NCK2 - NCK2 - Wikipedia

NCK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1U5S, 1WX6, 1Z3K, 2B86, 2CIA, 2FRW, 2FRY, 2JXB, 4E6R
Идентификаторы
Псевдонимы	NCK2, GRB4, NCKbeta, адаптерный белок NCK 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604930 MGI: 1306821 ГомолоГен: 20794 Генные карты: NCK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q12.2 Начинать 105,744,912 бп[1] Конец 105,894,274 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C1.1 Начинать 43,444,579 бп[2] Конец 43,570,515 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с белками каркаса • GO: 0001948 связывание с белками • активность адаптера цитоскелета • активность каркаса сигнального комплекса рецепторов • связывание остатков фосфотирозина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитозоль • мембрана везикул • синапс • эндоплазматический ретикулум • цитоплазма • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность Биологический процесс • положительное регулирование полимеризации актиновых филаментов • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • организация актиновых филаментов • положительная регуляция трансляции в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • сигнальный путь рецептора эфрина • сборка сигнального комплекса • развитие дендритного позвоночника • сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов • положительное регулирование пролиферации Т-клеток • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста • отрицательная регуляция индуцированного стрессом эндоплазматического ретикулума фосфорилирования eIF2-альфа • формирование иммунологического синапса • миграция клеток • отрицательная регуляция PERK-опосредованного ответа развернутого белка • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • Активация Т-клеток • регулирование перевода • ламеллиподиум в сборе • преобразование сигнала • отрицательное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8440	17974
Ансамбль	ENSG00000071051	ENSMUSG00000066877
UniProt	O43639	O55033
RefSeq (мРНК)	NM_001004720 NM_001004722 NM_003581	NM_010879
RefSeq (белок)	NP_001004720 NP_001004722 NP_003572	NP_035009
Расположение (UCSC)	Chr 2: 105,74 - 105,89 Мб	Chr 1: 43.44 - 43.57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитоплазматический белок NCK2 (также известный как NCK-бета и Grb4) это белок что у людей кодируется NCK2 ген.^[5][6][7]

Функция

NCK принадлежит к семейству адаптерные белки, Есть два гена NCK млекопитающих, NCK1 и NCK2. NCK1 расположен в хромосоме 3, а NCK2 - в хромосоме 2. Белок содержит три SH3 домены и один SH2 домен. Белок не известен каталитический функции, но было показано, что он связывает и рекрутирует различные белки, участвующие в регуляции рецепторные протеинтирозинкиназы. Считается, что именно благодаря этой регуляторной активности этот белок участвует в цитоскелет реорганизация. Альтернативный транскрипционный варианты стыковки, кодирование разных изоформы, были охарактеризованы.^[7]

Взаимодействия

NCK2 был показан взаимодействовать с:

