LIMS1 - LIMS1

LIMS1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1G47, 1NYP, 1U5S, 2COR, 2D8X, 2 КБ, 3F6Q, 4HI8, 4HI9
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMS1, PINCH, PINCH-1, PINCH1, LIM домен цинкового пальца, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602567 MGI: 1195263 ГомолоГен: 68428 Генные карты: LIMS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q12.3 Начните 108,534,355 бп[1] Конец 108,687,246 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B4 | 10 29,31 см Начните 58,323,466 бп[2] Конец 58,424,691 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание ионов цинка Сотовый компонент • цитозоль • мембрана • межклеточное соединение • очаговая адгезия • клеточная мембрана • соединение клеток • перинуклеарная область цитоплазмы • макромолекулярный комплекс • цитоплазма Биологический процесс • клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста • установление локализации белка • клеточное старение • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • положительная регуляция экспрессии генов • эпителиально-мезенхимальный переход • положительная регуляция узла фокальной адгезии • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • узел соединения ячеек • положительное регулирование адгезии клетки к субстрату • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • гетероолигомеризация белков • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • организация межклеточного перехода • межклеточная адгезия • положительная регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3987	110829
Ансамбль	ENSG00000169756	ENSMUSG00000019920
UniProt	P48059	Q99JW4
RefSeq (мРНК)	NM_001193482 NM_001193483 NM_001193484 NM_001193485 NM_001193488 NM_004987	NM_001193303 NM_026148 NM_201242 NM_001346676 NM_001359115 NM_001359116
RefSeq (белок)	NP_001180411 NP_001180412 NP_001180413 NP_001180414 NP_001180417 NP_004978 NP_001358423 NP_001358424 NP_001358425 NP_001358426 NP_001358427 NP_001358428 NP_001358429	NP_001180232 NP_001333605 NP_080424 NP_957694 NP_001346044 NP_001346045
Расположение (UCSC)	Chr 2: 108,53 - 108,69 Мб	Chr 10: 58.32 - 58.42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM и антиген-содержащий домен белок 1 стареющих клеток это белок что у людей кодируется LIMS1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой адаптерный белок, который содержит пять доменов LIM, или двойные цинковые пальцы. Белок, вероятно, участвует в передаче сигналов интегрина через его LIM-домен-опосредованное взаимодействие с интегрин-связанной киназой, обнаруженной в очаговых адгезионных бляшках. Также считается, что он действует как мостик, связывающий интегрин-связанную киназу с адаптерным белком NCK 2, который участвует в сигнальных путях киназы рецептора фактора роста. Его локализация на периферии разрастающихся клеток также предполагает, что этот белок может играть роль в опосредованной интегрином клеточной адгезии или распространении.^[7]

Взаимодействия

LIMS1 было показано взаимодействовать с участием Интегрин-связанная киназа^[6][8] и NCK2.^[6][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169756 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019920 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рирден А. (август 1994 г.). «Новый белок LIM, содержащий аутоэпитоп, гомологичный» антигену стареющих клеток"". Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 201 (3): 1124–31. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1822. PMID  7517666.
6. Ту И, Ли Ф, Гойкоэча С., Ву К. (март 1999 г.). «Только LIM-белок PINCH напрямую взаимодействует с интегрин-связанной киназой и рекрутируется в богатые интегрином сайты в разрастающихся клетках». Мол. Cell. Биол. 19 (3): 2425–34. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2425. ЧВК  84035. PMID  10022929.
7. «Ген Entrez: LIMS1 LIM и антиген-подобные домены 1 стареющих клеток».
8. Чжан И, Чен К., Го Л., Ву Ц. (октябрь 2002 г.). «Характеристика PINCH-2, нового белка фокальной адгезии, который регулирует взаимодействие PINCH-1-ILK, распространение и миграцию клеток». J. Biol. Chem. 277 (41): 38328–38. Дои:10.1074 / jbc.M205576200. PMID  12167643.
9. Ту И, Ли Ф, Ву Си (декабрь 1998 г.). «Nck-2, новый адаптерный белок, содержащий гомологию Src2 / 3, который взаимодействует с LIM-единственным белком PINCH и компонентами сигнальных путей киназы рецептора фактора роста». Мол. Биол. Ячейка. 9 (12): 3367–82. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3367. ЧВК  25640. PMID  9843575.

