WIPI2 - WIPI2 - Wikipedia

WIPI2
Идентификаторы
Псевдонимы	WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, домен повтора WD, фосфоинозитид, взаимодействующий 2, IDDSSA
Внешние идентификаторы	OMIM: 609225 MGI: 1923831 ГомолоГен: 90887 Генные карты: WIPI2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p22.1 Начинать 5,190,196 бп[1] Конец 5,233,840 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G2 Начинать 142,627,698 бп[2] Конец 142,670,588 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатидилинозитол-5-фосфата • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозитол-3-фосфата • связывание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата • связывание липидов Сотовый компонент • аутофагосома • цитозоль • мембрана преаутофагосомальной структуры • мембрана • преаутофагосомная структура • внешний компонент мембраны • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • аутофагия • GO: 0000046 Созревание аутофагосомы • макроавтофагия • сборка аутофагосом • митофагия • липидирование белков • аутофагия ядра • локализация белка в преаутофагосомной структуре • липидирование белков, участвующих в сборке аутофагосом • ксенофагия • клеточный ответ на голодание Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26100	74781
Ансамбль	ENSG00000157954	ENSMUSG00000029578
UniProt	Q9Y4P8	Q80W47
RefSeq (мРНК)	NM_001033518 NM_001033519 NM_001033520 NM_001278299 NM_015610 NM_016003	NM_178398
RefSeq (белок)	NP_001028690 NP_001028691 NP_001028692 NP_001265228 NP_056425 NP_057087 NP_056425.1	NP_848485
Расположение (UCSC)	Chr 7: 5.19 - 5.23 Мб	Chr 5: 142,63 - 142,67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 2, взаимодействующий с фосфоинозитидом с повторяющимся доменом WD это белок что у людей кодируется WIPI2 ген.^[5][6]

Функция

WD40 повторить белки являются ключевыми компонентами многих важных биологических функций. Они регулируют сборку мультибелковых комплексов, представляя платформу бета-пропеллера для одновременных и обратимых белок-белковых взаимодействий. Члены подсемейства WIPI белков с повторами WD40, такие как WIPI2, имеют структуру с 7 лопастями и содержат консервативный мотив для взаимодействия с фосфолипидами.^[5][6]

WIPI2 является гомологом Atg18 у млекопитающих, а не Atg21, вместе с близкородственным белком, WIPI1. МРНК WIPI2 легко обнаруживается в нескольких широко используемых лабораторных клеточных линиях (HEK293A, HeLa, A431) и нескольких линиях раковых клеток, в то время как экспрессия WIPI1 ограничена раковыми клетками [необходима цитата] (но также обнаруживается во многих тканях человека).

Белки Atg регулируют аутофагия, который является лизосомный путь деградации, необходимый для поддержания здоровья клеток, выживания в периоды дефицита питательных веществ, а также играет роль в развитии рака, нейродегенерации и иммунных ответах на широкий спектр патогенов.^[7] WIPI2 рекрутируется на раннем этапе в формирующуюся аутофагосому вместе с DFCP-1, ULK-1 и Atg16, где он положительно регулирует липидирование Atg8 (LC3). Это не относится к WIPI1.

Смотрите также

• Семейство белков WIPI

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157954 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029578 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пройкас-Сезанн Т., Уодделл С., Гаугель А., Фрике Т., Лупас А., Нордхайм А. (декабрь 2004 г.). «WIPI-1alpha (WIPI49), член нового семейства белков WIPI с 7 лопастями, аномально экспрессируется при раке человека и связан с аутофагией, вызванной голоданием». Онкоген. 23 (58): 9314–25. Дои:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID  15602573.
6. «Ген Entrez: домен повтора WIPI2 WD, фосфоинозитид взаимодействует 2».
7. Орси А., Полсон Х. Э., Туз С. А. (декабрь 2009 г.). «События оборота мембран, которые участвуют в аутофагии». Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. Дои:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID  20036114.

* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). «Atg18 млекопитающих (WIPI2) локализуется в фагофорах, закрепленных на омегасомах, и положительно регулирует липидирование LC3». Аутофагия. 6 (4): 506–22. Дои:10.4161 / авто.6.4.11863. PMID  20505359.

дальнейшее чтение

• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• <Добавьте первых отсутствующих авторов для заполнения метаданных.> (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.