Аспорин - Asporin

ASPN
Идентификаторы
Псевдонимы	ASPN, OS3, PLAP-1, PLAP1, SLRR1C, аспорин
Внешние идентификаторы	OMIM: 608135 MGI: 1913945 ГомолоГен: 32357 Генные карты: ASPN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.31 Начинать 92,456,205 бп[1] Конец 92,482,506 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A5 Начинать 49,544,443 бп[2] Конец 49,567,565 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • активность ингибитора протеинкиназы • связывание коллагена • структурный компонент внеклеточного матрикса, обеспечивающий сопротивление сжатию Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • минерализация костей • развитие биоминеральной ткани • отрицательная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • отрицательная регуляция минерализации зубов • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • цитокин-опосредованный сигнальный путь • отрицательная регуляция каскада JAK-STAT Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54829	66695
Ансамбль	ENSG00000106819	ENSMUSG00000021388
UniProt	Q9BXN1	Q99MQ4
RefSeq (мРНК)	NM_017680 NM_001193335	NM_001172481 NM_025711
RefSeq (белок)	NP_001180264 NP_060150	NP_001165952 NP_079987
Расположение (UCSC)	Chr 9: 92.46 - 92.48 Мб	Chr 13: 49,54 - 49,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Аспорин это белок что у людей кодируется ASPN ген.^[5]

Функция

АСПН принадлежит к семейству богатый лейцином повтор (LRR) белки, связанные с хрящевым матриксом. Название аспорин отражает уникальное аспартат -богатый N-конец и общее сходство с декорин (MIM 125255) (Lorenzo et al., 2001).^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106819 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021388 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: аспорин ASPN".

внешняя ссылка

• Человек ASPN расположение генома и ASPN страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Лоренцо П., Аспберг А., Оннерфьорд П., Бейлисс М. Т., Ним П. Дж., Хейнегард Д. (апрель 2001 г.). «Идентификация и характеристика аспорина. Нового члена семейства белков с высоким содержанием лейцина, тесно связанных с декорином и бигликаном». Журнал биологической химии. 276 (15): 12201–11. Дои:10.1074 / jbc.M010932200. PMID  11152692.
• Генри С.П., Таканосу М., Бойд Т.С., Мейн П.М., Эберспехер Х., Чжоу В., де Кромбругге Б., Хук М., Мейн Р. (апрель 2001 г.). «Паттерн экспрессии и характеристика гена аспорина. Недавно открытого члена семейства белков с высоким содержанием лейцина». Журнал биологической химии. 276 (15): 12212–21. Дои:10.1074 / jbc.M011290200. PMID  11152695.
• Ямада С., Мураками С., Матоба Р., Одзава И., Йококодзи Т., Накахира Ю., Икезава К., Такаяма С., Мацубара К., Окада Х. (сентябрь 2001 г.). «Профиль экспрессии активных генов в периодонтальной связке человека и выделение PLAP-1, нового гена семейства SLRP». Ген. 275 (2): 279–86. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00683-7. PMID  11587855.
• Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Геномные исследования. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Кидзава Х, Коу И, Иида А, Судо А, Миямото Й, Фукуда А, Мабучи А, Котани А, Каваками А, Ямамото С., Учида А., Накамура К., Нотоя К., Накамура Ю., Икегава С. (февраль 2005 г.). «Повторный полиморфизм аспарагиновой кислоты в аспорине ингибирует хондрогенез и увеличивает предрасположенность к остеоартриту». Природа Генетика. 37 (2): 138–44. Дои:10,1038 / ng1496. PMID  15640800. S2CID  6771016.
• Родригес-Лопес Дж., Помбо-Суарес М., Лиз М., Гомес-Рейно Дж. Дж., Гонсалес А. (2006). «Отсутствие ассоциации переменного числа остатков аспарагиновой кислоты в гене аспорина с восприимчивостью к остеоартриту: исследования случай-контроль у испанских кавказцев». Исследования и лечение артрита. 8 (3): R55. Дои:10.1186 / ar1920. ЧВК  1526645. PMID  16542493.
• Ямада С., Одзава Ю., Томоэда М., Матоба Р., Мацубара К., Мураками С. (май 2006 г.). «Регулирование экспрессии PLAP-1 в клетках периодонтальной связки». Журнал стоматологических исследований. 85 (5): 447–51. Дои:10.1177/154405910608500510. PMID  16632759. S2CID  40160016.
• Цзян Кью, Ши Д., Йи Л., Икегава С., Ван И, Накамура Т., Цяо Д., Лю Ц., Дай Дж (2007). «Репликация ассоциации полиморфизма повторов аспарагиновой кислоты в гене аспорина с восприимчивостью к коленному остеоартриту у китайцев хань». Журнал генетики человека. 51 (12): 1068–72. Дои:10.1007 / s10038-006-0065-6. PMID  17024313.
• Накамура Т., Ши Д., Цетис М., Родригес-Лопес Дж., Миямото Ю., Цезоу А., Гонсалес А., Цзян К., Каматани Н., Лафлин Дж., Икегава С. (июль 2007 г.). «Мета-анализ связи между D-повторами ASPN и остеоартритом». Молекулярная генетика человека. 16 (14): 1676–81. Дои:10,1093 / hmg / ddm115. PMID  17517696.
• Ши Д., Накамура Т., Дай Дж, Йи Л., Цинь Дж, Чен Д., Сюй З., Ван И, Икэгава С., Цзян К. (2007). «Связь полиморфизма повторения аспарагиновой кислоты в гене аспорина с возрастом начала остеоартрита коленного сустава у китайцев хань». Журнал генетики человека. 52 (8): 664–7. Дои:10.1007 / s10038-007-0166-x. PMID  17603749.
• Коу И., Накадзима М., Икегава С. (ноябрь 2007 г.). «Экспрессия и регуляция аспорина, связанного с остеоартрозом». Журнал биологической химии. 282 (44): 32193–9. Дои:10.1074 / jbc.M706262200. PMID  17804408.
• Накадзима М., Кидзава Х., Сайто М., Коу И., Миядзоно К., Икегава С. (ноябрь 2007 г.). «Механизмы функции и регуляции аспорина в суставном хряще». Журнал биологической химии. 282 (44): 32185–92. Дои:10.1074 / jbc.M700522200. PMID  17827158.