• Рецептор эпидермального фактора роста,^[5][8][9]
• LIMS1,^[10][8]
• PDGFRB,^[5][9][11]
• ПТК2,^[12]
• Эпсилон-цепь CD3 поверхностного гликопротеина Т-клеток^[13] и
• TrkB.^[14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000071051 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066877 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чен М., Ше Х., Дэвис Э.М., Спайсер С.М., Ким Л., Рен Р., Ле Бо М.М., Ли В. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация генов семейства Nck, хромосомная локализация, экспрессия и специфичность передачи сигналов». Журнал биологической химии. 273 (39): 25171–8. Дои:10.1074 / jbc.273.39.25171. PMID  9737977.
6. Лю Дж, Ли М, Ран X, Фан Дж. С., Сон Дж. (Июнь 2006 г.). «Структурное понимание разнообразия связывания между доменами SH3 Nck2 человека и белками, богатыми пролином». Биохимия. 45 (23): 7171–84. Дои:10.1021 / bi060091y. PMID  16752908.
7. «Ген Entrez: NCK2 NCK адаптерный белок 2».
8. Ту И, Ли Ф, Ву Си (декабрь 1998 г.). «Nck-2, новый адаптерный белок, содержащий гомологию Src2 / 3, который взаимодействует с LIM-единственным белком PINCH и компонентами сигнальных путей киназы рецептора фактора роста». Молекулярная биология клетки. 9 (12): 3367–82. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3367. ЧВК  25640. PMID  9843575.
9. Braverman LE, Quilliam LA (февраль 1999 г.). «Идентификация Grb4 / Nckbeta, адаптерного белка, содержащего домен 2 и 3 гомологии src, имеющего сходные связывающие и биологические свойства с Nck». Журнал биологической химии. 274 (9): 5542–9. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5542. PMID  10026169.
10. Ту И, Ли Ф, Гойкоэча С., Ву К. (март 1999 г.). «Только LIM-белок PINCH напрямую взаимодействует с интегрин-связанной киназой и рекрутируется в богатые интегрином сайты в разрастающихся клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (3): 2425–34. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2425. ЧВК  84035. PMID  10022929.
11. Чен М., Ше Х, Ким А., Вудли Д. Т., Ли В. (ноябрь 2000 г.). «Адаптер Nckbeta регулирует полимеризацию актина в фибробластах NIH 3T3 в ответ на тромбоцитарный фактор роста bb». Молекулярная и клеточная биология. 20 (21): 7867–80. Дои:10.1128 / mcb.20.21.7867-7880.2000. ЧВК  86398. PMID  11027258.
12. Goicoechea SM, Tu Y, Hua Y, Chen K, Shen TL, Guan JL, Wu C (июль 2002 г.). «Nck-2 взаимодействует с киназой фокальной адгезии и модулирует подвижность клеток». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 34 (7): 791–805. Дои:10.1016 / с 1357-2725 (02) 00002-х. PMID  11950595.
13. Gil D, Schamel WW, Montoya M, Sánchez-Madrid F, Alarcón B (июнь 2002 г.). «Рекрутирование Nck с помощью CD3-эпсилон выявляет индуцированное лигандом конформационное изменение, необходимое для передачи сигналов рецептора Т-клеток и образования синапсов». Клетка. 109 (7): 901–12. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00799-7. PMID  12110186. S2CID  2714623.
14. Сузуки С., Мизутани М., Сузуки К., Ямада М., Кодзима М., Хатанака Н., Коидзуми С. (июнь 2002 г.). «Нейротрофический фактор головного мозга способствует взаимодействию адапторного белка Nck2 с рецептором тирозинкиназы TrkB». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 294 (5): 1087–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00606-X. PMID  12074588.

