ARHGAP4 - ARHGAP4

ARHGAP4
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EPD
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP4, C1, RGC1, RhoGAP4, SrGAP4, p115, Rho GTPase, активирующий белок 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 300023 MGI: 2159577 ГомолоГен: 20403 Генные карты: ARHGAP4
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начните 153,907,367 бп[1] Конец 153,934,999 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A7.3 Начните 73,891,442 бп[2] Конец 73,921,870 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание Rac GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитозоль • аппарат Гольджи • конус роста • микротрубочки • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция миграции фибробластов • развитие нервной системы • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • отрицательное регулирование миграции клеток • организация цитоскелета • Передача сигнала белка Rho • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • отрицательная регуляция удлинения аксона • преобразование сигнала • положительное регулирование передачи сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	393	171207
Ансамбль	ENSG00000089820	ENSMUSG00000031389
UniProt	P98171	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001666 NM_001164741	NM_001162423 NM_001162424 NM_138630
RefSeq (белок)	NP_001158213 NP_001657	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 153.91 - 153.93 Мб	Chr X: 73,89 - 73,92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Rho GTPase-активирующий белок 4 является фермент что у людей кодируется ARHGAP4 ген.^[5][6] Было показано, что он регулирует подвижность клеток и рост аксонов in vitro.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000089820 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031389 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tribioli C, Droetto S, Bione S, Cesareni G, Torrisi MR, Lotti LV, Lanfrancone L, Toniolo D, Pelicci P (март 1996). «Связанный с Х-хромосомой ген, кодирующий белок с характеристиками rhoGAP, преимущественно экспрессируемый в гемопоэтических клетках». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (2): 695–9. Дои:10.1073 / пнас.93.2.695. ЧВК  40115. PMID  8570618.
6. «Ген Entrez: ARHGAP4 Rho GTPase, активирующий белок 4».
7. Vogt, DL; Серый, CD; Янг Ws, 3-й; Orellana, SA; Malouf, AT (2007). «ARHGAP4 - ЭТО НОВЫЙ RHOGAP, КОТОРЫЙ СПОСОБСТВУЕТ ИНГИБИРОВАНИЮ ПОДВИЖНОСТИ КЛЕТОК И ВЫХОДА АКСОНОВ». Молекулярная и клеточная нейронауки. 36 (3): 332–42. Дои:10.1016 / j.mcn.2007.07.004. ЧВК  2111057. PMID  17804252.

внешняя ссылка

• Человек ARHGAP4 расположение генома и ARHGAP4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Tribioli C, Mancini M, Plassart E, et al. (1995). «Выделение новых генов в дистальном Xq28: транскрипционная карта и идентификация человеческого гомолога ARD1 N-ацетилтрансферазы Saccharomyces cerevisiae». Гм. Мол. Genet. 3 (7): 1061–7. Дои:10.1093 / hmg / 3.7.1061. PMID  7981673.
• Нагасе Т., Секи Н., Танака А. и др. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
• Бреннер В., Ньякатура Г., Розенталь А., Платцер М. (1997). «Геномная организация двух новых генов на человеческом Xq28: компактное расположение IDH гамма и TRAP дельта голова к голове сохраняется у крысы и мыши». Геномика. 44 (1): 8–14. Дои:10.1006 / geno.1997.4822. PMID  9286695.
• Зубер Дж., Черница О.И., Хинцманн Б. и др. (2000). «Полногеномный обзор мишеней для трансформации RAS». Nat. Genet. 24 (2): 144–52. Дои:10.1038/72799. PMID  10655059.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Демура М., Такеда Ю., Йонеда Т. и др. (2002). «Два новых типа делеции смежных генов AVPR2 и ARHGAP4 у неродственных японских родственников с нефрогенным несахарным диабетом». Гм. Мутат. 19 (1): 23–9. Дои:10.1002 / humu.10011. PMID  11754100.
• Christerson LB, Gallagher E, Vanderbilt CA и др. (2002). «Белок, активирующий ГТФазу p115 Rho, взаимодействует с MEKK1». J. Cell. Физиол. 192 (2): 200–8. Дои:10.1002 / jcp.10125. PMID  12115726.
• Фолетта В.К., Браун Ф.Д., Янг В.С. (2003). «Клонирование крысиного ARHGAP4 / C1, члена семейства RhoGAP, экспрессируемого в нервной системе, которая совместно с комплексом Гольджи и микротрубочками» (PDF). Brain Res. Мол. Мозг Res. 107 (1): 65–79. Дои:10.1016 / S0169-328X (02) 00448-5. PMID  12414125.
• Содерлинг С.Х., Биннс К.Л., Уэйман Г.А. и др. (2003). «Компонент WRP комплекса WAVE-1 ослабляет Rac-опосредованную передачу сигналов». Nat. Cell Biol. 4 (12): 970–5. Дои:10.1038 / ncb886. PMID  12447388.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Като М, Като М (2004). «Ген FNBP2 на хромосоме 1q32.1 человека кодирует белок семейства ARHGAP с доменами FCH, FBH, RhoGAP и SH3». Int. J. Mol. Med. 11 (6): 791–7. Дои:10.3892 / ijmm.11.6.791. PMID  12736724.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.