WFDC5 - WFDC5

WFDC5
Идентификаторы
Псевдонимы	WFDC5, PRG5, WAP1, dJ211D12.5, четырехдисульфидный основной домен WAP 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 605161 MGI: 2384800 ГомолоГен: 17072 Генные карты: WFDC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.12 Начинать 45,109,452 бп[1] Конец 45,115,172 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H3 Начинать 164,176,327 бп[2] Конец 164,182,742 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • активность ингибитора эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • внеклеточная область Биологический процесс • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • отрицательная регуляция активности пептидазы Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	149708	209232
Ансамбль	ENSG00000175121	ENSMUSG00000040154
UniProt	Q8TCV5	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_145652	NM_145369
RefSeq (белок)	NP_663627	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 20: 45.11 - 45.12 Мб	Chr 2: 164.18 - 164.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

WAP, четырехдисульфидный центральный домен, белок 5 это белок что у людей кодируется WFDC5 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства доменов с четырьмя дисульфидными ядрами (WFDC) типа WAP. Большинство белков WFDC содержат только один домен WFDC, и этот кодируемый белок содержит два домена WFDC. Домен WFDC, или мотив сигнатуры WAP, содержит восемь цистеинов, образующих четыре дисульфидные связи в ядре белка, и функционирует как ингибитор протеазы. Большинство членов гена WFDC локализованы на хромосоме 20q12-q13 в двух кластерах: центромерном и теломерном. Этот ген принадлежит к центромерному кластеру.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175121 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040154 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Клаусс А., Лилья Х., Лундвалл А. (ноябрь 2002 г.). «Локус на хромосоме 20 человека содержит несколько генов, экспрессирующих домены ингибитора протеазы, гомологичные кислому белку сыворотки». Biochem J. 368 (Pt 1): 233–42. Дои:10.1042 / BJ20020869. ЧВК  1222987. PMID  12206714.
6. Ранганатан С., Симпсон К.Дж., Шоу, округ Колумбия, Николас К.Р. (март 2000 г.). «Семейство кислых белков сыворотки: новый фирменный мотив и трехмерная структура путем сравнительного моделирования». Модель графа J Mol. 17 (2): 106–13, 134–6. Дои:10.1016 / S1093-3263 (99) 00023-6. PMID  10680116.
7. "Entrez Gene: WFDC5 WAP четырехдисульфидный основной домен 5".

дальнейшее чтение

• Хорикоши Н., Конг Дж., Клей Н., Шенк Т. (1999). «Выделение дифференциально экспрессируемых кДНК из p53-зависимых апоптотических клеток: активация человеческого гомолога гена пероксидазина дрозофилы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 261 (3): 864–9. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1123. PMID  10441517.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Нукуми Н., Секи М., Ивамори Т. и др. (2006). «Анализ промотора гена мутировавшего кислого белка сыворотки человека (WAP)». J. Reprod. Dev. 52 (2): 315–20. Дои:10.1262 / jrd.17068. PMID  16462094.
• Мухопадхьяй С.С., Розен Дж. М. (2007). «С-концевой домен изоформы ядерного фактора I-B2 гликозилирован и трансактивирует ген WAP в клетках JEG-3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 358 (3): 770–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.04.185. ЧВК  1942171. PMID  17511965.