AXIN1 - AXIN1 - Wikipedia

AXIN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1DK8, 1EMU, 1O9U, 3ZDI, 4B7T, 4НМ0, 4НМ3, 4НМ5, 4НМ7, 4NU1
Идентификаторы
Псевдонимы	AXIN1, AXIN, PPP1R49, аксин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603816 MGI: 1096327 ГомолоГен: 2614 Генные карты: AXIN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p13.3 Начинать 287,440 бп[1] Конец 352,723 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 13,07 см Начинать 26,138,688 бп[2] Конец 26,195,811 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание бета-катенина • активность гомодимеризации белков • Привязка I-SMAD • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • активность каркаса сигнального комплекса рецепторов • Привязка SMAD • связывание убиквитин-протеин-лигазы • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • связывание протеинкиназы • Связывание с повторным доменом броненосца • идентичное связывание с белками • сигнальный адаптер активности Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • латеральная плазматическая мембрана • мембрана • клеточная мембрана • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • комплекс разрушения бета-катенина • периферия клетки Биологический процесс • спецификация переднего / заднего рисунка переднего мозга • отрицательная регуляция дифференцировки жировых клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • формирование обонятельной плакоды • положительная регуляция белкового катаболического процесса • активация активности киназы JUN • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • эмбриональный морфогенез глаза • отрицательная регуляция сигнального пути Wnt • положительное регулирование каскада JNK • отрицательная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • формирование оптических плакод • определение левой / правой симметрии • канонический путь передачи сигналов Wnt, участвующий в формировании переднего / заднего паттерна нервной пластинки • положительная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • положительная регуляция убиквитинирования белков, участвующих в убиквитин-зависимом катаболическом процессе белков • организация цитоплазматических микротрубочек • канонический путь передачи сигналов Wnt • морфогенез эмбрионального скелетного сустава • формирование осевой мезодермы • положительная регуляция убиквитинирования белков • активация активности протеинкиназы • развитие мышечных клеток • Wnt-активируемый сигнальный путь, участвующий в обязательстве судьбы нейронов переднего мозга • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • преобразование сигнала • апоптотический процесс • разборка комплекса деструкции бета-катенина • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • Сигнальный путь Wnt • сборка комплекса деструкции бета-катенина • регуляция сигнального пути Wnt • регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • сборка клеточного макромолекулярного комплекса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8312	12005
Ансамбль	ENSG00000103126	ENSMUSG00000024182
UniProt	O15169	O35625
RefSeq (мРНК)	NM_003502 NM_181050	NM_001159598 NM_009733
RefSeq (белок)	NP_003493 NP_851393	NP_001153070 NP_033863
Расположение (UCSC)	Chr 16: 0,29 - 0,35 Мб	Chr 17: 26.14 - 26,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Аксин-1 это белок что у людей кодируется AXIN1 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует цитоплазматический белок, который содержит домен регуляции передачи сигналов G-белка (RGS) и растрепанный и домен axin (DIX). Кодируемый белок взаимодействует с полипозом кишечной палочки аденоматоза, катенин (кадгерин-ассоциированный белок) бета-1, киназа гликогенсинтазы 3 бета, протеинфосфатаза 2 и сама. Этот белок функционирует как негативный регулятор в семействе сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, член 1 (WNT ) сигнальный путь и может вызывать апоптоз. Кристаллическая структура части этого белка, отдельно или в комплексе с другими белками, была решена. Мутации в этом гене были связаны с гепатоцеллюлярной карциномой, гепатобластомами, эндометриоидными аденокарциномами яичников и медуллобластомами. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Структура

Полноразмерный человеческий белок содержит 862 аминокислоты с (предсказанной) молекулярной массой 96 кДа. N-концевой домен RGS, пептид Axin1, взаимодействующий с киназой GSK3, и гомологи C-концевых доменов DIX были решены с атомарным разрешением. Большие центральные области, подавляющие WNT, были охарактеризованы как изначально неупорядоченные с помощью биофизических экспериментов и биоинформатического анализа.^[7] Биофизическая дестабилизация свернутого домена RGS индуцирует образование наноагрегатов, которые обнажают и локально концентрируют внутренне неупорядоченные области, которые, в свою очередь, неправильно регулируют передачу сигналов Wnt. Многие другие крупные IDP (внутренне нарушенные белки) подвержены миссенс-мутациям, таким как BRCA1, Аденоматозный полипоз кишечной палочки, CREB-связывающий белок / (CBP) и могут быть затронуты аналогичным образом миссенс-мутациями их свернутых доменов.^[8]