дальнейшее чтение

• Ли В., Ху П., Скольник Е. Ю., Ульрих А., Шлессингер Дж. (Декабрь 1992 г.). «Белок Nck, содержащий SH2- и SH3-домены, является онкогенным и является общей мишенью для фосфорилирования различными поверхностными рецепторами». Молекулярная и клеточная биология. 12 (12): 5824–33. Дои:10.1128 / MCB.12.12.5824. ЧВК  360522. PMID  1333047.
• Ту И, Ли Ф, Ву Си (декабрь 1998 г.). «Nck-2, новый адаптерный белок, содержащий гомологию Src2 / 3, который взаимодействует с LIM-единственным белком PINCH и компонентами сигнальных путей киназы рецептора фактора роста». Молекулярная биология клетки. 9 (12): 3367–82. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3367. ЧВК  25640. PMID  9843575.
• Ту И, Ли Ф, Гойкоэча С., Ву К. (март 1999 г.). «Только LIM-белок PINCH напрямую взаимодействует с интегрин-связанной киназой и задействуется в богатых интегрином сайтах в разрастающихся клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (3): 2425–34. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2425. ЧВК  84035. PMID  10022929.
• Braverman LE, Quilliam LA (февраль 1999 г.). «Идентификация Grb4 / Nckbeta, адаптерного белка, содержащего домен 2 и 3 гомологии src, имеющего сходные связывающие и биологические свойства с Nck». Журнал биологической химии. 274 (9): 5542–9. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5542. PMID  10026169.
• Коутиньо С., Ян Т., Левицки М., Феллер С., Хатцлер П., Пешель С., Дуйстер Дж. (Июль 2000 г.). «Характеристика Ggrb4, адапторного белка, взаимодействующего с Bcr-Abl». Кровь. 96 (2): 618–24. Дои:10.1182 / blood.V96.2.618. PMID  10887126.
• Чен М., Ше Х, Ким А., Вудли Д. Т., Ли В. (ноябрь 2000 г.). «Адаптер Nckbeta регулирует полимеризацию актина в фибробластах NIH 3T3 в ответ на тромбоцитарный фактор роста bb». Молекулярная и клеточная биология. 20 (21): 7867–80. Дои:10.1128 / MCB.20.21.7867-7880.2000. ЧВК  86398. PMID  11027258.
• Tu Y, Kucik DF, Wu C (март 2001 г.). «Идентификация и кинетический анализ взаимодействия между Nck-2 и DOCK180». Письма FEBS. 491 (3): 193–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02195-0. PMID  11240126. S2CID  31372015.
• Ян Т., Зайпель П., Коутиньо С., Митхинг С., Пешель С., Дуйстер Дж. (Ноябрь 2001 г.). «Grb4 / Nckbeta действует как ядерный репрессор v-Abl-индуцированной транскрипции с промоторных элементов c-jun / c-fos». Журнал биологической химии. 276 (46): 43419–27. Дои:10.1074 / jbc.M107030200. PMID  11514578.
• Cowan CA, Henkemeyer M (сентябрь 2001 г.). «Адаптер SH2 / SH3 Grb4 преобразует обратные сигналы B-эфрина». Природа. 413 (6852): 174–9. Bibcode:2001Натура.413..174С. Дои:10.1038/35093123. PMID  11557983. S2CID  4313061.
• Goicoechea SM, Tu Y, Hua Y, Chen K, Shen TL, Guan JL, Wu C (июль 2002 г.). «Nck-2 взаимодействует с киназой фокальной адгезии и модулирует подвижность клеток». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 34 (7): 791–805. Дои:10.1016 / S1357-2725 (02) 00002-X. PMID  11950595.
• Сузуки С., Мизутани М., Сузуки К., Ямада М., Кодзима М., Хатанака Н., Коидзуми С. (июнь 2002 г.). «Нейротрофический фактор головного мозга способствует взаимодействию адапторного белка Nck2 с рецептором тирозинкиназы TrkB». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 294 (5): 1087–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00606-X. PMID  12074588.
• Gil D, Schamel WW, Montoya M, Sánchez-Madrid F, Alarcón B (июнь 2002 г.). «Рекрутирование Nck с помощью CD3-эпсилон выявляет индуцированное лигандом конформационное изменение, необходимое для передачи сигналов рецептора Т-клеток и образования синапсов». Клетка. 109 (7): 901–12. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00799-7. PMID  12110186. S2CID  2714623.
• Song J, Vranken W., Xu P, Gingras R, Noyce RS, Yu Z, Shen SH, Ni F (сентябрь 2002 г.). «Структура раствора и динамика основной цепи функционального цитоплазматического субдомена человеческого эфрина B2, лиганда клеточной поверхности с двунаправленными сигнальными свойствами». Биохимия. 41 (36): 10942–9. Дои:10.1021 / bi025815u. PMID  12206665.
• Aspenström P (сентябрь 2002 г.). «WASP-связывающий белок WIRE играет роль в регуляции системы актиновых волокон ниже рецептора тромбоцитарного фактора роста». Экспериментальные исследования клеток. 279 (1): 21–33. Дои:10.1006 / excr.2002.5576. PMID  12213210.
• Хафизи С., Алиндри Ф., Карлссон Р., Дальбек Б. (декабрь 2002 г.). «Взаимодействие тирозинкиназы рецептора Axl с C1-TEN, новым белком, содержащим домен C1, гомологичным тензину». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 299 (5): 793–800. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02718-3. PMID  12470648.
• Веливис А., Вайнберг Дж., Ян Й., Виноградова О., Чжан И, Ву Ц., Цинь Дж. (Июль 2003 г.). «Структурные и функциональные сведения о передаче сигналов интегрина, опосредованной доменом PINCH LIM4». Структурная биология природы. 10 (7): 558–64. Дои:10.1038 / nsb938. PMID  12794636. S2CID  175531.
• Hu Y, Fang X, Dunham SM, Prada C, Stachowiak EK, Stachowiak MK (июль 2004 г.). «Рибосомная киназа S6 массой 90 кДа является прямой мишенью для рецептора ядерного фактора роста фибробластов 1 (FGFR1): роль в передаче сигналов FGFR1». Журнал биологической химии. 279 (28): 29325–35. Дои:10.1074 / jbc.M311144200. PMID  15117958.
• Ran X, Song J (май 2005 г.). «Структурное понимание разнообразия связывания между Tyr-фосфорилированными человеческими ephrinBs и доменом Nck2 SH2». Журнал биологической химии. 280 (19): 19205–12. Дои:10.1074 / jbc.M500330200. PMID  15764601.
• Song J (июль 2003 г.). «Фосфорилирование тирозина хорошо упакованной цитоплазматической бета-шпильки ephrinB для обратной передачи сигналов. Структурные последствия и связывающие свойства». Журнал биологической химии. 278 (27): 24714–20. Дои:10.1074 / jbc.M210625200. PMID  12606549.
• Лю Цзинь, Го Х, Цзян И, Чжан Х (2013). «NCK2 в значительной степени ассоциируется с опиатной зависимостью у мужчин африканского происхождения». Журнал ScienceWorld. 2013: 748979. Дои:10.1155/2013/748979. ЧВК  3603435. PMID  23533358.

внешняя ссылка

• Nck2 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек