C1D - C1D

C1D
Идентификаторы
Псевдонимы	C1D, LRP1, SUN-CoR, SUNCOR, hRrp47, корепрессор ядерного рецептора C1D
Внешние идентификаторы	OMIM: 606997 MGI: 1927354 ГомолоГен: 4619 Генные карты: C1D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п14 Начинать 68,041,130 бп[1] Конец 68,110,948 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A3.1 Начинать 17,257,579 бп[2] Конец 17,269,176 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • лиганд-зависимое связывание с ядерным рецептором • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядерная экзосома (РНКазный комплекс) • транскрипционный репрессорный комплекс • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • созревание 5.8S рРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • апоптотический процесс • обработка рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10438	57316
Ансамбль	ENSG00000197223	ENSMUSG00000000581
UniProt	Q13901	O35473
RefSeq (мРНК)	NM_173177 NM_001190263 NM_001190265 NM_006333	NM_020558 NM_001330649
RefSeq (белок)	NP_001177192 NP_001177194 NP_006324 NP_775269	NP_001317578 NP_065583
Расположение (UCSC)	Chr 2: 68.04 - 68.11 Мб	Chr 11: 17.26 - 17.27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий нуклеиновую кислоту C1D это белок что у людей кодируется C1D ген.^{[5][6][7][8][9][10]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является ДНК-связывающим и индуцирующим апоптоз белком, локализованным в ядре. Это также белок, взаимодействующий с Rac3, который действует как корепрессор рецептора гормона щитовидной железы. Считается, что этот белок регулирует образование комплекса TRAX / Translin. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не была определена.^[10]

Взаимодействия

C1D был показан взаимодействовать с TSNAX^[8] и ДНК-PKcs.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197223 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000581 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нелс П., Кек Т., Греферат Р., Шписс Е., Глейзер Т., Ротбарт К., Штаммер Х., Вернер Д. (апрель 1998 г.). «клонирование кДНК, рекомбинантная экспрессия и характеристика полипептидов с исключительной аффинностью к ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (5): 1160–6. Дои:10.1093 / nar / 26.5.1160. ЧВК  147382. PMID  9469821.
6. Шильдерс Г., Эгбертс В.В., Райджмейкерс Р., Пруейн Г.Дж. (июль 2007 г.). «C1D является основной мишенью для аутоантител у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита и склеродермии». Ревматоидный артрит. 56 (7): 2449–54. Дои:10.1002 / арт.22710. PMID  17599775.
7. Шильдерс Г., ван Дейк Э., Пруейн Г.Дж. (май 2007 г.). «C1D и hMtr4p связываются с субъединицей экзосомы человека PM / Scl-100 и участвуют в процессинге пре-рРНК». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (8): 2564–72. Дои:10.1093 / нар / гкм082. ЧВК  1885644. PMID  17412707.
8. Erdemir T, Bilican B, Oncel D, Goding CR, Yavuzer U (январь 2002 г.). «Зависимое от повреждений ДНК взаимодействие белка ядерного матрикса C1D с транслин-ассоциированным фактором X (TRAX)». J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 207–16. PMID  11801738.
9. Замир И., Доусон Дж., Лавинский Р.М., Гласс С.К., Розенфельд М.Г., Лазар М.А. (декабрь 1997 г.). «Клонирование и характеристика корепрессора и потенциального компонента репрессивного комплекса ядерных гормонов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (26): 14400–5. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14400. ЧВК  24996. PMID  9405624.
10. «Ген Entrez: ядерный ДНК-связывающий белок C1D».
11. Явузер У., Смит Г.К., Блисс Т., Вернер Д., Джексон С.П. (июль 1998 г.). «Независимая от конца ДНК активация ДНК-ПК, опосредованная посредством ассоциации с ДНК-связывающим белком C1D». Genes Dev. 12 (14): 2188–99. Дои:10.1101 / gad.12.14.2188. ЧВК  317006. PMID  9679063.

внешняя ссылка

• Человек C1D расположение генома и C1D страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек LRP1 расположение генома и LRP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Ротбарт К., Стэммер Х, Вернер Д. (2002). «Опосредованная протеасомами деградация препятствует критическим уровням индуцирующего апоптоз белка C1D». Cancer Cell Int. 2 (1): 12. Дои:10.1186/1475-2867-2-12. ЧВК  140130. PMID  12379155.
• Ротбарт К., Хунцикер А., Стэммер Х, Вернер Д. (2001). «Промотор гена, кодирующего ДНК-связывающий и индуцирующий апоптоз белок C1D размером 16 кДа». Биохим. Биофиз. Acta. 1518 (3): 271–5. Дои:10.1016 / S0167-4781 (01) 00198-1. PMID  11311939.
• Ротбарт К., Списс Э., Юодка Б., Явузер Ю., Нелс П., Штаммер Х., Вернер Д. (1999). «Индукция апоптоза сверхэкспрессией ДНК-связывающего и ДНК-PK-активирующего белка C1D». J. Cell Sci. 112 (13): 2223–32. PMID  10362552.
• Хаатая Л., Гроффен Дж., Хейстеркамп Н. (1998). «Идентификация нового белка C1D, взаимодействующего с Rac3». Int. J. Mol. Med. 1 (4): 665–70. Дои:10.3892 / ijmm.1.4.665. PMID  9852280.