ABLIM3 - ABLIM3

ABLIM3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UJS, 2DJ7
Идентификаторы
Псевдонимы	ABLIM3, HMFN1661, член семейства актин-связывающих белков LIM 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 611305 MGI: 2442582 ГомолоГен: 69175 Генные карты: ABLIM3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q32 Начинать 149,141,483 бп[1] Конец 149,260,542 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 | 18 E1 Начинать 61,799,392 бп[2] Конец 61,911,824 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание актина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • стрессовое волокно • ламеллиподиум Биологический процесс • организация цитоскелета • организация актинового цитоскелета • транскрипция, ДНК-шаблон • ламеллиподиум в сборе • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • морфогенез ресничек Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	22885	319713
Ансамбль	ENSG00000173210	ENSMUSG00000032735
UniProt	O94929	Q69ZX8
RefSeq (мРНК)	NM_001301015 NM_001301018 NM_001301027 NM_001301028 NM_014945 NM_001345858 NM_001345859 NM_001345860 NM_001345861 NM_001370417 NM_001370418	NM_001164491 NM_198649 NM_001360868
RefSeq (белок)	NP_001287944 NP_001287947 NP_001287957 NP_001332787 NP_001332788 NP_001332789 NP_001332790 NP_055760 NP_001357346 NP_001357347	NP_001157963 NP_941051 NP_001347797
Расположение (UCSC)	Chr 5: 149.14 - 149.26 Мб	Chr 18: 61,8 - 61,91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Актин-связывающий белок LIM 3 это белок что у людей кодируется ABLIM3 ген.^[5]

Функция

В LIM домен это двойной цинковый палец структура, которая продвигает белок-белковые взаимодействия. Белки домена LIM, такие как ABLIM3, играют роль в эмбриональное развитие, определение клеточной линии и рак.^[6] Важно паралог этого гена LIMS1.

Клиническая значимость

Заболевания, связанные с ABLIM3, включают: гепатобластома, и среди связанных с ним супер-путей есть управление аксоном и DCC-опосредованная привлекательная передача сигналов.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173210 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032735 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ABLIM3 актин-связывающее семейство белков LIM, член 3».
6. Krupp M, Weinmann A, Galle PR, Teufel A (январь 2006 г.). «Актин-связывающий белок LIM 3 (abLIM3)». Международный журнал молекулярной медицины. 17 (1): 129–33. Дои:10.3892 / ijmm.17.1.129. PMID  16328021.

внешняя ссылка

• Человек ABLIM3 расположение генома и ABLIM3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Ямада С, Охира М, Хорие Х, Андо К., Такаясу Х, Сузуки Й, Сугано С, Хирата Т, Гото Т, Мацунага Т, Хияма Э, Хаяси Й, Андо Х, Суита С, Канеко М, Сасаки Ф, Хашизуме К. , Охнума Н., Накагавара А. (август 2004 г.). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг между гепатобластомами и соответствующей нормальной печенью: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как плохого прогностического индикатора гепатобластом». Онкоген. 23 (35): 5901–5911. Дои:10.1038 / sj.onc.1207782. PMID  15221005.
• Чжэн Б., Вэнь Дж. К., Хан М., Чжоу А. Р. (сентябрь 2004 г.). «Белок hhLIM участвует в гипертрофии сердца». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1690 (1): 1–10. Дои:10.1016 / j.bbadis.2004.04.009. PMID  15337165.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Крупп М., Вайнманн А., Галле ПР, Тойфель А. (январь 2006 г.). «Актин-связывающий белок LIM 3 (abLIM3)». Международный журнал молекулярной медицины. 17 (1): 129–33. Дои:10.3892 / ijmm.17.1.129. PMID  16328021.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Барриентос Т., Фрэнк Д., Кувахара К., Безпрозванная С., Pipes GC, Бассел-Дуби Р., Ричардсон Дж. А., Катус Г. А., Олсон Э. Н., Фрей Н. (март 2007 г.). «Два новых члена семейства белков ABLIM, ABLIM-2 и -3, связываются со STARS и напрямую связывают F-актин». Журнал биологической химии. 282 (11): 8393–8403. Дои:10.1074 / jbc.M607549200. PMID  17194709.