ARF4 - ARF4

ARF4
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1Z6X
Идентификаторы
Псевдонимы	ARF4, ARF2, фактор рибозилирования АДФ 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601177 MGI: 99433 ГомолоГен: 55593 Генные карты: ARF4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 3 (человек)
Конец	57,598,220 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • связывание рецептора эпидермального фактора роста; • Связывание GTP; • GO: 0001948 связывание с белками; • ГТФазная активность; • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов;
Сотовый компонент	• цитозоль; • аппарат Гольджи; • мембрана; • дендритный позвоночник; • внутриклеточный; • мембрана с оборками; • внеклеточная экзосома; • внеклеточный матрикс; • цитоплазма; • клеточная мембрана; • глутаматергический синапс;
Биологический процесс	• АДФ-рибозилирование белков; • передача сигнала, опосредованная малой GTPase; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • регулирование метаболического процесса активных форм кислорода; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • активация активности фосфолипазы D; • транспорт белка; • миграция клеток; • везикулярный транспорт; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER; • транспорт; • развитие дендритного позвоночника; • внутриклеточный транспорт белка; • Гольджи к транспорту через плазматическую мембрану; • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста; • развитие мозга; • обучение; • локализация апикального белка; • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток; • ответ на повреждение аксона; • регулирование организации синапсов; • локализация белка в ресничке; • регулирование постсинаптической организации;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	378
	11843
	ENSG00000168374
	ENSMUSG00000021877
	P18085
	P61750
	NM_001660
	NM_007479
	NP_001651
	NP_031505
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор АДФ-рибозилирования 4 это белок что у людей кодируется ARF4 ген.^[4]^[5]

Функция

Фактор ADP-рибозилирования 4 (ARF4) является членом семейства генов ARF человека. Эти гены кодируют небольшие гуанин-нуклеотид-связывающие белки, которые стимулируют АДФ-рибозилтрансферазную активность холерного токсина и играют роль в везикулярном переносе и являются активаторами фосфолипазы D. Генные продукты включают 5 белков ARF и 11 белков, подобных ARF, и составляют 1 семейство суперсемейства РАН. Белки ARF подразделяются на класс I (ARF1 и ARF3), класс II (ARF4 и ARF5) и класс III (ARF6). Члены каждого класса имеют общую генную организацию. Ген ARF4 занимает приблизительно 12 килобайт и содержит шесть экзонов и пять интронов. ARF4 - наиболее расходящийся член ARF у человека. Сообщалось о конфликтующих позициях карты в 3p14 или 3p21 для этого гена.^[5]

Взаимодействия

ARF4 был показан взаимодействовать с участием Рецептор эпидермального фактора роста^[6] и с Мотивы RVxP.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168374 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Monaco L, Murtagh JJ, Newman KB, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и родственного псевдогена для человеческого фактора ADP-рибозилирования, гуаниннуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (6): 2206–10. Дои:10.1073 / pnas.87.6.2206. ЧВК 53655. PMID 2107548.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор 4 АДФ-рибозилирования ARF4».
^ Ким С.В., Хаяши М., Ло Дж. Ф., Ян И, Ю Дж. С., Ли Дж. Д. (январь 2003 г.). «Малая ГТФаза фактора 4 АДФ-рибозилирования опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимую от рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 278 (4): 2661–8. Дои:10.1074 / jbc.M205819200. PMID 12446727.
^ Ward, Heather H .; Браун-Глаберман, Урса; Ван, Цзин; Морита, Йошико; Alper, Seth L .; Бедрик, Эдвард Дж .; Гаттон, Винсент Х .; Деретич, Душанка; Вандингер-Несс, Анджела (20 июля 2011 г.). «Консервативный сигнал и комплекс GTPase необходимы для цилиарного транспорта полицистина-1». Молекулярная биология клетки. 22 (18): 3289–3305. Дои:10.1091 / mbc.e11-01-0082. ISSN 1059-1524. ЧВК 3172256. PMID 21775626.

