Все-транс-ретинол 13,14-редуктаза - All-trans-retinol 13,14-reductase

полностью транс-ретинол 13,14-редуктаза
Идентификаторы
Номер ЕС	1.3.99.23
Количество CAS	418767-56-3
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	AmiGO / QuickGO
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

РЕТСАТ
Идентификаторы
Псевдонимы	РЕТСАТ, ретинол сатураза
Внешние идентификаторы	OMIM: 617597 MGI: 1914692 ГомолоГен: 41195 Генные карты: РЕТСАТ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п11.2 Начинать 85,341,955 бп[1] Конец 85,354,531 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C1 Начинать 72,598,475 бп[2] Конец 72,608,425 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • активность полностью транс-ретинол 13,14-редуктазы Сотовый компонент • не мембрана • внешняя ядерная мембрана • мембрана • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • окислительно-восстановительный процесс • метаболический процесс ретинола Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54884	67442
Ансамбль	ENSG00000042445	ENSMUSG00000056666
UniProt	Q6NUM9	Q64FW2
RefSeq (мРНК)	NM_017750	NM_026159
RefSeq (белок)	NP_060220	NP_080435
Расположение (UCSC)	Chr 2: 85.34 - 85.35 Мб	Chr 6: 72,6 - 72,61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

В энзимология, полностью транс-ретинол 13,14-редуктаза (ЕС 1.3.99.23 ) является фермент, закодированный РЕТСАТ ген,^[5][6][7] который катализирует в химическая реакция

все-транс-13,14-дигидроретинол + акцептор ${\displaystyle \rightleftharpoons }$ полностью транс-ретинол + восстановленный акцептор

Таким образом, два субстраты этого фермента все-транс-13,14-дигидроретинол и акцептор, а его два товары находятся полностью транс-ретинол и восстановленный акцептор. В физиологических условиях реакция протекает в обратном направлении, катализируя насыщение двойной связи 13-14 соединения полностью транс-ретинол.

Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктазы, особенно те, которые действуют на группу донора CH-CH с другими акцепторами. В систематическое название этого класса ферментов все-транс-13,14-дигидроретинол: акцептор 13,14-оксидоредуктазы. Другие широко используемые имена включают ретинол сатураза, RetSat, (13,14) -all-транс-ретинол сатураза, и все-транс-ретинол: полностью-транс-13,14-дигидроретинол сатураза.

Этот ген также называют генным белком, регулируемым PPAR-альфа и индуцированным голоданием.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000042445 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056666 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), крупномасштабные усилия по идентификации новых секретируемых и трансмембранных белков человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
6. Моисе А.Р., Кукса В., Иманиши Ю., Пальчевски К. (ноябрь 2004 г.). «Идентификация полностью транс-ретинола: полностью транс-13,14-дигидроретинол сатуразой *». J Biol Chem. 279 (48): 50230–42. Дои:10.1074 / jbc.M409130200. ЧВК  2665716. PMID  15358783.
7. «Ген Entrez: RETSAT ретинол сатураза (полностью транс-ретинол 13,14-редуктаза)».
8. «RETSAT - предшественник полностью транс-ретинол 13,14-редуктазы - Homo sapiens (Human) - ген и белок RETSAT». www.uniprot.org. Получено 2017-11-05.

• Моисе А.Р., Кукса В., Иманиши Ю., Пальчевски К. (2004). «Идентификация полностью-транс-ретинола: полностью-транс-13,14-дигидроретинолсатуразы». J. Biol. Chem. 279 (48): 50230–42. Дои:10.1074 / jbc.M409130200. ЧВК  2665716. PMID  15358783.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки, из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.