B3GALT4 - B3GALT4

B3GALT4
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GALT4, BETA3GALT4, GALT2, GALT4, бета-1,3-галактозилтрансфераза 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 603095 MGI: 1859517 ГомолоГен: 2805 Генные карты: B3GALT4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начинать 33,277,123 бп[1] Конец 33,284,832 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 B1 Начинать 33,949,909 бп[2] Конец 33,951,488 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • галактозилтрансферазная активность • активность ганглиозид галактозилтрансферазы • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • UDP-галактоза: активность бета-N-ацетилглюкозамина, бета-1,3-галактозилтрансферазы • активность ацетилгалактозаминилтрансферазы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • Мембрана Гольджи • аппарат Гольджи • мембрана • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • процесс биосинтеза ганглиозидов • гликозилирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8705	54218
Ансамбль	ENSG00000236802 ENSG00000235155 ENSG00000226936 ENSG00000206285 ENSG00000235863 н / д	ENSMUSG00000067370
UniProt	O96024	Q9Z0F0
RefSeq (мРНК)	NM_003782	NM_019420
RefSeq (белок)	NP_003773	NP_062293
Расположение (UCSC)	Chr 6: 33,28 - 33,28 Мб	Chr 17: 33.95 - 33.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-1,3-галактозилтрансфераза 4 является фермент что у людей кодируется B3GALT4 ген.^[5][6]

Этот ген является членом бета-1,3-галактозилтрансфераза (beta3GalT) генное семейство. Это семейство кодирует тип II мембраносвязанный гликопротеины с различными ферментативными функциями с использованием разных донорных субстратов (UDP-галактоза и UDP-N-ацетилглюкозамин ) и разные акцепторные сахара (N-ацетилглюкозамин, галактоза, N-ацетилгалактозамин ). Гены beta3GalT отдаленно связаны с геном Drosophila Brainiac и содержат белок кодирующая последовательность содержится в едином экзон. Белки beta3GalT также содержат консервативные последовательности не обнаруживается в белках beta4GalT или alpha3GalT. Углеводные цепи, синтезируемые этими ферментами, обозначаются как 1-й тип, тогда как ферменты beta4GalT синтезируют углеводные цепи 2-го типа. Соотношение цепей типа 1: типа 2 изменяется во время эмбриогенез. К сходство последовательностей гены beta3GalT делятся по крайней мере на две группы: beta3GalT4 и 4 других гена beta3GalT (beta3GalT1-3, beta3GalT5). Этот ген ориентирован теломер к центромера в непосредственной близости от рибосомальный белок Ген S18. Функциональность кодируемого белка ограничена ганглиосериями. гликолипид биосинтез.^[6]

Рекомендации

1. ENSG00000235155, ENSG00000226936, ENSG00000206285, ENSG00000235863 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000236802, ENSG00000235155, ENSG00000226936, ENSG00000206285, ENSG00000235 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067370 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Амадо М., Алмейда Р., Карнейро Ф., Левери С.Б., Холмс Э.Х., Номото М., Холлингсворт М.А., Хассан Х., Швентек Т., Нильсен П.А., Беннетт Е.П., Клаузен Х. (июнь 1998 г.). «Семейство бета3-галактозилтрансфераз человека. Характеристика четырех членов UDP-галактозы: бета-N-ацетил-глюкозамин / бета-нацетилгалактозамин бета-1,3-галактозилтрансфераз семейства». J Biol Chem. 273 (21): 12770–8. Дои:10.1074 / jbc.273.21.12770. PMID  9582303.
6. «Ген Entrez: B3GALT4 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,3-галактозилтрансфераза, полипептид 4».

внешняя ссылка

• Человек B3GALT4 расположение генома и B3GALT4 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Амадо М., Алмейда Р., Швентек Т., Клаузен Х (2000). «Идентификация и характеристика больших семейств генов галактозилтрансфераз: галактозилтрансферазы для всех функций». Биохим. Биофиз. Acta. 1473 (1): 35–53. Дои:10.1016 / S0304-4165 (99) 00168-3. PMID  10580128.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Шиина Т., Киккава Э., Ивасаки Х. и др. (2000). «Ген бета-1,3-галактозилтрансферазы-4 (B3GALT4) расположен в центромерном сегменте области MHC класса II человека». Иммуногенетика. 51 (1): 75–8. Дои:10.1007 / s002510050012. PMID  10663566. S2CID  35331402.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Робинсон В.Е., Монтефиори, округ Колумбия, Митчелл В.М. (1988). «Доказательства участия маннозильных остатков в патогенезе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1)». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 3 (3): 265–82. Дои:10.1089 / aid.1987.3.265. PMID  2829950.
• Козарский К., Пенман М., Басирипур Л. и др. (1989). «Гликозилирование и процессинг белка оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. 2 (2): 163–9. PMID  2649653.
• Дьюар Р.Л., Васудевачари МБ, Натараджан В., Зальцман Н.П. (1989). «Биосинтез и процессинг гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа: влияние монензина на гликозилирование и транспорт». Дж. Вирол. 63 (6): 2452–6. Дои:10.1128 / JVI.63.6.2452-2456.1989. ЧВК  250699. PMID  2542563.
• Пал Р., Хок Г. М., Сарнгадхаран М. Г. (1989). «Роль олигосахаридов в процессинге и созревании гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (9): 3384–8. Дои:10.1073 / пнас.86.9.3384. ЧВК  287137. PMID  2541446.
• Кальянараман В.С., Родригес В., Веронезе Ф. и др. (1990). «Характеристика секретируемых природных gp120 и gp160 вируса иммунодефицита человека типа 1». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 6 (3): 371–80. Дои:10.1089 / помощь.1990.6.371. PMID  2187500.