ADAMTS1 - ADAMTS1

ADAMTS1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JIH, 2V4B, 3 квартал 2 года, 3Q2H
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAMTS1, C3-C5, METH1, металлопептидаза ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605174 MGI: 109249 ГомолоГен: 21381 Генные карты: ADAMTS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q21.3 Начните 26,835,755 бп[1] Конец 26,845,409 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 C3.3 | 16 48,2 см Начните 85,793,827 бп[2] Конец 85,803,113 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гепарина • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • пептидазная активность • металлоэндопептидазная активность • гидролазная активность • металлопептидазная активность Сотовый компонент • внеклеточная область • базальная мембрана • цитоплазматический пузырек • внеклеточный матрикс • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • овуляция из фолликула яичника • образование трабекулы сердца • развитие почек • протеолиз • интегрин-опосредованный сигнальный путь • отрицательное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • положительное регулирование пролиферации клеток гладких мышц сосудов • положительное регулирование миграции клеток гладких мышц, связанных с сосудами Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9510	11504
Ансамбль	ENSG00000154734	ENSMUSG00000022893
UniProt	Q9UHI8	P97857
RefSeq (мРНК)	NM_006988	NM_009621
RefSeq (белок)	NP_008919	NP_033751
Расположение (UCSC)	Chr 21: 26,84 - 26,85 Мб	Chr 16: 85,79 - 85,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами 1 является фермент что у людей кодируется ADAMTS1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует член АДАМТС (а дезинтегрин и металлопротеиназа с участием тромбоспондин мотив) белковое семейство. Члены семейства имеют несколько общих белковых модулей, в том числе пропептид регион, а металлопротеиназа домен, подобный дезинтегрину домен и тромбоспондин тип 1 (TS) мотив. Отдельные члены этого семейства различаются по количеству С-концевых TS мотивов, а некоторые имеют уникальные С-концевые домены. Белок, кодируемый этим геном, содержит две петли дезинтегрина и три С-концевых TS-мотива и обладает антиангиогенной активностью. Экспрессия этого гена может быть связана с различными воспалительными процессами, а также с развитием рак кахексия. Этот ген, вероятно, необходим для нормального роста, фертильности, морфологии и функции органов.^[6]

Взаимодействия

ADAMTS1 был показан взаимодействовать с участием Фактор роста эндотелия сосудов А.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154734 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022893 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Васкес Ф., Гастингс Дж., Ортега М.А., Лейн Т.Ф., Оикемус С., Ломбардо М., Ируэла-Ариспе М.Л. (сентябрь 1999 г.). «METH-1, человеческий ортолог ADAMTS-1, и METH-2 являются членами нового семейства белков с ангио-ингибирующей активностью». J Biol Chem. 274 (33): 23349–57. Дои:10.1074 / jbc.274.33.23349. PMID  10438512.
6. «Ген Entrez: металлопептидаза ADAMTS1 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 1».
7. Луке А., Карпизо Д. Р., Ируэла-Ариспе М. Л. (июнь 2003 г.). «ADAMTS1 / METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165». J. Biol. Chem. 278 (26): 23656–65. Дои:10.1074 / jbc.M212964200. PMID  12716911.

дальнейшее чтение

• Тан Б.Л., Хонг В. (1999). «ADAMTS: новое семейство протеаз с доменом протеазы ADAM и повторами тромбоспондина 1». FEBS Lett. 445 (2–3): 223–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00119-2. PMID  10094461. S2CID  37955930.
• Хирохата С. (2002). «[Семейство ADAMTS - новый фермент, разрушающий внеклеточный матрикс]». Сэйкагаку. 73 (11): 1333–7. PMID  11831030.
• Куно К., Канада Н., Накашима Э. и др. (1997). «Молекулярное клонирование гена, кодирующего новый тип белка семейства металлопротеиназ-дезинтегрин с мотивами тромбоспондина в качестве гена, связанного с воспалением». J. Biol. Chem. 272 (1): 556–62. Дои:10.1074 / jbc.272.1.556. PMID  8995297.
• Куно К., Мацусима К. (1998). «Белок ADAMTS-1 заякоривается во внеклеточном матриксе через мотивы тромбоспондина I типа и его спейсинговую область». J. Biol. Chem. 273 (22): 13912–7. Дои:10.1074 / jbc.273.22.13912. PMID  9593739.
• Куно К., Терасима Ю., Мацусима К. (1999). «ADAMTS-1 - активная металлопротеиназа, связанная с внеклеточным матриксом». J. Biol. Chem. 274 (26): 18821–6. Дои:10.1074 / jbc.274.26.18821. PMID  10373500.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
• Глинке Дж., Шмитт А.О., Пиларски С. и др. (2000). «Дифференциальная экспрессия генов эндотелиальными клетками в различных ангиогенных состояниях». Евро. J. Biochem. 267 (9): 2820–30. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01325.x. PMID  10785405.
• Шиндо Т., Курихара Х., Куно К. и др. (2000). «АДАМТС-1: металлопротеиназа-дезинтегрин, необходимый для нормального роста, фертильности, а также морфологии и функции органов». J. Clin. Вкладывать деньги. 105 (10): 1345–52. Дои:10.1172 / JCI8635. ЧВК  315464. PMID  10811842.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Куно К., Окада Й., Кавасима Х. и др. (2000). «АДАМЦ-1 расщепляет протеогликан хряща аггрекан». FEBS Lett. 478 (3): 241–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01854-8. PMID  10930576. S2CID  32699689.
• Сэнди Дж. Д., Вестлинг Дж., Кенаги Р. Д. и др. (2001). «Протеолиз Versican V1 в аорте человека in vivo происходит по связи Glu441-Ala442, сайту, который расщепляется рекомбинантными ADAMTS-1 и ADAMTS-4». J. Biol. Chem. 276 (16): 13372–8. Дои:10.1074 / jbc.M009737200. PMID  11278559.
• Вэй П., Чжао Ю.Г., Чжуан Л. и др. (2002). «Белковая инженерия и свойства металлопротеиназы и тромбоспондина 1 человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (1): 478–88. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00255-3. PMID  12054626.
• Родригес-Манзанеке Дж. К., Вестлинг Дж., Тайский С. Н. и др. (2002). «ADAMTS1 расщепляет аггрекан по множеству сайтов и по-разному ингибируется ингибиторами металлопротеиназы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (1): 501–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00254-1. PMID  12054629.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Луке А., Карпизо Д.Р., Ируэла-Ариспе М.Л. (2003). «ADAMTS1 / METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165». J. Biol. Chem. 278 (26): 23656–65. Дои:10.1074 / jbc.M212964200. PMID  12716911.
• Рассел Д.Л., Дойл К.М., Охснер С.А. и др. (2004). «Обработка и локализация ADAMTS-1 и протеолитическое расщепление версикана во время расширения матрикса кумулюса и овуляции». J. Biol. Chem. 278 (43): 42330–9. Дои:10.1074 / jbc.M300519200. PMID  12907688.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.

внешние ссылки

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: M12.222
• ADAMTS1 на Атлас генетики и онкологии
• Человек ADAMTS1 расположение генома и ADAMTS1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9UHI8 (Дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами 1) на PDBe-KB.