дальнейшее чтение

Ли Ф.Дж., Мосс Дж., Воан М. (1992). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) человека и лямблий дополняют функцию ARF в Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 267 (34): 24441–5. PMID 1447192.
Кан Р.А., Керн Ф.Г., Кларк Дж., Гельманн Е.П., Рулка С. (1991). "Факторы ADP-рибозилирования человека. Функционально консервативное семейство GTP-связывающих белков". J. Biol. Chem. 266 (4): 2606–14. PMID 1899243.
Стернс Т., Уиллингем М.С., Ботштейн Д., Кан Р.А. (1990). «Фактор АДФ-рибозилирования функционально и физически связан с комплексом Гольджи». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (3): 1238–42. Дои:10.1073 / pnas.87.3.1238. ЧВК 53446. PMID 2105501.
Воробьева Н., Протопопов А., Протопопова М., Кашуба В., Алликмец Р. Л., Моди В., Забаровский Е. Р., Клейн Г., Киселев Л., Графодацкий А. (1995). «Локализация человеческих генов ARF2 и NCK и 13 других NotI-связывающих клонов на хромосоме 3 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 68 (1–2): 91–4. Дои:10.1159/000133898. PMID 7956370.
Оркл Л., Палмер Д. Д., Амхердт М., Ротман Д. Э. (1993). «Сборка покрытых везикул в Golgi требует только коатомера и белков ARF из цитозоля». Природа. 364 (6439): 732–4. Дои:10.1038 / 364732a0. PMID 8355790. S2CID 4348442.
Хелмс Дж. Б., Палмер Д. Д., Ротман Дж. Э. (1993). «Две разные популяции ARF, связанные с мембранами Гольджи». J. Cell Biol. 121 (4): 751–60. Дои:10.1083 / jcb.121.4.751. ЧВК 2119793. PMID 8491770.
Пардинас Дж., Панг З., Хоутон Дж., Палейвала В., Доннелли Р. Дж., Хаббард К., Смолл М.Б., Озер Х.Л. (1997). «Дифференциальная экспрессия генов в SV40-опосредованной иммортализации человеческих фибробластов». J. Cell. Физиол. 171 (3): 325–35. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4652 (199706) 171: 3 <325 :: AID-JCP11> 3.0.CO; 2-9. PMID 9180902.
Ким HS (1998). «Ген фактора 4 АДФ-рибозилирования (ARF4) человека. Положение на карте 3p14.1». Хромосома Res. 6 (8): 663. Дои:10.1023 / А: 1009230216005. PMID 10099884. S2CID 31829743.
Лебеда Р.А., Хаун Р.С. (1999). «Клонирование и характеристика гена человеческого фактора 4 ADP-рибозилирования». Ген. 237 (1): 209–14. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00290-5. PMID 10524252.
Шин О.Х., Росс А.Х., Михай И., Экстон Дж. Х. (1999). «Идентификация арфофилина, белка-мишени для GTP-связанных факторов ADP-рибозилирования класса II». J. Biol. Chem. 274 (51): 36609–15. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36609. PMID 10593962.
Невривы Д. Д., Петерсон В. Дж., Аврам Д., Измаил Дж. Э., Хансен С. Г., Доуэлл П., Хруби Д. Е., Доусон М. И., Лейд М. (2000). «Взаимодействие GRASP, белка, кодируемого новым геном, индуцированным ретиноевой кислотой, с членами семейства цитохезиновых факторов обмена гуаниновых нуклеотидов». J. Biol. Chem. 275 (22): 16827–36. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16827. PMID 10828067.
Прекерис Р., Дэвис Дж. М., Шеллер Р. Х. (2001). «Идентификация нового связывающего домена Rab11 / 25, присутствующего в белках Eferin и Rip». J. Biol. Chem. 276 (42): 38966–70. Дои:10.1074 / jbc.M106133200. PMID 11481332.
Ким СВ, Хаяши М., Ло Дж. Ф., Ян Й, Ю Дж. С., Ли Дж. Д. (2003). «Малая ГТФаза фактора 4 АДФ-рибозилирования опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимую от рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 278 (4): 2661–8. Дои:10.1074 / jbc.M205819200. PMID 12446727.
Катаяма Т., Имаидзуми К., Ёнда Т., Танигучи М., Хонда А., Манабе Т., Хитоми Дж., Ооно К., Баба К., Мията С., Мацудзаки С., Такацудзи К., Тохьяма М. (2004). «Роль ARF4L в рециклинге между эндосомами и плазматической мембраной». Cell. Мол. Нейробиол. 24 (1): 137–47. Дои:10.1023 / B: CEMN.0000012719.12015.ec. PMID 15049518. S2CID 6273028.

внешние ссылки

Человек ARF4 расположение генома и ARF4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 3 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168374 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid2107548-4] Monaco L, Murtagh JJ, Newman KB, Tsai SC, Moss J, Vaughan M (апрель 1990 г.). «Селективная амплификация мРНК и родственного псевдогена для человеческого фактора ADP-рибозилирования, гуаниннуклеотид-зависимого белкового активатора холерного токсина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (6): 2206–10. Дои:10.1073 / pnas.87.6.2206. ЧВК 53655. PMID 2107548.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: фактор 4 АДФ-рибозилирования ARF4».

[pmid12446727-6] Ким С.В., Хаяши М., Ло Дж. Ф., Ян И, Ю Дж. С., Ли Дж. Д. (январь 2003 г.). «Малая ГТФаза фактора 4 АДФ-рибозилирования опосредует активацию фосфолипазы D2, зависимую от рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 278 (4): 2661–8. Дои:10.1074 / jbc.M205819200. PMID 12446727.

[7] Ward, Heather H .; Браун-Глаберман, Урса; Ван, Цзин; Морита, Йошико; Alper, Seth L .; Бедрик, Эдвард Дж .; Гаттон, Винсент Х .; Деретич, Душанка; Вандингер-Несс, Анджела (20 июля 2011 г.). «Консервативный сигнал и комплекс GTPase необходимы для цилиарного транспорта полицистина-1». Молекулярная биология клетки. 22 (18): 3289–3305. Дои:10.1091 / mbc.e11-01-0082. ISSN 1059-1524. ЧВК 3172256. PMID 21775626.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]