он существует только в желудочно-кишечном тракте человека.[2] и в настоящее время является единственным организмом, принадлежащим отряду Victivallales и род Victivallis.[4] Посредством секвенирования 16S рРНК было установлено, что штамм CelloТ образует свой кластер в дивизионе Веррумикробия, и были обнаружены два родственных, но некультивируемых клона, которые имеют 94% сходства последовательностей гена 16S рРНК.[2]
В Victavallis vadensis геном содержит 4577 257 оснований с 3 541 последовательностью, кодирующей белок, из которых 2031 являются функциональными. Основания G-C составляют 59,5% ДНК.[1] Эти бактерии наиболее тесно связаны с Lentisphaera araneosa с 84,4% той же 16S рРНК.[4] Эти два организма также различаются в зависимости от среды, в которой они обитают. Lentisphaera spp. находятся в морской воде, а V. vadensis - в пищеварительной системе человека.[5]
Посмотреть последние Victavallis vadensis данные генетического секвенирования здесь:Запись GenBank ABDE02000001.1Запись GenBank ABDE02000027.1
Бактерии -> Lentisphaerae -> который включает Oligosphaera ethanolica, Lentisphaera araneosa, и Victivallis vadensis [5]
| |||||||||||||
Биохимия
Поскольку более половины микробиома кишечника человека еще не культивировано, недавно обнаруженные виды, такие как Victivallis vadensis требуют всестороннего тестирования культуры, чтобы определить, в каких ситуациях они лучше всего подходят. Этот микроб, взятый из образца фекалий человека, впервые был выращен в Нидерландах при оптимальной температуре 37 градусов Цельсия и 6,5 pH. Исследователи обнаружили, что он лучше всего растет в жидком или мягком агаре с одним из следующих сахаров: целлобиоза, фруктоза, галактоза, глюкоза, лактоза, лактулоза, мальтоза, мальтотриоза, маннит, мелибиоза, мио-инозит, рафтилоза, рамноза, рибоза, сахароза и цилоза », [2] который он использует ферментативно.[4] Формирование бактериальных колоний в этих условиях занимает около 10 дней.[2]
Victivallis vadensis образует слизистый слой вне его клеточная мембрана,[2] который при микроскопическом исследовании выглядит как гало.[4] Исследователи также могли видеть сборки с плотными группами электронов внутри клеток, которые, по их мнению, являются осадками белков или используются для хранения клеток.[2] Колонии линзовидные,[4] бежевый и блестящий.[2] Умеет культивировать синтрофически с Methanospirillum hungatei, где он производит метан из глюкозы в соответствующих средах. При попытке изолировать в культуре, стрептомицин и полимиксин B могут быть добавлены в среду для предотвращения роста загрязняющих агентов; следовательно, Victivallis vadensis устойчив к стрептомицину и полимиксину B.[4]
Рекомендации
- ^ а б c Ван Пассель, Марк (11 марта 2011 г.). «Последовательность генома Victivallis vadensis ATCC BAA-548, анаэробной бактерии из Phylum Lentisphaerae, выделенной из желудочно-кишечного тракта человека». Журнал бактериологии. 193 (9): 2373–2374. Дои:10.1128 / JB.00271-11. ЧВК 3133096. PMID 21398537.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k Зетендал, Эрвин Г. (2003). "Victivallis vadensis gen. Nov., Sp. Nov., Анаэроб, ферментирующий сахар, из человеческих фекалий". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 53 (1): 211–215. Дои:10.1099 / ijs.0.02362-0. PMID 12656175.
- ^ а б Гуарнер, Франциско (8 февраля 2003 г.). «Флора кишечника в здоровье и болезнях». Ланцет. 361 (9356): 512–519. Дои:10.1016 / S0140-6736 (03) 12489-0. PMID 12583961. Получено 11 ноя 2014.
- ^ а б c d е ж грамм час я Чо, Чан-Чхон (2011). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. С. 13, 785–793. ISBN 978-0-387-68572-4.
- ^ а б c Чо, Чан-Чхон (2004). «Lentisphaera araneosa gen. Nov., Sp. Nov, прозрачный экзополимер, продуцирующий морскую бактерию, и описание нового бактериального типа, Lentisphaerae». Экологическая микробиология. 6 (6): 611–621. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.
