WDR57 - WDR57

SNRNP40
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRNP40, 40K, HPRP8BP, PRP8BP, PRPF8BP, SPF38, WDR57, субъединица 40 U5 малого ядерного рибонуклеопротеина
Внешние идентификаторы	OMIM: 607797 MGI: 1913835 ГомолоГен: 3538 Генные карты: SNRNP40
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п35.2 Начинать 31,259,568 бп[1] Конец 31,296,788 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • малый ядрышковый рибонуклеопротеидный комплекс • U5 snRNP • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • прекаталитическая сплайсосома • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • ядерное пятнышко • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2 Биологический процесс • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Обработка РНК • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9410	66585
Ансамбль	ENSG00000060688	ENSMUSG00000074088
UniProt	Q96DI7	Q6PE01
RefSeq (мРНК)	NM_004814	NM_025645
RefSeq (белок)	NP_004805	NP_079921
Расположение (UCSC)	Chr 1: 31.26 - 31.3 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Повторяющийся домен WD 57 (специфичный для U5 snRNP), также известный как WDR57, это ген обнаружены во многих организмах, включая, помимо прочего, Homo sapiens, Gallus gallus, Пан троглодиты, Канус фамильяр, Bos taurus, Mus musculus, и Раттус норвегикус.^[4]

Функция

Этот ген кодирует компонент частицы малого ядерного рибонуклеопротеина (snRNP) U5. U5 snRNP является частью сплайсосомы, мультибелкового комплекса, который катализирует удаление интронов из пре-мессенджерных РНК.^[4]

Взаимодействия

WDR57 показал себя взаимодействовать с PRPF8^[5][6] и EFTUD2.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000060688 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ген Entrez: домен 57 повтора WD WDR57 (специфичный для snRNP U5)».
5. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
6. Ахсель Т., Аренс К., Брамс Х, Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный комплекс без РНК с несколькими U5-специфическими белками, включая РНК-развиндазу, гомолог фактора удлинения рибосом EF-2 и новый белок WD-40». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6756–66. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6756. ЧВК  109259. PMID  9774689.

дальнейшее чтение

• Тернер И.А., Норман К.М., Черчер М.Дж., Ньюман А.Дж. (декабрь 2004 г.). «Роль мяРНП U5 в сплайсосомной динамике и катализе». Сделки Биохимического Общества. 32 (Pt 6): 928–31. Дои:10.1042 / BST0320928. PMID  15506927.
• Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природа Генетика. 20 (1): 46–50. Дои:10.1038/1700. PMID  9731529.
• Ахсель Т., Аренс К., Брамс Х, Тейгелькамп С., Люрманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный комплекс без РНК с несколькими U5-специфическими белками, включая РНК-развиндазу, гомолог фактора удлинения рибосом EF-2 и новый белок WD-40». Молекулярная и клеточная биология. 18 (11): 6756–66. Дои:10.1128 / mcb.18.11.6756. ЧВК  109259. PMID  9774689.
• Макаров Е.М., Макарова О.В., Ахсель Т., Люрманн Р. (май 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с snRNP U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Журнал молекулярной биологии. 298 (4): 567–75. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3685. PMID  10788320.
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Джорданова А., Ироби Дж., Томас Ф.П., Ван Дейк П., Меершерт К., Девил М., Дирик И., Якобс А., Де Вриндт Э, Гергуельчева В., Рао К. В., Турнев И., Гондим Ф.А., Д'Хуг М., Ван Гервен В., Каллертс П., Ван ден Бош Л., Тиммерманс Дж. П., Робберехт В., Геттеманс Дж., Тевелейн Дж. М., Де Йонге П., Кременски И., Тиммерман В. (февраль 2006 г.). «Нарушение функции и аксонального распределения мутантной тирозил-тРНК синтетазы при доминантной промежуточной нейропатии Шарко-Мари-Тута». Природа Генетика. 38 (2): 197–202. Дои:10,1038 / ng1727. PMID  16429158.
• Лю С., Раухут Р., Форнлохер Х. П., Люрманн Р. (июль 2006 г.). «Сеть белок-белковых взаимодействий в человеческом три-мяРНП U4 / U6.U5». РНК. 12 (7): 1418–30. Дои:10.1261 / rna.55406. ЧВК  1484429. PMID  16723661.
• Хига Л.А., Ву М., Йе Т, Кобаяши Р., Сун Х., Чжан Х. (ноябрь 2006 г.). «Убиквитинлигаза CUL4-DDB1 взаимодействует с множеством белков WD40-повторов и регулирует метилирование гистонов». Природа клеточной биологии. 8 (11): 1277–83. Дои:10.1038 / ncb1490. PMID  17041588.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.