BCL2L13 - BCL2L13

BCL2L13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2IPD
Идентификаторы
Псевдонимы	BCL2L13, BCL-RAMBO, Bcl2-L-13, MIL1, BCL2 как 13
Внешние идентификаторы	MGI: 2136959 ГомолоГен: 9111 Генные карты: BCL2L13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q11.21 Начинать 17,628,855 бп[1] Конец 17,730,855 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 F1 | 6 57.01 см Начинать 120,836,212 бп[2] Конец 120,892,842 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность активатора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальные мембраны • ядро клетки • мембрана • митохондрия Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23786	94044
Ансамбль	ENSG00000099968	ENSMUSG00000009112
UniProt	Q9BXK5	P59017
RefSeq (мРНК)	NM_001270726 NM_001270727 NM_001270728 NM_001270729 NM_001270730 NM_001270731 NM_001270732 NM_001270733 NM_001270734 NM_001270735 NM_015367 NM_001363824	NM_153516
RefSeq (белок)	NP_001257655 NP_001257656 NP_001257657 NP_001257658 NP_001257659 NP_001257660 NP_001257661 NP_001257662 NP_001257663 NP_001257664 NP_056182 NP_001350753	NP_705736
Расположение (UCSC)	Chr 22: 17.63 - 17.73 Мб	Chr 6: 120,84 - 120,89 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

BCL2-подобный 13 (фасилитатор апоптоза), также известный как BCL2L13 или же Bcl-rambo, это белок который у человека кодируется BCL2L13 ген на хромосоме 22. Этот ген кодирует белок, локализованный в митохондриях, который относится к семейству белков Bcl-2. Сверхэкспрессия кодируемого белка приводит к апоптозу.^[5][6] В результате он был связан с такими видами рака, как детский острый лимфобластный лейкоз (ВСЕ) и мультиформная глиобластома (ГБМ).^[7][8] Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов наблюдались для этого гена, такие как Bcl-rambo beta.^[5][9]

Структура

Как член семейства белков Bcl-2, Bcl-rambo включает четыре консервативных домена BH и трансмембранный (TM) домен. Однако, в отличие от других членов, Bcl-rambo не требует доменов BH для своей апоптотической функции, полагаясь вместо этого на митохондриальную локализацию, осуществляемую доменом TM. В дополнение к этим доменам он имеет консервативные мотивы гомологии B-клеточной лимфомы 2, а также удлинение на его c-конце, называемое доменом BHNo, которое содержит два тандемных повтора, RTA и RTB.^[5][9]

Альтернативно сплайсированный вариант белка, называемый Bcl-rambo beta, состоит только из домена BH4, полностью лишенного доменов BH с 1 по 3 из-за стоп-кодона в рамке считывания, вставленного элементом Alu. Без домена TM этот вариант остается в цитозоле и не локализуется в митохондриях. Тем не менее, он все еще выполняет проапоптотическую активность, опосредованную кодируемым элементом Alu, хотя точные механизмы еще предстоит выяснить.^[10]

Функция

Bcl-rambo является членом Bcl-2 семейство белков, регулирующих апоптоз. В клетках Bcl-rambo локализуется в митохондрии, а его сверхэкспрессия вызывает апоптоз, который блокируется каспаза ингибиторы, тогда как ингибиторы, контролирующие восходящие события любого «рецептора смерти» (КУВЫРОК, FADD-DN ) или «митохондриальный» проапоптотический путь (Bcl-x (L) ) не повлияли.^[6] Bcl-rambo опосредует апоптоз, связываясь с транслокатор адениновых нуклеотидов (ANT), компонент поры перехода митохондриальной проницаемости, чтобы вызвать ее открытие. ANT также будет способствовать переносу АДФ и АТФ между цитозолем и матрицей.^[9]

Клиническое значение

Ген BCL2L13 вовлечен в широкий спектр видов рака. Предыдущие клинические исследования наблюдали у ВСЕХ пациентов, что высокая экспрессия BCL2L13 коррелирует с более низкой бессобытийной и общей выживаемостью. Хотя эти наблюдения статистически значимы, они противоречат принятой проапоптотической функции BCL2L13Генный продукт, который должен был способствовать гибели раковых клеток и, следовательно, более благоприятным результатам для выживания. Два возможных объяснения предполагают, что либо 1) Bcl-rambo выполняет иную биологическую роль в детстве, либо 2) альтернативный сплайсинг мог дать антиапоптотический вариант. Чтобы устранить это несоответствие, необходимы дополнительные исследования.^[7] При другом типе рака, GBM, Bcl-rambo, как известно, ингибирует индуцированный апоптоз в клетках GBM путем связывания двух других проапоптотических белков, церамидсинтаз 2 (CerS2) и 6 (CerS6 ), тем самым блокируя образование и активность комплекса CerS2 / 6. Таким образом, подавляя BCL2L13 во время лечения рака может улучшить результаты выживания.^[8]

