Мотив RVxP - RVxP motif

Мотив RVxP это белковый мотив участвует в локализации белков в реснички.

Реснички сенсорные органелла клеток, неисправность которых может вызвать такие заболевания, как поликистоз почек,[1] нефронофтиз и Синдром Барде-Бидля. Белки, используемые в ресничках, нацелены туда, когда они несут специфические входные сигналы, тогда как белки, не расположенные в ресничках, удаляются или предотвращаются попадание в органеллы.[2] Входные сигналы были обнаружены в цилиарных / жгутиковых белках простейшие Лейшмания и Трипаносома.[3]

Мотив RVxP был впервые описан для PKD2 белок[4] и при вставке в рецептор трансферрина он может нацелить его на реснички.[5] Вероятно, он выполняет свою сигнальную функцию через белковые взаимодействия.[3] хотя точный процесс[6] и где в камере это происходит, неизвестно.[7] Три белка-кандидата, участвующие в «получении» этого сигнала: перицентрин на базальное тело ресничек, внутрижладжковый транспорт белки, такие как IFT57[3] и ARF4[8] в то время как BBSome не взаимодействует с последовательностью.[9] В кинезины KIF17 участвует в транспортировке белка CNGB1, который имеет мотив RVxP, в реснички человека,[4] как есть Rab8a при транспортировке ПКД2.[5] Однако не все цилиарные белки используют мотив RVxP для транспорта;[10] VxPx и Ax (S / A) xQ также были описаны как мотивы, нацеленные на реснички.[6]

Примеры белков с мотивами RVxP, связанными с ресничками:

  • Мышь Ahi1, гомолог человека AHI1, не может локализоваться в ресничках, если его последовательность RVxP мутирована.[11]
  • Caenorhabditis elegans Arl13b требует, чтобы мотив RVxP локализовался в ресничках,[12] собственность, разделяемая людьми ARL13B[13] но в последнем случае спиральный домен тоже нужен.[14]
  • Человек ATP1A4 имеет мотив, похожий на RVxP, который может играть роль в локализации белка в сперма жгутики. Эта последовательность сохраняется среди видов.[15]
  • Человек CNGB1 имеет С-концевой мотив RVxP в аминокислотах 821-824, который в случае мутации заставляет белок не достигать ресничек; Однако необходимы и другие факторы.[4] Этот мотив также обнаружен в гомологах CNGB1 животных.[16]
  • Человек CRMP2 имеет мотив RVxP, но, по-видимому, не требуется для его распространения.[17]
  • FAM154A человека имеет последовательность цилиарной локализации.[18]
  • Тетрахимена GEF1 имеет последовательность локализации в ресничках, и ее мутации заставляют белок больше не локализоваться в ресничках.[19]
  • Человек PDGFRA имеет последовательность RVxP и благодаря ей может локализоваться в ресничках.[20]
  • Человек PKD2 был обнаружен трафик в реснички in vitro полагаться на N-концевой мотив RVxP[21] поскольку мутанты PKD2 с изменениями в этом мотиве не появляются в ресничках.[22] Этот мотив также обнаружен в гомологах PKD2 животных.[3] но не в Гидра.[23] Мутация этой последовательности у мышей с нокаутом PKD1 заставляет PKD2 накапливаться у основания ресничек.[19]

Другие белки, связанные с ресничками, для которых обсуждается наличие мотива RVxP, являются PKD1 и PSEN2.[24]


