ZCCHC6 - ZCCHC6

TUT7
Идентификаторы
Псевдонимы	TUT7, PAPD6, CCHC-тип цинкового пальца, содержащий 6, TENT3B, ZCCHC6, терминальную уридилилтрансферазу 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 613467 MGI: 2387179 ГомолоГен: 51941 Генные карты: TUT7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q21.33 Начинать 86,287,733 бп[1] Конец 86,354,454 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 B2 Начинать 59,771,561 бп[2] Конец 59,823,147 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • нуклеотидилтрансферазная активность • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • РНК-уридилилтрансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание miRNA • активность уридилилтрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • катаболический процесс мРНК гистонов • Обработка 3'-конца РНК • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией • созревание ооцитов • отрицательная регуляция транспозиции, опосредованная РНК • miRNA метаболический процесс • пре-miRNA процессинг • 3 'уридилирование РНК • зависимый от полиуридилирования катаболический процесс мРНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79670	214290
Ансамбль	ENSG00000083223	ENSMUSG00000035248
UniProt	Q5VYS8	Q5BLK4
RefSeq (мРНК)	NM_001185059 NM_001185074 NM_024617 NM_001330718	NM_153538 NM_001373962 NM_001373963 NM_001373964
RefSeq (белок)	NP_001171988 NP_001172003 NP_001317647 NP_078893	NP_705766 NP_001360891 NP_001360892 NP_001360893
Расположение (UCSC)	Chr 9: 86.29 - 86.35 Мб	Chr 13: 59,77 - 59,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Терминальная уридилилтрансфераза 7 (TUT7), также известный как «цинковый палец, домен CCHC, содержащий 6», является фермент что у людей кодируется ZCCHC6 ген расположен на хромосома 9.^[5][6] Белок ZCCHC6 опосредует терминальный уридилирование из РНК стенограммы с коротким поли-А хвосты и участвует в деградации мРНК и микроРНК

Структура

Ген ZCCHC6 содержит 33 экзоны по крайней мере с шестью известными изоформами из-за альтернативное сращивание. Ген ZCCHC6 кодирует белок то есть 171 кДа в молекулярный вес и локализуется в цитоплазме.

Функция

Он катализирует следующую реакцию, требующую Mg2 + и Mn2 + как сопутствующие факторы.

UTP + РНК (n) = дифосфат + РНК (n + 1) ^[7]

Уридилирование катализируемый ZCCHC6, легко проходит на деаденилированный мРНК внутри клеток.^[8] Очищенный ZZHC6 селективно распознает и уридилирует молекулы РНК, имеющие короткие поли (А) хвосты (менее 25 нуклеотидов) in vitro. В клетках, лишенных ZCCHC6, большинство мРНК теряют сигнатурные олиго (U) хвосты, которые характерны для реактивности ZCCHC6, и, соответственно, период полужизни молекул мРНК увеличивается.^[8]

Считается, что помимо деградации мРНК, уридилирование также действует в пре-микроРНК созревания, при этом некоторые пре-микроРНК группы II требуют 3 'моноуридилирования для Дайсер обработка.^[9] Считается, что ZCCHC6 работает в резерве с ZCCHC11, опосредуя биогенез let-7. микроРНК через уридилирование.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000083223 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035248 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Кикуно Р., Хаттори А., Кондо Ю., Окумура К., Охара О. (декабрь 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (6): 347–55. Дои:10.1093 / днарес / 7.6.347. PMID  11214970.
6. «Ген Entrez: цинковый палец ZCCHC6, домен CCHC, содержащий 6».
7. Рисланд О.С., Микуласова А., Норбери С.Дж. (2007). «Эффективное полиуридилирование РНК неканоническими поли (А) полимеразами». Мол. Клетка. Биол. 27 (10): 3612–24. Дои:10.1128 / MCB.02209-06. ЧВК  1899984. PMID  17353264.
8. Лим Дж, Ха М, Чанг Х, Квон С.К., Симаншу Д.К., Патель Д.Д., Ким В.Н. (2014). «Уридилирование TUT4 и TUT7 маркирует мРНК для деградации». Клетка. 159 (6): 1365–76. Дои:10.1016 / j.cell.2014.10.055. ЧВК  4720960. PMID  25480299.
9. Хео И, Ха М, Лим Дж., Юн М.Дж., Пак Джей Э., Квон С.К., Чанг Х., Ким В.Н. (2012). «Моноуридилирование пре-микроРНК как ключевой шаг в биогенезе микроРНК let-7 группы II». Клетка. 151 (3): 521–32. Дои:10.1016 / j.cell.2012.09.022. PMID  23063654.
10. Торнтон Дж. Э., Чанг Х. М., Пискунова Э., Грегори Р. И. (2012). «Lin28-опосредованный контроль экспрессии микроРНК let-7 с помощью альтернативных TUTases Zcchc11 (TUT4) и Zcchc6 (TUT7)». РНК. 18 (10): 1875–85. Дои:10.1261 / rna.034538.112. ЧВК  3446710. PMID  22898984.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.