Тимопоэтин - Thymopoietin

ТМПО
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1GJJ, 1H9F, 1H9E
Идентификаторы
Псевдонимы	ТМПО, CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, тимопоэтин
Внешние идентификаторы	OMIM: 188380 MGI: 106920 ГомолоГен: 31144 Генные карты: ТМПО
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q23.1 Начинать 98,515,512 бп[1] Конец 98,550,379 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 C2 | 10 45,66 см Начинать 91,147,571 бп[2] Конец 91,181,315 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • ламинат • связывание кадгерина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • хроматин • ядерная оболочка • ядро клетки • хромосома • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • внутренняя ядерная мембрана • не мембрана • мембрана Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7112	21917
Ансамбль	ENSG00000120802	ENSMUSG00000019961
UniProt	P42166 P42167	Q61029 Q61033
RefSeq (мРНК)	NM_001032283 NM_001032284 NM_001307975 NM_003276	NM_001080129 NM_001080130 NM_001080131 NM_001080132 NM_001080134 NM_011605 NM_001283048
RefSeq (белок)	NP_001027454 NP_001027455 NP_001294904 NP_003267 NP_001027454.1 NP_001027455.1 NP_001294904.1 NP_001027454.1	NP_001073598 NP_001073599 NP_001073600 NP_001073601 NP_001269977 NP_035735 NP_035735.2
Расположение (UCSC)	Chr 12: 98,52 - 98,55 Мб	Chr 10: 91.15 - 91.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Lamina-ассоциированный полипептид 2 (LAP2), изоформы бета / гамма это белок что у людей кодируется ТМПО ген.^[5][6] LAP2 - это белок внутренней ядерной мембраны (INM).^[7]

Тимопоэтин - это белок, участвующий в индукции CD90 в вилочковая железа. Ген тимопоэтина (ТМПО) кодирует три альтернативно сплайсированных мРНК, кодирующих белки 75 кДа (альфа), 51 кДа (бета) и 39 кДа (гамма), которые повсеместно экспрессируются во всех клетках. Ген TMPO человека отображается на полосе хромосомы 12q22 и состоит из восьми экзонов. ТМПО-альфа присутствует диффузно экспрессируется с ядром клетки, в то время как ТМПО-бета и гамма локализованы на ядерной мембране. TMPO beta является человеческим гомологом мышиного белка LAP2. LAP2 играет роль в регуляции ядерной архитектуры, связывая ламин B1 и хромосомы. Это взаимодействие регулируется фосфорилированием во время митоза. Учитывая ядерную локализацию трех изоформ TMPO, маловероятно, что эти белки играют какую-либо роль в индукции CD90.

Взаимодействия

Тимопоэтин показал взаимодействовать с Барьер к автоинтеграции фактор 1,^[8] AKAP8L,^[9][10] LMNB1^[11][12] и LMNA.^[13][14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120802 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019961 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С., Чан Г.К., Натараджан А., Сикерка Дж. Дж., Гольдштейн Г. (июль 1994 г.). «Три различных тимопоэтина человека получены из альтернативно сплайсированных мРНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (14): 6283–7. Bibcode:1994PNAS ... 91.6283H. Дои:10.1073 / пнас.91.14.6283. ЧВК  44185. PMID  7517549.
6. «Энтрез Джин: ТМПО тимопоэтин».
7. Холмер Л., Ворман Х. Дж. (Ноябрь 2001 г.). «Белки внутренней ядерной мембраны: функции и нацеливание». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 58 (12–13): 1741–7. Дои:10.1007 / PL00000813. PMID  11766875. S2CID  20902309.
8. Фурукава К. (август 1999 г.). «LAP2-связывающий белок 1 (L2BP1 / BAF) является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматин». Журнал клеточной науки. 112 (Pt 15) (15): 2485–92. PMID  10393804.
9. Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 - это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». Журнал клеточной науки. 113 Pt 21 (21): 3703–13. PMID  11034899.
10. Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 beta опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, участвующее в инициации репликации ДНК». Журнал клеточной биологии. 160 (2): 177–88. Дои:10.1083 / jcb.200210026. ЧВК  2172640. PMID  12538639.
11. Фурукава К., Кондо Т. (февраль 1998 г.). «Идентификация домена связывания полипептида-2, связанного с ламиной ламина B-типа». Европейский журнал биохимии / FEBS. 251 (3): 729–33. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2510729.x. PMID  9490046.
12. Фойснер Р., Джерас Л. (июль 1993 г.). «Интегральные мембранные белки ядерной оболочки взаимодействуют с ламинами и хромосомами, и связывание регулируется митотическим фосфорилированием». Клетка. 73 (7): 1267–79. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90355-Т. PMID  8324822.
13. Маркевич Э., Дечат Т., Фойснер Р., Куинлан Р.А., Хатчисон С.Дж. (декабрь 2002 г.). «Lamin A / C-связывающий белок LAP2alpha необходим для ядерного закрепления белка ретинобластомы». Молекулярная биология клетки. 13 (12): 4401–13. Дои:10.1091 / mbc.E02-07-0450. ЧВК  138642. PMID  12475961.
14. Dechat T, Korbei B, Vaughan OA, Vlcek S, Hutchison CJ, Foisner R (октябрь 2000 г.). «Lamina-ассоциированный полипептид 2alpha связывает внутриядерные ламины A-типа». Журнал клеточной науки. 113 Pt 19 (19): 3473–84. PMID  10984438.