Взаимодействия

AXIN1 был показан взаимодействовать с:

• APC,^[9]
• CTNNB1,^[9][10]
• CSNK1E,^[11]
• CSNK1A1,^[11]
• DVL1,^[12][13]
• GSK3B,^[9][14]
• LRP5,^[12][15]
• MAP3K1,^[11][16]
• PPP2R5A,^[17] и
• TSC2.^[14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103126 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024182 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цзэн Л., Фаготто Ф., Чжан Т., Хсу В., Васичек Т.Дж., Перри В.Л., Ли Дж.Дж., Тилгман С.М., Гумбинер Б.М., Костантини Ф. (август 1997 г.). «Локус Fused мыши кодирует Axin, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, который регулирует формирование эмбриональной оси». Клетка. 90 (1): 181–92. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80324-4. PMID  9230313. S2CID  10565695.
6. "Entrez Gene: AXIN1 аксин 1".
7. Ноутсу М., Дуарте А.М., Анвариан З., Диденко Т., Минде Д.П., Купер И., де Риддер И., Ойкономоу С., Фридлер А., Боеленс Р., Рюдигер С.Г., Морис М.М. (2011). «Критические области каркаса опухолевого супрессора Axin1 изначально развернуты». Дж Мол Биол. 405 (3): 773–86. Дои:10.1016 / j.jmb.2010.11.013. PMID  21087614.
8. Анвариан З., Ноджима Х., ван Каппель Э.С., Мадл Т., Спит М, Виртлер М., Джорденс I, Лоу Т.Ю., ван Шерпензил Р.С., Купер I, Рихтер К., Хек А.Дж., Боеленс Р., Винсент Дж. П., Рюдигер С. Г., Морис М. М. ( 2016). «Раковые мутанты Axin образуют наноагрегаты, чтобы перепрограммировать сигнальную сеть Wnt». Нат Структ Мол Биол. 23 (4): 324–32. Дои:10.1038 / nsmb.3191. PMID  26974125. S2CID  30761541.
9. Накамура Т., Хамада Ф., Ишидате Т., Анаи К., Кавахара К., Тоошима К., Акияма Т. (июнь 1998 г.). «Аксин, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, взаимодействует с бета-катенином, GSK-3beta и APC и снижает уровень бета-катенина». Гены Клетки. 3 (6): 395–403. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1998.00198.x. PMID  9734785. S2CID  10875463.
10. Хосевар Б.А., Мо Ф., Реннольдс Дж. Л., Моррис С. М., Купер Дж. А., Хоу PH (июнь 2003 г.). «Регулирование пути передачи сигналов Wnt с помощью disabled-2 (Dab2)». EMBO J. 22 (12): 3084–94. Дои:10.1093 / emboj / cdg286. ЧВК  162138. PMID  12805222.
11. Чжан Ю., Цю В.Дж., Чан С.К., Хан Дж., Хе Икс, Лин С.К. (май 2002 г.). «Казеинкиназа I и казеинкиназа II по-разному регулируют функцию аксина в путях Wnt и JNK». J. Biol. Chem. 277 (20): 17706–12. Дои:10.1074 / jbc.M111982200. PMID  11884395.
12. Ким MJ, Чиа IV, Костантини Ф (ноябрь 2008 г.). «Сайты-мишени SUMOylation на С-конце защищают Axin от убиквитинирования и придают стабильность белка». FASEB J. 22 (11): 3785–94. Дои:10.1096 / fj.08-113910. ЧВК  2574027. PMID  18632848.
13. Li L, Yuan H, Weaver CD, Mao J, Farr GH, Sussman DJ, Jonkers J, Kimelman D, Wu D (август 1999). «Axin и Frat1 взаимодействуют с dvl и GSK, соединяя Dvl с GSK в Wnt-опосредованной регуляции LEF-1». EMBO J. 18 (15): 4233–40. Дои:10.1093 / emboj / 18.15.4233. ЧВК  1171499. PMID  10428961.
14. Мак BC, Такемару К., Kenerson HL, Moon RT, Yeung RS (февраль 2003 г.). «Комплекс туберин-гамартин отрицательно регулирует сигнальную активность бета-катенина». J. Biol. Chem. 278 (8): 5947–51. Дои:10.1074 / jbc.C200473200. PMID  12511557.
15. Мао Дж., Ван Дж., Лю Б., Пан В., Фарр Г. Х., Флинн С., Юань Х, Такада С., Кимелман Д., Ли Л., Ву Д. (апрель 2001 г.). «Белок-5, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности, связывается с Axin и регулирует канонический путь передачи сигналов Wnt». Мол. Клетка. 7 (4): 801–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00224-6. PMID  11336703.
16. Чжан Ю., Нео С.Ю., Хань Дж., Лин С.К. (август 2000 г.). «Выбор димеризации контролирует способность аксина и растрепанного активировать c-Jun N-концевую киназу / стресс-активируемую протеинкиназу». J. Biol. Chem. 275 (32): 25008–14. Дои:10.1074 / jbc.M002491200. PMID  10829020.
17. Ямамото Х., Хинои Т., Мичиуэ Т., Фукуи А., Усуи Х., Янссенс В., Ван Хоф С., Горис Дж., Асашима М., Кикучи А. (июль 2001 г.). «Ингибирование пути передачи сигнала Wnt субъединицей PR61 протеинфосфатазы 2A». J. Biol. Chem. 276 (29): 26875–82. Дои:10.1074 / jbc.M100443200. PMID  11297546.

