ACAT1 - ACAT1

ACAT1
PDB 2ib8 EBI.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACAT1, ACAT, MAT, T2, THIL, ацетил-CoA ацетилтрансфераза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607809 MGI: 87870 ГомолоГен: 6 Генные карты: ACAT1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение ACAT1
Геномное расположение ACAT1
Группа11q22.3Начните108,121,516 бп[1]
Конец108,147,776 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000019

NM_144784

RefSeq (белок)

NP_000010

NP_659033

Расположение (UCSC)Chr 11: 108.12 - 108.15 МбChr 9: 53,58 - 53,61 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ацетил-КоА-ацетилтрансфераза, митохондриальная, также известен как ацетоацетил-КоА тиолаза, является фермент что у людей кодируется ACAT1 (Ацетил-коэнзим А ацетилтрансфераза 1) ген.[5]

Ацетил-кофермент А ацетилтрансфераза 1 является ацетил-КоА C-ацетилтрансфераза фермент.

Структура

Ген охватывает ок. 27 кб и содержит двенадцать экзоны прервано одиннадцатью интроны. В области, фланкирующей 5 ’конец гена, отсутствует Коробка ТАТА, но содержит множество сборщиков мусора и два блока CAAT. Ген также может иметь сайт связывания для фактор транскрипции Sp1, и имеет последовательности, напоминающие сайты связывания нескольких других факторов транскрипции. Кроме того, непосредственно перед сайтом кэпа находится фрагмент ДНК длиной 101 п.н., который обладает промоторной активностью.[6]

Ген ACAT1 человека производит химерный мРНК посредством транс-сплайсинга - процесса, при котором отдельные транскрипты из хромосом 1 и 7 соединяются вместе. Транскрипт химерной мРНК использует два участка для инициации трансляции: AUG (1397-1399) и GGC (1274-1276). Инициация первого кодона (AUG) приводит к трансляции 50-кДа ACAT1, а инициация другого (GGC) дает еще один ферментативно активный 56-кДа. изоформа соответственно; изоформа 56 кДа в природе присутствует в клетках человека, включая макрофаги, происходящие из человеческих моноцитов.[7]

Полученный транскрипт кодирует ACAT1, который представляет собой белок 45,1 кДа, состоящий из 427 аминокислот.[8][9] Это также гомотетрамерный белок, который имеет девять трансмембранных доменов (TMD). Один активный остаток представляет собой гистидин в 460-м положении, который находится в 7-м TMD. ACAT1 имеет семь свободных остатков цистеина, но они не влияют на каталитическую активность. Есть два функциональных участка этого белка, TMD7 и TMD8; одна сторона участвует в связывании субстрата и катализе, а другая - во взаимодействиях и связывании субъединиц.[10]

Функция

Этот ген кодирует локализованный в митохондриях фермент, который катализирует обратимое образование ацетоацетил-КоА из двух молекул ацетил-КоА.[5] Фермент ACAT1 обладает несколькими уникальными свойствами. Во-первых, он активируется калий ионы привязка возле CoA сайт связывания и каталитический сайт. Это связывание вызывает структурные изменения в петле активного сайта. Кроме того, этот фермент может использовать 2-метил-разветвленный ацетоацетил-КоА в качестве субстрата, что делает его уникальным тиолаза.[11] ACAT1 регулируется как на уровне транскрипции, так и на уровне трансляции. Активность фермента ACAT1 повышается. Экспрессия ACAT1 транскрипционно стимулируется лептином,[12] ангиотензин II,[13] и инсулин в человеческих моноцитах / макрофагах.[14] Инсулино-опосредованная регуляция также включает пути передачи сигналов ERK, p38MAPK и JNK.[15]

Клиническое значение

Дефицит кетотиолазы

Мутации гена ACAT1 связаны с недостаток в протеине, кодируемом митохондриальной ацетоацетил-КоА тиолазой; это также известно как дефицит кетотиолазы. Многие мутации были идентифицированы в конкретных популяциях, и были проведены крупномасштабные исследования для определения аллельной и генотипической частоты дефектного гена.[16] Поскольку митохондриальная ацетоацетил-КоА тиолаза участвует в бета-окислении, дефицит этого фермента отмечен повышенным количеством соединений холестерина. Кроме того, нарушается аминокислотный путь изолейцина, так что его метаболизм останавливается. Этот дефицит относится к более общему классу расстройств, известных как органические ацидемии, при котором дисфункция определенной стадии катаболизма аминокислот приводит к выведению неаминокислот с мочой. Этот дефицит проявляется в виде кетоза, ацидоза, а также гипогликемии, но есть и другие клинические проявления. Характерными чертами органических ацидемических расстройств являются рвота, плохое питание, неврологические симптомы, такие как судороги и аномальный тонус, а также летаргия, переходящая в кому, которые являются проявлениями токсической энцефалопатии. Клинический исход новорожденных с этими расстройствами в значительной степени определяется временем постановки диагноза, при этом потенциальный исход значительно улучшается, если заболевание диагностируется в первые десять дней жизни. Дефицит кетотиолазы диагностируется путем проведения ГХ-МС и количественного анализа аминокислот в моче; диагностическими маркерами являются 2-метил-3-гидроксимасляная кислота, 2-метилацетоуксусная кислота и тиглилглицин. Заболевание лечится, пытаясь восстановить биохимический и физиологический гомеостаз; Общие методы лечения включают ограничение диеты, чтобы избежать аминокислот-предшественников, и использование соединений для удаления токсичных метаболитов или повышения активности ферментов. Это заболевание передается по аутосомно-рецессивному типу, а это означает, что у носителей гена не проявляются симптомы заболевания.[17]

