MMP8 - MMP8

MMP8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A86, 1JAP, 1I76, 1ZVX, 3TT4, 2OY2, 1ZS0, 1 ЯНВАРЯ, 1 ММБ, 1I73, 1A85, 1KBC, 1ZP5, 1JH1, 3DPF, 1JAQ, 3DPE, 1БЗС, 4QKZ, 1JAO, 3DNG, 2OY4, 1MNC
Идентификаторы
Псевдонимы	MMP8, CLG1, HNC, MMP-8, PMNL-CL, матриксная металлопептидаза 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 120355 MGI: 1202395 ГомолоГен: 22482 Генные карты: MMP8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q22.2 Начинать 102,711,796 бп[1] Конец 102,727,050 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A1 Начинать 7,558,456 бп[2] Конец 7,568,485 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • пептидазная активность • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание ионов металлов • активность эндопептидазы серинового типа • активность металлоэндопептидазы • эндопептидазная активность Сотовый компонент • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • специфический просвет гранулы • просвет третичной гранулы • внеклеточный • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • катаболический процесс коллагена • разборка внеклеточного матрикса • дифференцировка энтодермальных клеток • протеолиз • дегрануляция нейтрофилов • положительная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-10 • положительное регулирование продукции интерлейкина-6 • положительное регулирование связывания ДНК • положительное регулирование каскада МАПК • положительная регуляция процесса биосинтеза оксида азота • положительное регулирование каскада JNK • регуляция нейровоспалительного ответа • положительная регуляция нейровоспалительного ответа • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • положительная регуляция процесса биосинтеза активных форм кислорода • регуляция активации микроглиальных клеток • положительная регуляция активации микроглиальных клеток • организация внеклеточного матрикса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4317	17394
Ансамбль	ENSG00000118113	ENSMUSG00000005800
UniProt	P22894	O70138
RefSeq (мРНК)	NM_001304441 NM_001304442 NM_002424	NM_008611
RefSeq (белок)	NP_001291370 NP_001291371 NP_002415	NP_032637
Расположение (UCSC)	Chr 11: 102,71 - 102,73 Мб	Chr 9: 7.56 - 7.57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коллагеназа нейтрофилов, также известный как матричная металлопротеиназа-8 (MMP-8) или коллагеназа PMNL (MNL-CL), представляет собой коллаген раскалывание фермент который присутствует в соединительной ткани большинства млекопитающих.^[5] У людей MMP-8 белок кодируется MMP8 ген.^[6][7]Ген является частью кластера генов MMP, локализованных на хромосоме 11q22.3.^[5] Большинство ММП секретируются в виде неактивных пропротеинов, которые активируются при расщеплении внеклеточными протеиназами. Однако фермент, кодируемый этим геном, хранится во вторичных гранулах внутри нейтрофилов и активируется автолитическим расщеплением.

Функция

Белки матричная металлопротеиназа (MMP) участвуют в распаде внеклеточный матрикс при нормальных физиологических процессах, таких как эмбриональное развитие, размножение и ремоделирование тканей, а также при патологических процессах, таких как артрит и метастазирование. Основная функция MMP-8 - разложение коллагенов I, II и III типов. При раке потеря MMP-8 в мышиной модели рака молочной железы MMTV-PyMT была связана с усилением роста опухоли и метастатической нагрузкой, а также с усилением васкуляризации опухоли и измененной инфильтрацией иммунных клеток.^[8] Кроме того, анализ MMP-8 в клеточных линиях рака молочной железы выявил причинную связь между активностью MMP-8 и продуцированием IL6 и IL8, предполагая роль MMP-8 в регуляции врожденной иммунной системы.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118113 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005800 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: матричная металлопептидаза 8 MMP8 (коллагеназа нейтрофилов)».
6. Hasty KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, Thompson JP, Spinella DG, Stevens RM, Mainardi CL (июль 1990). «Коллагеназа нейтрофилов человека. Отдельный генный продукт с гомологией с другими матриксными металлопротеиназами». J. Biol. Chem. 265 (20): 11421–4. PMID  2164002.
7. Девараджан П., Мухтияр К., Ван Варт Х., Берлинер Н. (июнь 1991 г.). «Структура и экспрессия кДНК, кодирующей коллагеназу нейтрофилов человека». Кровь. 77 (12): 2731–8. Дои:10.1182 / blood.V77.12.2731.2731. PMID  1646048.^{[постоянная мертвая ссылка ]}
8. Декок, Джули; Хендрикс, Воутер; Тиркеттл, Салли; Гутьеррес-Фернандес, Ана; Робинсон, Стивен Д; Эдвардс, Дилан Р. (2015). «Плейотропные функции матричной металлопротеиназы-8, подавляющей опухоль и метастазы, при раке молочной железы у трансгенных мышей MMTV-PyMT». Рак груди Res. 17: 38. Дои:10.1186 / s13058-015-0545-8. ЧВК  4380014. PMID  25848906.
9. Тиркеттл, Салли; Декок, Джули; Арнольд, Хью; Пеннингтон, Кэролайн Дж; Jaworski, Diane M; Эдвардс, Дилан Р. (2013). «Матричная металлопротеиназа 8 (коллагеназа 2) индуцирует экспрессию интерлейкинов 6 и 8 в клетках рака груди». J Biol Chem. 288 (23): 16282–16294. Дои:10.1074 / jbc.M113.464230. ЧВК  3675567. PMID  23632023.