дальнейшее чтение

• Сегдицас S, Томлинсон I (2007). «Колоректальный рак и генетические изменения пути Wnt». Онкоген. 25 (57): 7531–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1210059. PMID  17143297.
• Флинт Дж., Томас К., Миклем Дж., Рейнхэм Х, Кларк К., Доггетт Н.А., Кинг А., Хиггс Д.Р. (1997). «Взаимосвязь между структурой хромосом и функцией в теломерной области человека». Nat. Genet. 15 (3): 252–7. Дои:10.1038 / ng0397-252. PMID  9054936. S2CID  20630444.
• Икеда С., Кишида С., Ямамото Х., Мураи Х., Кояма С., Кикучи А. (1998). «Аксин, отрицательный регулятор пути передачи сигналов Wnt, образует комплекс с GSK-3beta и бета-катенином и способствует GSK-3beta-зависимому фосфорилированию бета-катенина». EMBO J. 17 (5): 1371–84. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1371. ЧВК  1170485. PMID  9482734.
• Харт М.Дж., де лос Сантос Р., Альберт И.Н., Рубинфельд Б., Полакис П. (1998). «Подавление бета-катенина человеческим аксином и его связь с супрессором опухолей APC, бета-катенином и GSK3 бета». Curr. Биол. 8 (10): 573–81. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70226-X. PMID  9601641. S2CID  2863360.
• Накамура Т., Хамада Ф., Ишидате Т., Анаи К., Кавахара К., Тойошима К., Акияма Т. (1998). «Аксин, ингибитор пути передачи сигналов Wnt, взаимодействует с бета-катенином, GSK-3beta и APC и снижает уровень бета-катенина». Гены Клетки. 3 (6): 395–403. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1998.00198.x. PMID  9734785. S2CID  10875463.
• Сюй В., Цзэн Л., Костантини Ф (1999). «Идентификация домена аксина, который связывается с серин / треониновой протеинфосфатазой 2A и самосвязывающимся доменом». J. Biol. Chem. 274 (6): 3439–45. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3439. PMID  9920888.
• Китагава М., Хатакеяма С., Сиране М., Мацумото М., Исида Н., Хаттори К., Накамичи И., Кикучи А., Накаяма К., Накаяма К. (1999). «Белок F-бокса, FWD1, опосредует убиквитин-зависимый протеолиз бета-катенина». EMBO J. 18 (9): 2401–10. Дои:10.1093 / emboj / 18.9.2401. ЧВК  1171323. PMID  10228155.
• Фаготто Ф, Джо Э, Зенг Л., Курт Т., Джоос Т., Кауфманн К., Костантини Ф (1999). «Домены аксина, участвующие в белок-белковых взаимодействиях, ингибировании пути Wnt и внутриклеточной локализации». J. Cell Biol. 145 (4): 741–56. Дои:10.1083 / jcb.145.4.741. ЧВК  2133179. PMID  10330403.
• Кодама С., Икеда С., Асахара Т., Кишида М., Кикучи А. (1999). «Аксин напрямую взаимодействует с плакоглобином и регулирует его стабильность». J. Biol. Chem. 274 (39): 27682–8. Дои:10.1074 / jbc.274.39.27682. PMID  10488109.
• Джо Э, Ломвардас С., Костантини Ф (2000). «Сайт фосфорилирования GSK3beta в аксине модулирует взаимодействие с бета-катенином и экспрессию гена, опосредованную Tcf». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 266 (1): 28–35. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1760. PMID  10581160.