Рекомендации

  1. ^ Geng et al. 2006 г., п. 1383.
  2. ^ Geng et al. 2006 г., п. 1390.
  3. ^ а б c d Geng et al. 2006 г., п. 1391.
  4. ^ а б c Jenkins et al. 2006 г., п. 1211.
  5. ^ а б Hoffmeister et al. 2011 г., п. 641.
  6. ^ а б Дишингер, Джон Ф .; Ки, Хуи Линн; Дженкинс, Пол М .; Вентилятор, Шулинг; Херд, Тоби У .; Хаммонд, Дженнетта В .; Чыонг, Йен Нху-Тхи; Марголис, Бен; Мартенс, Джеффри Р .; Верхей, Кристен Дж. (Июль 2010 г.). «Вход в реснички мотора кинезина-2 KIF17 регулируется импортином-β2 и RanGTP». Природа клеточной биологии. 12 (7): 709. Дои:10.1038 / ncb2073. ISSN  1476-4679. ЧВК  2896429. PMID  20526328.
  7. ^ Hoffmeister et al. 2011 г., п. 642.
  8. ^ Ward, Heather H .; Браун-Глаберман, Урса; Ван, Цзин; Морита, Йошико; Alper, Seth L .; Бедрик, Эдвард Дж .; Гаттон, Винсент Х .; Деретич, Душанка; Вандингер-Несс, Анджела (20 июля 2011 г.). «Консервативный сигнал и комплекс GTPase необходимы для цилиарного транспорта полицистина-1». Молекулярная биология клетки. 22 (18): 3298. Дои:10.1091 / mbc.e11-01-0082. ISSN  1059-1524. ЧВК  3172256. PMID  21775626.
  9. ^ Wingfield, Jenna L .; Лехтрек, Карл-Фердинанд; Лоренцен, Эсбен (07.12.2018). «Перенос белков цилиарной мембраны с помощью внутрижладжкового транспорта / BBSome machinery». Очерки биохимии. 62 (6): 753–763. Дои:10.1042 / EBC20180030. ISSN  0071-1365. ЧВК  6737936. PMID  30287585.
  10. ^ Йодер, Брэдли К. (1 мая 2007 г.). «Роль первичных ресничек в патогенезе поликистозной болезни почек». Журнал Американского общества нефрологов. 18 (5): 1383. Дои:10.1681 / ASN.2006111215. ISSN  1046-6673. PMID  17429051.
  11. ^ Ланкастер, Мэдлин А .; Шрот, Яна; Глисон, Джозеф Г. (июнь 2011 г.). «Субклеточная пространственная регуляция канонической передачи сигналов Wnt в первичной ресничке». Природа клеточной биологии. 13 (6): 703. Дои:10.1038 / ncb2259. ISSN  1476-4679. ЧВК  3107376. PMID  21602792.
  12. ^ Blacque, O .; Cevik, S .; Clarke, L .; Van Wijk, E .; Сандерс, А .; Van Reeuwijk, J .; Boldt, K .; Ueffing, M .; Roepman, R .; Кремер, Х. (16 ноября 2012 г.). «Дифференциальные требования компонентов модуля цилиогенности / цилиопатии в ограничении Arl13b, ассоциированного с синдромом Жубера, Inv-подобным ресничным компартментом C. elegans». Реснички. 1 (1): O8. Дои:10.1186 / 2046-2530-1-S1-O8. ISSN  2046-2530.
  13. ^ Нодзаки, Шохей; Като, Йохей; Терада, Масая; Мичисака, Саки; Фунабаши, Теруки; Такахаши, Сенье; Контани, Кенджи; Накаяма, Кадзухиса (1 февраля 2017 г.). «Регуляция переноса ретроградных белков ресничек с помощью белков синдрома Жубера ARL13B и INPP5E». Журнал клеточной науки. 130 (3): 563–576. Дои:10.1242 / jcs.197004. ISSN  0021-9533. PMID  27927754.
  14. ^ Ревенкова, Екатерина; Лю, Цин; Гуселла, Дж. Лука; Иомини, Карло (1 мая 2018 г.). «Белок синдрома Жубера ARL13B связывает тубулин для поддержания равномерного распределения белков вдоль цилиарной мембраны». Журнал клеточной науки. 131 (9): 3. Дои:10.1242 / jcs.212324. ISSN  0021-9533. ЧВК  5992585. PMID  29592971.
  15. ^ Laird, Джозеф Дж .; Пан, юань; Модесту, Модестос; Ямагути, Дэвид М .; Песня, Хунмань; Соколов, Максим; Бейкер, Шейла А. (декабрь 2015 г.). «Идентификация сигнала нацеливания VxP в жгутиковой Na / K -АТФазе». Трафик. 16 (12): 1249. Дои:10.1111 / tra.12332. PMID  26373354.
  16. ^ Jenkins et al. 2006 г., п. 1213.
  17. ^ Оу, Янг; Чжан, Инь; Ченг, Мин; Раттнер, Джером Б .; Добрински, Инна; ван дер Хорн, Франс А. (21 ноября 2012 г.). «Нацеливание CRMP-2 на первичную ресничку модулируется GSK-3β». PLOS ONE. 7 (11): e48773. Bibcode:2012PLoSO ... 748773O. Дои:10.1371 / journal.pone.0048773. ISSN  1932-6203. ЧВК  3504062. PMID  23185275.
  18. ^ Даше, Дени; Роджер, Бенуа; Боск, Кристоф; Ландрейн, Николас; Рош, Эммануэль; Шансель, Люси; Триан, Томас; Андрие, Энни; Папаксантос-Рош, Алин; Мартан, Роджер; Робинсон, Деррик Р .; Бонхиверс, Мелани (1 апреля 2015 г.). «Человеческий FAM154A (SAXO1) представляет собой стабилизирующий микротрубочки белок, специфичный для ресничек и родственных структур». Журнал клеточной науки. 128 (7): 1295. Дои:10.1242 / jcs.155143. ISSN  0021-9533. PMID  25673876.
  19. ^ а б Белл, Аарон Дж .; Герра, Чарльз; Фунг, Винсент; Наир, Сарасвати; Сетхарам, Равираджа; Сатир, Питер (август 2009). «GEF1 - это цилиарный Sec7 GEF Tetrahymena thermophila». Подвижность клеток и цитоскелет. 66 (8): 483–499. Дои:10.1002 / см. 20348. ISSN  0886-1544. ЧВК  2767173. PMID  19267341.
  20. ^ Christensen, Søren T .; Pedersen, Stine F .; Сатир, Питер; Veland, Iben R .; Шнайдер, Линда (1 января 2008 г.). «Глава 10. Первичные сигнальные пути координирования ресничек в контроле клеточного цикла и миграции во время развития и восстановления тканей». Актуальные темы биологии развития. Академическая пресса. 85: 271.
  21. ^ Geng et al. 2006 г., п. 1389.
  22. ^ Geng et al. 2006 г., п. 1393.
  23. ^ Маклафлин, Сьюзен (11 января 2017 г.). «Доказательства того, что полицистины участвуют в выделении гидрокнидоцитов». Неврология беспозвоночных. 17 (1): 4. Дои:10.1007 / s10158-016-0194-3. ISSN  1439-1104. PMID  28078622.
  24. ^ Пирринг, Джиллиан Н .; Агустин, Ховенал Т. Сан; Лобанова Екатерина С .; Габриэль, Кристофер Дж .; Lieu, Eric C .; Монис, Уильям Дж .; Застрял, Майкл В .; Стритматтер, Лара; Джабер, Самер М .; Аршавский, Вадим Юрьевич .; Пазур, Грегори Дж. (14 апреля 2017 г.). «Потеря Arf4 вызывает тяжелую дегенерацию экзокринной части поджелудочной железы, но не кистозную болезнь почек или дегенерацию сетчатки». PLOS Genetics. 13 (4): 2. Дои:10.1371 / journal.pgen.1006740. ISSN  1553-7404. ЧВК  5409180. PMID  28410364.

Источники