XAB2 - XAB2

XAB2
Идентификаторы
Псевдонимы	XAB2, HCNP, HCRN, NTC90, SYF1, XPA-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 610850 MGI: 1914689 ГомолоГен: 5738 Генные карты: XAB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начинать 7,619,525 бп[1] Конец 7,629,545 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A1.1 | 8 1.92 см Начинать 3,608,421 бп[2] Конец 3,621,316 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • мембрана • нуклеоплазма • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • Прп19 комплекс • пресплицеосома • каталитическая стадия 1 сплайсосомы • сплайсосомный комплекс после высвобождения мРНК • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2 Биологический процесс • Обработка РНК • обработка мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Сплайсинг РНК • развитие коры головного мозга • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • развитие бластоцисты • Ремонт ДНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • создание каталитических сплайсосом для первой стадии переэтерификации Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56949	67439
Ансамбль	ENSG00000076924	ENSMUSG00000019470
UniProt	Q9HCS7	Q9DCD2
RefSeq (мРНК)	NM_020196	NM_026156
RefSeq (белок)	NP_064581	NP_080432
Расположение (UCSC)	Chr 19: 7,62 - 7,63 Мб	Chr 8: 3.61 - 3.62 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга пре-мРНК SYF1 это белок что у людей кодируется XAB2 ген.^[5][6]

Взаимодействия

XAB2 был показан взаимодействовать с ERCC8^[5] и XPA.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076924 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019470 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Nakatsu Y, Asahina H, Citterio E, Rademakers S, Vermeulen W., Kamiuchi S, Yeo JP, Khaw MC, Saijo M, Kodo N, Matsuda T., Hoeijmakers JH, Tanaka K (ноябрь 2000 г.). «XAB2, новый тетратрикопептидный повторяющийся белок, участвующий в связанном с транскрипцией репарации и транскрипции ДНК». J. Biol. Chem. 275 (45): 34931–7. Дои:10.1074 / jbc.M004936200. PMID  10944529.
6. «Ген Entrez: XAB2 XPA-связывающий белок 2».

дальнейшее чтение

• Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (1999). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК головного мозга человека». ДНК Res. 6 (5): 329–36. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.329. PMID  10574461.
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Ван Д, Гун И, Цинь В, Чжан П, Ли Дж, Вэй Л, Чжоу Х, Ли Х, Цю Х, Чжун Ф, Хэ Л, Ю Дж, Яо Г, Цзян Х, Цянь Л, Ю Й, Шу Х , Чен Х, Сюй Х, Го М, Пан З, Чен И, Ге С, Ян С., Гу Дж (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.