дальнейшее чтение

• Ту И, Ли Ф, Ву Ц (1998). «Nck-2, новый адаптерный белок, содержащий гомологию Src2 / 3, который взаимодействует с LIM-единственным белком PINCH и компонентами сигнальных путей киназы рецептора фактора роста». Мол. Биол. Ячейка. 9 (12): 3367–82. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3367. ЧВК  25640. PMID  9843575.
• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Int. J. Рак. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Веливис А, Ян Й, Ву Ц, Цинь Дж (2001). «Структура решения домена PINCH LIM1 адаптера фокальной адгезии и характеристика его взаимодействия с доменом анкиринового повтора интегрин-связанной киназы». J. Biol. Chem. 276 (7): 4932–9. Дои:10.1074 / jbc.M007632200. PMID  11078733.
• Ту И, Хуан И, Чжан И, Хуа И, Ву Ц (2001). «Новый белок фокальной адгезии, который взаимодействует с интегрин-связанной киназой и регулирует клеточную адгезию и распространение». J. Cell Biol. 153 (3): 585–98. Дои:10.1083 / jcb.153.3.585. ЧВК  2190577. PMID  11331308.
• Чжан И, Чен К., Ту И, Веливис А., Ян И, Цинь Дж, Ву Ц (2002). «Сборка комплекса PINCH-ILK-CH-ILKBP предшествует и необходима для локализации каждого компонента в сайтах адгезии клеточного матрикса». J. Cell Sci. 115 (Pt 24): 4777–86. Дои:10.1242 / jcs.00166. PMID  12432066.
• Кампана В.М., Майерс Р.Р., Риарден А. (2003). «Идентификация PINCH в шванновских клетках и нейронах DRG: перемещение и передача сигналов после повреждения нерва». Глия. 41 (3): 213–23. Дои:10.1002 / glia.10138. PMID  12528177. S2CID  33508275.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Веливис А., Вайнберг Дж., Ян Й., Виноградова О., Чжан Й., Ву Ц., Цинь Дж. (2003). «Структурные и функциональные сведения о передаче сигналов интегрина, опосредованной доменом PINCH LIM4». Nat. Struct. Биол. 10 (7): 558–64. Дои:10.1038 / nsb938. PMID  12794636. S2CID  175531.
• Фукуда Т., Чен К., Ши Х, Ву С. (2003). «PINCH-1 является обязательным партнером интегрин-связанной киназы (ILK), функционирующей в модуляции формы, подвижности и выживании клеток». J. Biol. Chem. 278 (51): 51324–33. Дои:10.1074 / jbc.M309122200. PMID  14551191.
• Bock-Marquette I, Saxena A, White MD, Dimaio JM, Srivastava D (2004). «Тимозин бета4 активирует интегрин-связанную киназу и способствует миграции сердечных клеток, выживанию и восстановлению сердца». Природа. 432 (7016): 466–72. Дои:10.1038 / природа03000. PMID  15565145. S2CID  4420896.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р.С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзуль Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Врана JL (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Догерти Г.В., Чопп Т., Ци С.М., Катлер М.Л. (2005). «Супрессор Ras Rsu-1 связывается с доменом LIM 5 адапторного белка PINCH1 и участвует в функциях, связанных с адгезией». Exp. Cell Res. 306 (1): 168–79. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.01.025. PMID  15878342.
• Сюй З., Фукуда Т., Ли И, Чжа Х, Цинь Дж, Ву С (2005). «Молекулярное рассечение PINCH-1 показывает механизм сцепления и разобщения модуляции формы клеток и выживания». J. Biol. Chem. 280 (30): 27631–7. Дои:10.1074 / jbc.M504189200. PMID  15941716.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.