дальнейшее чтение

• Харрис К.А., Андрюк П.Дж., Клайн С.В., Мэтью С., Сикерка Дж. Дж., Гольдштейн Г. (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена тимопоэтина человека (ТМПО) и взаимосвязь человеческого ТМПО бета с полипептидом 2, ассоциированным с ламином крысы». Геномика. 28 (2): 198–205. Дои:10.1006 / geno.1995.1131. PMID  8530026.
• Dechat T, Vlcek S, Foisner R (апрель 2000 г.). «Обзор: изоформы полипептида 2, ассоциированные с ламиной, и родственные белки в динамике ядерной структуры, зависимой от клеточного цикла». Журнал структурной биологии. 129 (2–3): 335–45. Дои:10.1006 / jsbi.2000.4212. PMID  10806084.
• Туми Дж. Дж., Гольдштейн Дж., Льюис В. М., Билмир П. М., Good RA (июнь 1977 г.). «Биологические определения уровней тимопоэтина и гормона тимуса в плазме крови человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 74 (6): 2541–5. Bibcode:1977PNAS ... 74.2541T. Дои:10.1073 / пнас.74.6.2541. ЧВК  432209. PMID  302007.
• Хевнер Г.А., Аудья Т., Гольдштейн Г. (февраль 1990 г.). «Пептидные аналоги тимопентина различают специфические особенности рецептора тимопоэтина на двух линиях Т-клеток человека». Регуляторные пептиды. 27 (2): 257–62. Дои:10.1016 / 0167-0115 (90) 90044-В. PMID  2158125. S2CID  12562672.
• Fuccello A, Audhya T, Talle MA, Goldstein G (январь 1984). «Иммуноанализ на тимопоэтин бычьей сыворотки: различение моноклональных антител от спленина». Архивы биохимии и биофизики. 228 (1): 292–8. Дои:10.1016/0003-9861(84)90070-5. PMID  6364989.
• Hara H, Hayashi K, Ohta K, Itoh N, Ohta M (ноябрь 1994 г.). «Новый ген-предшественник тимопоэтина из тимуса человека». Международная биохимия и молекулярная биология. 34 (5): 927–33. PMID  7703909.
• Гольдштейн Г., Шлезингер Д.Х., Аудья Т. (июнь 1994 г.). «Выделение и полная аминокислотная последовательность тимопоэтина и спленина человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (13): 6249. Bibcode:1994PNAS ... 91.6249G. Дои:10.1073 / пнас.91.13.6249. ЧВК  44176. PMID  8016147.
• Харрис Калифорния, Андрюк П.Дж., Клайн С.В., Мэтью С., Сикерка Дж. Дж., Гольдштейн Г. (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена тимопоэтина человека (ТМПО) и взаимосвязь человеческого ТМПО бета с полипептидом 2, ассоциированным с ламином крысы». Геномика. 28 (2): 198–205. Дои:10.1006 / geno.1995.1131. PMID  8530026.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Бергер Р., Теодор Л., Шохам Дж., Гоккель Е., Брок-Симони Ф., Авраам К. Б., Коупленд Н. Г., Дженкинс Н. А., Речави Г., Саймон А. Дж. (Май 1996 г.). «Характеристика и локализация гена полипептида 2, ассоциированного с тимопоэтином / ламиной мыши, и продуктов его альтернативного сплайсинга». Геномные исследования. 6 (5): 361–70. Дои:10.1101 / гр.6.5.361. PMID  8743987.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Фурукава К., Фритце К.Э., Джерас Л. (февраль 1998 г.). «Главный нацеливающий домен на ядерную оболочку LAP2 совпадает с его областью связывания с ламином, но отличается от его домена взаимодействия с хроматином». Журнал биологической химии. 273 (7): 4213–9. Дои:10.1074 / jbc.273.7.4213. PMID  9461618.
• Фурукава К., Кондо Т. (февраль 1998 г.). «Идентификация домена связывания полипептида-2, связанного с ламиной ламина B-типа». Европейский журнал биохимии / FEBS. 251 (3): 729–33. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2510729.x. PMID  9490046.
• Dechat T, Gotzmann J, Stockinger A, Harris CA, Talle MA, Siekierka JJ, Foisner R (август 1998 г.). «Устойчивость LAP2alpha к детергентам и соли в интерфазных ядрах и зависимая от фосфорилирования ассоциация с хромосомами на ранней стадии сборки ядра подразумевает функции в динамике ядерной структуры». Журнал EMBO. 17 (16): 4887–902. Дои:10.1093 / emboj / 17.16.4887. ЧВК  1170818. PMID  9707448.
• Фурукава К. (август 1999 г.). «LAP2-связывающий белок 1 (L2BP1 / BAF) является кандидатом в медиатор взаимодействия LAP2-хроматин». Журнал клеточной науки. 112 (Pt 15) (15): 2485–92. PMID  10393804.
• Вебер П.Дж., Экхард С.П., Гонсер С., Отто Х., Фолкерс Дж., Бек-Сикингер А.Г. (июнь 1999 г.). «О роли тимопоэтинов в пролиферации клеток. Иммунохимические данные о новых членах семейства тимопоэтинов человека». Биологическая химия. 380 (6): 653–60. Дои:10.1515 / BC.1999.081. PMID  10430029. S2CID  12957414.
• Dechat T, Korbei B, Vaughan OA, Vlcek S, Hutchison CJ, Foisner R (октябрь 2000 г.). «Lamina-ассоциированный полипептид 2alpha связывает внутриядерные ламины A-типа». Журнал клеточной науки. 113 Pt 19 (19): 3473–84. PMID  10984438.
• Мартинс С.Б., Эйде Т., Стин Р.Л., Янсен Т., Сколхегг Б.С., Коллас П. (ноябрь 2000 г.). «HA95 - это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». Журнал клеточной науки. 113 Pt 21 (21): 3703–13. PMID  11034899.

внешняя ссылка

• Тимопоэтины в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)