ARHGEF5 - ARHGEF5

ARHGEF5
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF5, GEF5, P60, TIM, TIM1, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 600888 MGI: 1858952 ГомолоГен: 66300 Генные карты: ARHGEF5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q35 Начинать 144,355,288 бп[1] Конец 144,380,632 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 B2.1 Начинать 43,265,582 бп[2] Конец 43,289,320 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • связывание липидов • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho Сотовый компонент • цитоплазма • проекция клетки • клеточная мембрана • нуклеоплазма • соединение клеток • подосомы • ядро клетки • периферия клетки • цитозоль Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция организации актинового цитоскелета • положительная регуляция активности киназы JUN • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • позитивная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • положительная регуляция сборки подосом • миелоидный хемотаксис дендритных клеток • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительное регулирование импорта белка • регуляция каскада ERK1 и ERK2 • регуляция передачи сигнала белка Rho • регуляция организации цитоскелета • организация актинового цитоскелета • положительное регулирование сборки напряженного волокна • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7984	54324
Ансамбль	ENSG00000050327 ENSG00000284933	ENSMUSG00000033542
UniProt	Q12774	E9Q7D5
RefSeq (мРНК)	NM_001002861 NM_005435	NM_133674
RefSeq (белок)	NP_005426	NP_598435
Расположение (UCSC)	Chr 7: 144,36 - 144,38 Мб	Chr 6: 43.27 - 43.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 5 это белок что у людей кодируется ARHGEF5 ген.^[5][6][7]

Rho GTPases играют фундаментальную роль во многих клеточных процессах, инициируемых внеклеточными стимулами, которые работают через G-белковые рецепторы. Кодируемый белок может образовывать комплекс с G белки и стимулируют Rho-зависимые сигналы. Этот белок может участвовать в контроле цитоскелет организация.^[7]

Рекомендации

1. ENSG00000284933 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000050327, ENSG00000284933 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033542 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чан А.М., Макговерн Э.С., Каталано Дж., Флеминг Т.П., Мики Т. (апрель 1994 г.). «Экспрессионное клонирование кДНК нового онкогена с последовательностью, подобной регуляторам малых GTP-связывающих белков». Онкоген. 9 (4): 1057–63. PMID  8134109.
6. Такай С., Чан А.М., Ямада К., Мики Т. (октябрь 1995 г.). «Отнесение протоонкогена TIM человека к 7q33 → q35». Рак Genet Cytogenet. 83 (1): 87–9. Дои:10.1016 / S0165-4608 (95) 00017-8. PMID  7656213.
7. "Ген Entrez: ARHGEF5 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 5".

внешняя ссылка

• Человек ARHGEF5 расположение генома и ARHGEF5 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Снайдер Дж. Т., Уортилейк Д. К., Россман К. Л. и др. (2002). «Структурная основа для избирательной активации Rho GTPases факторами обмена Dbl». Nat. Struct. Биол. 9 (6): 468–75. Дои:10.1038 / nsb796. PMID  12006984. S2CID  13161854.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 171–84. PMID  12107413.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Умецу Д.Т., Декрюфф Р.Х. (2005). «Регулирование толерантности в дыхательных путях: ТИМ-1, гигиена и окружающая среда». Анна. Акад. Наука. 1029 (1): 88–93. Дои:10.1196 / летопись.1309.012. PMID  15681748. S2CID  38149688.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л. и др. (2005). «Масс-спектрометрия с временным разрешением сайтов фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (9): 1240–50. Дои:10.1074 / mcp.M500089-MCP200. PMID  15951569.