AKAP8L - AKAP8L

AKAP8L
Идентификаторы
Псевдонимы	AKAP8L, HA95, HAP95, NAKAP, NAKAP95, белок 8, заякоренный A-киназой
Внешние идентификаторы	OMIM: 609475 MGI: 1860606 ГомолоГен: 8658 Генные карты: AKAP8L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.12 Начните 15,380,050 бп[1] Конец 15,419,141 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 B1 Начните 32,321,424 бп[2] Конец 32,350,607 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • ламинат • связывание гистондеацетилазы • Связывание DEAD / H-box РНК-геликазы • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание регуляторной субъединицы протеинкиназы А Сотовый компонент • ядерная матрица • хроматин • ядерное пятнышко • Тело PML • ядро клетки • цитоплазма • рибонуклеопротеин Биологический процесс • положительная регуляция деацетилирования гистонов • разборка ядерной оболочки • регуляция экспорта мРНК из ядра • конденсация митотических хромосом • клеточный цикл G2 / M фазовый переход • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция фосфорилирования гистонов • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК • обработка мРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	26993	54194
Ансамбль	ENSG00000011243	ENSMUSG00000002625
UniProt	Q9ULX6	Q9R0L7
RefSeq (мРНК)	NM_001291478 NM_014371	NM_017476
RefSeq (белок)	NP_001278407 NP_055186	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 15.38 - 15.42 Мб	Chr 17: 32.32 - 32.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Якорный белок А-киназы 8-подобный это белок что у людей кодируется AKAP8L ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

AKAP8L был показан взаимодействовать с участием:

• DHX9,^[5][8] и
• Тимопоэтин.^[9][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011243 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002625 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Вестберг К., Ян Дж. П., Тан Х, Редди Т. Р., Вонг-Стаал Ф (июль 2000 г.). «Новый белок-челнок связывается с РНК-геликазой А и активирует конститутивный транспортный элемент ретровируса». Журнал биологической химии. 275 (28): 21396–21401. Дои:10.1074 / jbc.M909887199. PMID  10748171.
6. Орставик С., Эйде Т., Коллас П., Хан И.О., Таскен К., Кифф Е., Янсен Т., Сколхегг Б.С. (январь 2000 г.). «Идентификация, клонирование и характеристика нового ядерного белка HA95, гомологичного белку 95, закрепляющему А-киназу». Биология клетки. 92 (1): 27–37. Дои:10.1016 / S0248-4900 (00) 88761-4. PMID  10761695. S2CID  1354592.
7. «Ген Entrez: AKAP8L A-киназа (PRKA), якорный белок 8-подобный».
8. Ян Дж. П., Тан Х, Редди Т. Р., Вонг-Стаал Ф (август 2001 г.). «Картирование функциональных доменов HAP95, белка, который связывает РНК-геликазу A и активирует конститутивный транспортный элемент ретровирусов типа D». Журнал биологической химии. 276 (33): 30694–700. Дои:10.1074 / jbc.M102809200. PMID  11402034.
9. Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 - это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». Журнал клеточной науки. 113, Пет 21: 3703–13. PMID  11034899.
10. Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 beta опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, участвующее в инициации репликации ДНК». Журнал клеточной биологии. 160 (2): 177–88. Дои:10.1083 / jcb.200210026. ЧВК  2172640. PMID  12538639.

внешние ссылки

• Человек AKAP8L расположение генома и AKAP8L страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Уэки Н., Ода Т., Кондо М., Яно К., Ногучи Т., Мурамацу М. (декабрь 1998 г.). «Система отбора генов, кодирующих белки с ядерной мишенью». Природа Биотехнологии. 16 (13): 1338–1342. Дои:10.1038/4315. PMID  9853615. S2CID  20001769.
• Секи Н., Уэки Н., Яно К., Сайто Т., Масухо Ю., Мурамацу М. (2000). «Клонирование кДНК нового человеческого гена NAKAP95, соседа белка 95, заякоренного А-киназой (AKAP95), в области хромосомы 19p13.11-p13.12». Журнал генетики человека. 45 (1): 0031–0037. Дои:10.1007 / с100380070040. PMID  10697960.
• Ян Дж. П., Тан Х, Редди Т. Р., Вонг-Стаал Ф (август 2001 г.). «Картирование функциональных доменов HAP95, белка, который связывает РНК-геликазу A и активирует конститутивный транспортный элемент ретровирусов типа D». Журнал биологической химии. 276 (33): 30694–30700. Дои:10.1074 / jbc.M102809200. PMID  11402034.
• Wistow G, Bernstein SL, Ray S, Wyatt MK, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (июнь 2002 г.). «Анализ экспрессируемых последовательностей радужной оболочки глаза взрослого человека для проекта NEIBank: факторы стероидного ответа и сходство с пигментным эпителием сетчатки». Молекулярное зрение. 8: 185–95. PMID  12107412.
• Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 beta опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, участвующее в инициации репликации ДНК». Журнал клеточной биологии. 160 (2): 177–188. Дои:10.1083 / jcb.200210026. ЧВК  2172640. PMID  12538639.
• Мартинс С.Б., Марстад А., Коллас П. (сентябрь 2003 г.). «Модуляция in vitro взаимодействия между HA95 и LAP2beta посредством передачи сигналов цАМФ». Биохимия. 42 (35): 10456–10461. Дои:10.1021 / bi0350699. PMID  12950172.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–12135. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Sayer JA, Manczak M, Akileswaran L, Reddy PH, Coghlan VM (2006). «Взаимодействие ядерного матричного белка NAKAP с HypA и хантингтином: последствия для ядерной токсичности в патогенезе болезни Хантингтона». Нейромолекулярная медицина. 7 (4): 297–310. Дои:10.1385 / NMM: 7: 4: 297. PMID  16391387. S2CID  22889682.