Взаимодействия

BCL2L13 показал способность взаимодействовать с:

• CerS2^[8] и
• CerS6.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099968 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009112 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Энтреза: BCL2L13 BCL2-подобный 13 (фасилитатор апоптоза)».
6. Катаока Т., Холлер Н., Мишо О., Мартинон Ф., Тинель А., Хофманн К., Чопп Дж. (Июнь 2001 г.). «Bcl-rambo, новый гомолог Bcl-2, который вызывает апоптоз через свое уникальное С-концевое удлинение». Журнал биологической химии. 276 (22): 19548–54. Дои:10.1074 / jbc.M010520200. PMID  11262395.
7. Ян Ю.Л., Линь С.Р., Чен Дж.С., Лин С.В., Ю. С.Л., Чен Х.Й., Йен С.Т., Линь С.Й., Линь Дж.Ф., Линь К.Х., Джоу СТ, Ху Си, Чанг С.К., Лу МЫ, Чанг ХХ, Чанг У.С., Лин К.С. , Lin DT (январь 2010 г.). «Экспрессия и прогностическое значение апоптотических генов BCL2L13, Livin и CASP8AP2 при остром лимфобластном лейкозе у детей». Исследование лейкемии. 34 (1): 18–23. Дои:10.1016 / j.leukres.2009.07.023. PMID  20109966.
8. Дженсен С.А., Калверт А.Э., Вольперт Дж., Кури Ф.М., Херли Л.А., Лучано Дж. П., Ву И., Чаластанис А., Футерман А. Х., Стег А. Х. (апрель 2014 г.). «Bcl2L13 - ингибитор церамидсинтазы при глиобластоме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (15): 5682–7. Bibcode:2014PNAS..111.5682J. Дои:10.1073 / pnas.1316700111. ЧВК  3992626. PMID  24706805.
9. Kim JY, So KJ, Lee S, Park JH (сентябрь 2012 г.). «Bcl-rambo вызывает апоптоз посредством взаимодействия с транслокатором адениновых нуклеотидов». Письма FEBS. 586 (19): 3142–9. Дои:10.1016 / j.febslet.2012.08.015. PMID  22921587. S2CID  31709574.
10. * И П, Чжан В., Чжай З, Мяо Л., Ван И, Ву М. (январь 2003 г.). «Bcl-rambo beta, особый вариант сплайсинга со вставкой Alu-подобной кассеты, способствует гибели клеток, вызванной этопозидом и таксолом». Письма FEBS. 534 (1–3): 61–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03778-X. PMID  12527362. S2CID  7018829.

внешняя ссылка

• Человек BCL2L13 расположение генома и BCL2L13 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Катаока Т., Холлер Н., Мишо О, Мартинон Ф., Тинель А., Хофманн К., Чопп Дж. (Июнь 2001 г.). «Bcl-rambo, новый гомолог Bcl-2, который вызывает апоптоз через свое уникальное С-концевое удлинение». Журнал биологической химии. 276 (22): 19548–54. Дои:10.1074 / jbc.M010520200. PMID  11262395.
• Футз Т.К., Бринкман-Миллс П., Бантинг Г.С., Майер С.А., Риази М.А., Бриджленд Л., Ху С., Биррен Б., Миношима С., Симидзу Н., Пан Х., Нгуен Т., Фанг Ф, Фу Й, Рэй Л., Ву Х, Шаулл С., Фан С., Яо З., Чен Ф, Хуан А., Ху П, Ван Кью, Ло П, Ци С., Роу Б.А., Макдермид Х.Э. (июнь 2001 г.). "Анализ критической области синдрома кошачьего глаза у людей и области консервативной синтении у мышей: поиск генов-кандидатов в перицентромере 22 хромосомы человека или рядом с ней". Геномные исследования. 11 (6): 1053–70. Дои:10.1101 / гр.154901. ЧВК  311098. PMID  11381032.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс Калифорния, Депутат Дэвиса, Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб И., Хакл Е. Д., Биэр Д. М., Данхэм I. «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геномная биология. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Banga S, Gao P, Shen X, Fiscus V, Zong WX, Chen L, Luo ZQ (март 2007 г.). «Legionella pneumophila ингибирует апоптоз макрофагов, воздействуя на про-смерть членов семейства белков Bcl2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (12): 5121–6. Bibcode:2007ПНАС..104.5121Б. Дои:10.1073 / pnas.0611030104. ЧВК  1829273. PMID  17360363.