дальнейшее чтение

• Чандлер С., Миллер К.М., Клементс Дж. М. и др. (1997). «Матричные металлопротеиназы, фактор некроза опухолей и рассеянный склероз: обзор». J. Neuroimmunol. 72 (2): 155–61. Дои:10.1016 / S0165-5728 (96) 00179-8. PMID  9042108. S2CID  26495949.
• Массова И., Котра Л.П., Фридман Р., Mobashery S (1998). «Матричные металлопротеиназы: структуры, эволюция и диверсификация». FASEB J. 12 (25n26): 1075–95. CiteSeerX  10.1.1.31.3959. Дои:10.1142 / S0217984998001256. PMID  9737711.
• Нагасе Х., Весснер Дж. Ф. (1999). «Матричные металлопротеиназы». J. Biol. Chem. 274 (31): 21491–4. Дои:10.1074 / jbc.274.31.21491. PMID  10419448.
• Bläser J, Triebel S, Reinke H, Tschesche H (1992). «Образование ковалентной связи Hg-Cys во время ртутной активации проколлагеназы PMNL свидетельствует о механизме переключения цистеина». FEBS Lett. 313 (1): 59–61. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 81184-Н. PMID  1330697. S2CID  36829374.
• Девараджан П., Мухтияр К., Ван Варт Х., Берлинер Н. (1991). «Структура и экспрессия кДНК, кодирующей коллагеназу нейтрофилов человека». Кровь. 77 (12): 2731–8. Дои:10.1182 / blood.V77.12.2731.2731. PMID  1646048.
• Bläser J, Knäuper V, Osthues A, et al. (1992). «Ртутная активация проколлагеназы полиморфноядерных лейкоцитов человека». Евро. J. Biochem. 202 (3): 1223–30. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16494.x. PMID  1662606.
• Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Характеристика и активация проколлагеназы из полиморфноядерных лейкоцитов человека. Определение N-концевой последовательности профермента и различных протеолитически активированных форм». Евро. J. Biochem. 189 (2): 295–300. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1990.tb15489.x. PMID  2159879.
• Hasty KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, et al. (1990). «Коллагеназа нейтрофилов человека. Отдельный генный продукт с гомологией с другими матриксными металлопротеиназами». J. Biol. Chem. 265 (20): 11421–4. PMID  2164002.
• Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Неполная аминокислотная последовательность проколлагеназы лейкоцитов человека PMN». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 371 Дополнение: 295–304. PMID  2169256.
• Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Неполная аминокислотная последовательность проколлагеназы лейкоцитов человека PMN». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 371 (8): 733–734. Дои:10.1515 / bchm3.1990.371.2.733. PMID  2169766.
• Малля С.К., Мухтияр К.А., Гао Ю.и др. (1991). «Характеристика 58-килодальтонной нейтрофильной коллагеназы человека: сравнение с коллагеназой фибробластов человека». Биохимия. 29 (47): 10628–34. Дои:10.1021 / bi00499a008. PMID  2176876.
• Штамс Т., Спурлино Дж. К., Смит Д. Л. и др. (1995). «Структура коллагеназы нейтрофилов человека выявляет большой карман специфичности S1 '». Nat. Struct. Биол. 1 (2): 119–23. Дои:10.1038 / nsb0294-119. PMID  7656015. S2CID  35458800.
• Fosang AJ, Last K, Neame PJ и др. (1995). «Нейтрофильная коллагеназа (ММР-8) расщепляет аггреканазный сайт E373-A374 в межглобулярном домене аггрекана хряща». Biochem. J. 304 (2): 347–51. Дои:10.1042 / bj3040347. ЧВК  1137499. PMID  7998967.
• Боде В., Рейнемер П., Хубер Р. и др. (1994). «Рентгеновская кристаллическая структура каталитического домена коллагеназы нейтрофилов человека, ингибируемого аналогом субстрата, раскрывает основы катализа и специфичности». EMBO J. 13 (6): 1263–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06378.x. ЧВК  394940. PMID  8137810.
• Fosang AJ, Last K, Knäuper V и др. (1993). «Коллагеназы фибробластов и нейтрофилов расщепляются на двух участках в агреканском межглобулярном домене хряща». Biochem. J. 295 (1): 273–6. Дои:10.1042 / bj2950273. ЧВК  1134849. PMID  8216228.
• Райнемер П., Грамм Ф., Хубер Р. и др. (1994). «Структурные последствия роли N-конца в« суперактивации »коллагеназ. Кристаллографическое исследование». FEBS Lett. 338 (2): 227–33. Дои:10.1016/0014-5793(94)80370-6. PMID  8307185. S2CID  2454182.
• Томас ДБ, Дэвис М., Петерс Дж. Р., Уильямс Дж. Д. (1993). «Белок Тамма Хорсфалла связывается с одним классом специфичных для углеводов рецепторов на нейтрофилах человека». Почка Int. 44 (2): 423–9. Дои:10.1038 / ки.1993.260. PMID  8397318.
• Коул А.А., Чубинская С., Шумахер Б. и др. (1996). «Металлопротеиназа-8 матрикса хондроцитов. Хондроциты суставов человека экспрессируют нейтрофильную коллагеназу». J. Biol. Chem. 271 (18): 11023–6. Дои:10.1074 / jbc.271.18.11023. PMID  8631924.
• Накахара Ю., Мията Т., Хамуро Т. и др. (1996). «Аминокислотная последовательность и углеводная структура ингибитора пути рекомбинантного тканевого фактора человека, экспрессируемого в клетках яичника китайского хомячка: одна N- и две O-связанные углеводные цепи расположены между доменами 2 и 3 Кунитца, а одна N-связанная углеводная цепь находится в Kunitz домен 2 ". Биохимия. 35 (20): 6450–9. Дои:10.1021 / bi9524880. PMID  8639592.
• Пендас А.М., Сантамария I, Альварес М.В. и др. (1997). «Тонкое физическое картирование генов матричной металлопротеиназы человека, сгруппированных на хромосоме 11q22.3». Геномика. 37 (2): 266–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0557. PMID  8921407.

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: M10.002