• Икеда С., Кишида М., Мацуура Ю., Усуи Н., Кикучи А. (2000). «GSK-3beta-зависимое фосфорилирование продукта гена аденоматозного полипоза coli может модулироваться бета-катенином и протеинфосфатазой 2A в комплексе с аксином». Онкоген. 19 (4): 537–45. Дои:10.1038 / sj.onc.1203359. PMID  10698523.
• Satoh S, Daigo Y, Furukawa Y, Kato T, Miwa N, Nishiwaki T, Kawasoe T, Ishiguro H, Fujita M, Tokino T, Sasaki Y, Imaoka S, Murata M, Shimano T, Yamaoka Y, Nakamura Y (2000) . «Мутации AXIN1 в гепатоцеллюлярной карциноме и подавление роста раковых клеток посредством вирус-опосредованного переноса AXIN1». Nat. Genet. 24 (3): 245–50. Дои:10.1038/73448. PMID  10700176. S2CID  27531668.
• Спинк К.Е., Полакис П., Вайс В.И. (2000). «Структурные основы взаимодействия Аксин-аденоматозный полипоз кишечной палочки». EMBO J. 19 (10): 2270–9. Дои:10.1093 / emboj / 19.10.2270. ЧВК  384355. PMID  10811618.
• Чжан И, Нео С.Ю., Хань Дж., Лин СК (2000). «Выбор димеризации контролирует способность аксина и растрепанного активировать c-Jun N-концевую киназу / стресс-активируемую протеинкиназу». J. Biol. Chem. 275 (32): 25008–14. Дои:10.1074 / jbc.M002491200. PMID  10829020.
• Дэниэлс Р.Дж., Педен Дж.Ф., Ллойд С., Хорсли С.В., Кларк К., Туфарелли С., Кирни Л., Пряжка В.Дж., Доггетт Н.А., Флинт Дж., Хиггс Д.Р. (2001). «Последовательность, структура и патология полностью аннотированного конца 2 Mb короткого плеча хромосомы 16 человека». Гм. Мол. Genet. 10 (4): 339–52. Дои:10.1093 / hmg / 10.4.339. PMID  11157797.
• Ямамото Х., Хинои Т., Мичиуэ Т, Фукуи А., Усуи Х., Янссенс В., Ван Хоф С., Горис Дж., Асашима М., Кикучи А. (2001). «Ингибирование пути передачи сигнала Wnt субъединицей PR61 протеинфосфатазы 2A». J. Biol. Chem. 276 (29): 26875–82. Дои:10.1074 / jbc.M100443200. PMID  11297546.
• Мао Дж., Ван Дж., Лю Б., Пан В., Фарр Г. Х., Флинн С., Юань Х, Такада С., Кимелман Д., Ли Л., Ву Д. (2001). «Белок-5, связанный с рецептором липопротеинов низкой плотности, связывается с Axin и регулирует канонический путь передачи сигналов Wnt». Мол. Клетка. 7 (4): 801–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00224-6. PMID  11336703.
• Фурухаши М., Яги К., Ямамото Х., Фурукава Й., Шимада С., Накамура Ю., Кикучи А., Миядзоно К., Като М. (2001). «Аксин способствует активации Smad3 в сигнальном пути трансформирующего фактора роста бета». Мол. Клетка. Биол. 21 (15): 5132–41. Дои:10.1128 / MCB.21.15.5132-5141.2001. ЧВК  87238. PMID  11438668.
• Рубинфельд Б., Тайс Д.А., Полакис П. (2001). «Аксин-зависимое фосфорилирование белка аденоматозного полипоза coli, опосредованное казеинкиназой 1-эпсилон». J. Biol. Chem. 276 (42): 39037–45. Дои:10.1074 / jbc.M105148200. PMID  11487578.

внешняя ссылка

• Человек AXIN1 расположение генома и AXIN1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O15169 (Аксин-1) на PDBe-KB.