WTAP (ген) - WTAP (gene)

WTAP
Идентификаторы
Псевдонимы	WTAP, Mum2, белок, связанный с опухолью Вильмса 1, белок, связанный с WT1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605442 MGI: 1926395 ГомолоГен: 68422 Генные карты: WTAP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q25.3 Начинать 159,725,585 бп[1] Конец 159,756,319 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 A1 Начинать 12,966,796 бп[2] Конец 12,994,169 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • не мембрана • ядро клетки • РНК N6-метиладенозинметилтрансферазный комплекс • ядерное пятнышко • нуклеоплазма • цитоплазма Биологический процесс • Сплайсинг РНК • клеточный цикл • обработка мРНК • метилирование мРНК • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • развитие многоклеточного организма • Метаболический процесс РНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9589	60532
Ансамбль	ENSG00000146457	ENSMUSG00000060475
UniProt	Q15007	Q9ER69
RefSeq (мРНК)	NM_001270531 NM_001270532 NM_001270533 NM_004906 NM_152857 NM_152858	NM_001113532 NM_001113533 NM_175394 NM_001379058
RefSeq (белок)	NP_001257460 NP_001257461 NP_001257462 NP_004897 NP_690596 NP_690597	NP_001107004 NP_001107005 NP_780603 NP_001365987
Расположение (UCSC)	Chr 6: 159,73 - 159,76 Мб	Chr 17: 12.97 - 12.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регулятор пре-мРНК-сплайсинга WTAP это белок что у людей кодируется WTAP ген.^[5][6][7]

Ген-супрессор опухоли Вильмса WT1, по-видимому, играет роль как в транскрипционной, так и в посттранскрипционной регуляции определенных клеточных генов. Этот ген кодирует белок, ассоциированный с WT1, который является повсеместно экспрессируемым ядерным белком. Подобно белку WT1, этот белок локализован по всей нуклеоплазме, а также в крапинках и частично колокализуется с факторами сплайсинга. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к трем вариантам транскрипта, два из которых кодируют одну и ту же изоформу.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что WTAP (ген) взаимодействовать с WT1.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000146457 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060475 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси И., Котани Н. и др. (Июль 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID  7788527.
6. Литтл Н. А., Хасти Н. Д., Дэвис Р. К. (октябрь 2000 г.). «Идентификация WTAP, нового белка, связывающего опухоль Вильмса 1». Хум Мол Генет. 9 (15): 2231–9. Дои:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018914. PMID  11001926.
7. «Ген Entrez: белок, связанный с опухолью 1 WTAP Wilms».

дальнейшее чтение

• Small TW, Bolender Z, Bueno C и др. (2007). «Белок, связывающий опухоль Вильмса 1, регулирует пролиферацию гладкомышечных клеток сосудов». Circ. Res. 99 (12): 1338–46. Дои:10.1161 / 01.RES.0000252289.79841.d3. PMID  17095724.
• Хориучи К., Уметани М., Минами Т. и др. (2007). «Белок Вильмса, связывающий опухоль 1, регулирует переход G2 / M посредством стабилизации мРНК циклина A2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (46): 17278–83. Дои:10.1073 / pnas.0608357103. ЧВК  1634838. PMID  17088532.
• Rong Y, Cheng L, Ning H и др. (2007). «Опухоль Вильмса 1 и сигнальные преобразователи и активаторы транскрипции 3 синергетически способствуют пролиферации клеток: возможный механизм спорадической опухоли Вильмса». Рак Res. 66 (16): 8049–57. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-1172. PMID  16912181.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Обусе С., Ян Х., Нозаки Н. и др. (2004). «Протеомический анализ центромерного комплекса из интерфазных клеток HeLa: поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок 1 (DDB-1) является компонентом CEN-комплекса, в то время как BMI-1 временно совмещен с центромерной областью в интерфазе». Гены Клетки. 9 (2): 105–20. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID  15009096. S2CID  21813024.
• Утч Б., Кая А., Озбурун А. и др. (2004). «Исключение WTAP и HOXA13 в качестве генов-кандидатов для изолированной гипоспадии». Сканд. J. Urol. Нефрол. 37 (6): 498–501. Дои:10.1080/00365590310014517. PMID  14675924. S2CID  34145137.
• Томсиг Дж. Л., Снайдер С. Л., Creutz CE (2003). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спиралевидного копин-связывающего мотива». J. Biol. Chem. 278 (12): 10048–54. Дои:10.1074 / jbc.M212632200. PMID  12522145.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ортега А., Никшич М., Бачи А. и др. (2003). «Биохимическая функция женских летальных (2) белков, ассоциированных с супрессором-1 опухоли D / Вильмса, в альтернативном сплайсинге пре-мРНК». J. Biol. Chem. 278 (5): 3040–7. Дои:10.1074 / jbc.M210737200. PMID  12444081.
• Ходжа М.Р., Валестедт С., Хёгк С. (2000). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации не охарактеризованных белков человека». Exp. Cell Res. 259 (1): 239–46. Дои:10.1006 / excr.2000.4948. PMID  10942595.