ASRGL1 - ASRGL1

ASRGL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3TKJ, 4ET0, 4O0C, 4O0D, 4O0E, 4O0F, 4O0G, 4O0H, 4OSX, 4OSY, 4ПВП, 4PVQ, 4ПВР, 4ПВС, 4ZM9
Идентификаторы
Псевдонимы	ASRGL1, ALP, ALP1, CRASH, аспарагиназа, подобная 1, аспарагиназа и изоаспартилпептидаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609212 MGI: 1913764 ГомолоГен: 11825 Генные карты: ASRGL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.3 Начинать 62,337,448 бп[1] Конец 62,393,412 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • бета-аспартил-пептидазная активность • гидролазная активность • Активность N4- (бета-N-ацетилглюкозаминил) -L-аспарагиназы • активность аспарагиназы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • ядро клетки • фоторецептор внутренний сегмент Биологический процесс • катаболический процесс аспарагина через L-аспартат • Катаболический процесс L-фенилаланина • протеолиз • созревание белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80150	66514
Ансамбль	ENSG00000162174	ENSMUSG00000024654
UniProt	Q7L266	Q8C0M9
RefSeq (мРНК)	NM_001083926 NM_025080	NM_025610
RefSeq (белок)	NP_001077395 NP_079356	NP_079886
Расположение (UCSC)	Chr 11: 62.34 - 62.39 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

L-аспарагиназа является фермент что у людей кодируется ASRGL1 ген.^[4]

Функция

Белок ASRGL1 состоит из 308 аминокислот и активируется путем авторасщепления по аминокислоте 168 с образованием альфа- и бета-цепей, которые могут димеризоваться в гетеродимер.^[5] Фермент ASRGL1 обладает активностью как L-аспарагиназы, так и бета-аспартилпептидазы и может участвовать в выработке L-аспартата, который может действовать как возбуждающий нейротрансмиттер в некоторых областях мозга.

Согласно профилированию на основе антител и анализу транскриптомики, белок ASRGL1 присутствует во всех проанализированных тканях человека, с наибольшей экспрессией в головном мозге, в женских тканях, таких как шейка матки и фаллопиевых труб, а в мужских тканях как яички.^[6] На основе конфокальная микроскопия ASRGL1 в основном локализован на микротрубочки.^[7]

Клиническое значение

ASRGL1 высоко экспрессируется в нормальных эндометрий и дифференциально выражается в рак эндометрия. Потеря экспрессии ASRGL1 является неблагоприятным прогностическим признаком для пациентов с раком эндометрия.^[8][9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162174 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ген Entrez: аспарагиназа ASRGL1, подобная 1».
5. Ли, Вэньцзун; Кантор, Джейсон Р .; Yogesha, S.D .; Ян, Ширли; Чантранупонг, Линн; Лю, Джун Цинся; Аньелло, Джулия; Георгиу, Джордж; Стоун, Эверетт М. (2012-11-16). «Разобщение внутримолекулярного процессинга и гидролиза субстрата в N-концевой нуклеофильной гидролазе hASRGL1 путем круговой перестановки». ACS Химическая биология. 7 (11): 1840–1847. Дои:10.1021 / cb300232n. ISSN  1554-8929. ЧВК  3514461. PMID  22891768.
6. «Тканевая экспрессия ASRGL1 - Резюме - Атлас белков человека». www.proteinatlas.org. Получено 2017-10-03.
7. "Атлас клеток - ASRGL1 - Атлас белков человека". www.proteinatlas.org. Получено 2017-10-03.
8. «Экспрессия ASRGL1 при раке эндометрия - Атлас белков человека». www.proteinatlas.org. Получено 2017-10-03.
9. Edqvist, Per-Henrik D .; Хувила, Ютта; Форсстрём, Бьёрн; Талве, Лаури; Карпен, Олли; Salvesen, Helga B .; Кракстад, Камилла; Гренман, Сейджа; Йоханнессон, Хенрик (2015). «Потеря экспрессии ASRGL1 является независимым биомаркером выживаемости при эндометриоидной карциноме эндометрия». Гинекологическая онкология. 137 (3): 529–537. Дои:10.1016 / j.ygyno.2015.03.055. PMID  25858696.

внешняя ссылка

• Выражение ASRGL1 в Атлас белков человека
• Человек ASRGL1 расположение генома и ASRGL1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Ким Дж. М., Ли К. Х., Чон Й. Дж., О Дж. Х., Чон С. Ю., Сонг И. С., Ким Дж. М., Ли Д.С., Ким Н.С. (2006). «Идентификация генов, связанных с болезнью Паркинсона, с использованием тегов экспрессированной последовательности». ДНК Res. 13 (6): 275–86. Дои:10.1093 / dnares / dsl016. PMID  17213182.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Буш Л.А., Герр Дж. К., Волкович М., Шерман Н. Э., Шор А, Фликингер С. Дж. (2002). «Новый аспарагиназоподобный белок является аутоантигеном сперматозоидов крыс». Мол. Репрод. Dev. 62 (2): 233–47. Дои:10.1002 / мрд.10092. PMID  11984834. S2CID  32206911.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.