Рак

Кроме того, экспрессия ACAT1 была связана с проявлениями рака простаты, поскольку ACAT1 более значительно экспрессируется в образцах ткани агрессивного рака простаты по сравнению с его экспрессией в доброкачественных клетках.[18][19]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075239 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032047 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Энтрез Ген: ацетил-коэнзим А ацетилтрансфераза 1».
  6. ^ Кано, М; Fukao, T; Ямагути, S; Ории, Т; Осуми, Т; Хашимото, Т. (30 декабря 1991 г.). «Структура и экспрессия человеческого митохондриального гена, кодирующего ацетоацетил-КоА тиолазу». Ген. 109 (2): 285–90. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90623-к. PMID  1684944.
  7. ^ Чен, Дж; Чжао, XN; Ян, Л; Ху, ГДж; Лу, М; Xiong, Y; Ян, XY; Чанг, СС; Песня, BL; Чанг, штат Нью-Йорк; Ли, Б.Л. (сентябрь 2008 г.). «Вторичные структуры РНК, расположенные в межхромосомной области химерной мРНК ACAT1 человека, необходимы для производства изоформы 56 кДа». Клеточные исследования. 18 (9): 921–36. Дои:10.1038 / кр.2008.66. ЧВК  3086790. PMID  18542101.
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  9. ^ «Информация о белке: P24752». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал 14 августа 2016 г.. Получено 23 июля 2016.
  10. ^ Го, З.Ы .; Чанг, СС; Чанг, штат Нью-Йорк (4 сентября 2007 г.). «Функциональность седьмого и восьмого трансмембранных доменов ацил-кофермента А: холестерин ацилтрансферазы 1». Биохимия. 46 (35): 10063–71. Дои:10.1021 / bi7011367. PMID  17691824.
  11. ^ Хаапалайнен, AM; Meriläinen, G; Пириля, Польша; Кондо, Н; Fukao, T; Веренга, РК (10 апреля 2007 г.). «Кристаллографические и кинетические исследования митохондриальной ацетоацетил-КоА тиолазы человека: важность ионов калия и хлорида для ее структуры и функции». Биохимия. 46 (14): 4305–21. Дои:10.1021 / bi6026192. PMID  17371050.
  12. ^ Хонго, S; Ватанабэ, Т; Арита, S; Каноме, Т; Кагеяма, H; Шиода, S; Миядзаки, А (август 2009 г.). «Лептин модулирует экспрессию ACAT1 и отток холестерина из макрофагов человека». Американский журнал физиологии. Эндокринология и метаболизм. 297 (2): E474–82. Дои:10.1152 / ajpendo.90369.2008. PMID  19625677.
  13. ^ Каноме, Т; Ватанабэ, Т; Nishio, K; Такахаши, К. Хонго, S; Миядзаки, А (сентябрь 2008 г.). «Ангиотензин II активирует ацил-КоА: холестерин-ацилтрансферазу-1 через рецептор ангиотензина II типа 1 в моноцитах-макрофагах человека». Исследования гипертонии. 31 (9): 1801–10. Дои:10.1291 / hypres.31.1801. PMID  18971559.
  14. ^ Ge, Дж; Чжай, Вт; Cheng, B; Он, П; Ци, В; Лу, Н; Zeng, Y; Чен, X (сентябрь 2013 г.). «Инсулин индуцирует экспрессию гена ацил-кофермента A: холестерин-ацилтрансферазы1 человека через киназы MAP и CCAAT / связывающий энхансер белок α». Журнал клеточной биохимии. 114 (9): 2188–98. Дои:10.1002 / jcb.24568. PMID  23564383. S2CID  22816300.
  15. ^ Синь, С; Ян-Фу, Вт; Пинг, H; Цзин, G; Цзин-Цзин, Вт; Чун-Ли, М; Wei, L; Бей, К. (май 2009 г.). «Изучение путей передачи сигналов инсулина в регуляции экспрессии ACAT1 в культивируемых макрофагах». Cell Biology International. 33 (5): 602–6. Дои:10.1016 / j.cellbi.2009.02.011. PMID  19269342. S2CID  13605913.
  16. ^ Фрэнсис, Т. Вартофски, Л. (1 сентября 1992 г.). «Распространенные заболевания щитовидной железы у пожилых людей». Последипломная медицина. 92 (3): 225–30, 233–6. Дои:10.1080/00325481.1992.11701452. PMID  1518756.
  17. ^ Seashore, MR; Пагон, РА; Адам, депутат; Ardinger, HH; Птица, ТД; Долан, CR; Фонг, Коннектикут; Смит, RJH; Стивенс, К. (1993). «Органические ацидемии: обзор». Gene Reviews (R) Сиэтл (Вашингтон): Вашингтонский университет, Сиэтл; 1993-2015 гг. Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  18. ^ Сараон, П; Trudel, D; Крон, К; Дмитроманолакис, А; Трахтенберг, Дж; Бапат, Б; ван дер Кваст, Т; Ярви, KA; Диамандис, EP (апрель 2014 г.). «Оценка и прогностическое значение ACAT1 как маркера прогрессирования рака простаты». Простаты. 74 (4): 372–80. Дои:10.1002 / pros.22758. PMID  24311408. S2CID  2169465.
  19. ^ Сараон, П; Cretu, D; Musrap, N; Караджаннис, GS; Батрух, I; Драбович А.П .; ван дер Кваст, Т; Мизоками, А; Моррисси, К; Ярви, К; Диамандис, EP (июнь 2013 г.). «Количественная протеомика показывает, что ферменты кетогенного пути связаны с прогрессированием рака простаты». Молекулярная и клеточная протеомика. 12 (6): 1589–601. Дои:10.1074 / mcp.m112.023887. ЧВК  3675816. PMID  23443136.

внешние ссылки

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.