WBP4 - WBP4

WBP4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DK1, 2JXW
Идентификаторы
Псевдонимы	WBP4, FBP21, WW домен связывающий белок 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 604981 MGI: 109568 ГомолоГен: 38287 Генные карты: WBP4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q14.11 Начинать 41,061,509 бп[1] Конец 41,084,006 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 D3 Начинать 79,459,937 бп[2] Конец 79,481,520 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • связывание богатой пролином области • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • ядерное пятнышко • сплайсосомальный комплекс • нуклеоплазма • ядро клетки • Предкаталитическая сплайсосома типа U2 Биологический процесс • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11193	22380
Ансамбль	ENSG00000120688	ENSMUSG00000022023
UniProt	O75554	Q61048
RefSeq (мРНК)	NM_007187	NM_018765
RefSeq (белок)	NP_009118	NP_061235
Расположение (UCSC)	Chr 13: 41.06 - 41.08 Мб	Chr 14: 79.46 - 79.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

WW домен-связывающий белок 4 это белок что у людей кодируется WBP4 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует WW домен -содержащий связывающий белок 4. WW-домен представляет собой небольшую и компактную глобулярную структуру, которая взаимодействует с богатыми пролином лиганды. Этот кодируемый белок является общим сплайсосомный белок, который может играть роль в межинтронном соединении U1 и U2 snRNPs в сплайсосомальном комплексе A.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120688 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022023 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бедфорд М. Т., Рид Р., Ледер П. (сентябрь 1998 г.). «Взаимодействия, опосредованные доменом WW, выявляют белок, связанный со сплайсосомами, который связывает третий класс мотивов, богатых пролином: пролинглицин и мотив, богатый метионином». Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (18): 10602–7. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10602. ЧВК  27941. PMID  9724750.
6. «Ген Entrez: WBP4 WW домен, связывающий белок 4 (формин-связывающий белок 21)».

дальнейшее чтение

• Такахара Т., Тасич Б., Маниатис Т. и др. (2005). «Задержка синтеза 3'-сайта сплайсинга способствует транс-сплайсингу предыдущего 5'-сайта сплайсинга». Мол. Клетка. 18 (2): 245–51. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.03.018. PMID  15837427.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК  2665288. PMID  15057823.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бедфорд М.Т., Франкель А., Яффе МБ и др. (2000). «Метилирование аргинина ингибирует связывание богатых пролином лигандов с доменами с гомологией Src 3, но не с WW». J. Biol. Chem. 275 (21): 16030–6. Дои:10.1074 / jbc.M909368199. PMID  10748127.
• Чан, округ Колумбия, Бедфорд М.Т., Ледер П. (1996). «Формин-связывающие белки несут домены WWP / WW, которые связывают богатые пролином пептиды и функционально напоминают домены SH3». EMBO J. 15 (5): 1045–54. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00442.x. ЧВК  450002. PMID  8605874.