CAB39 - CAB39 - Wikipedia

CAB39
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1УПК, 1UPL, 2WTK, 3GNI, 4FZA, 4FZD, 4FZF, 4NZW, 4O27
Идентификаторы
Псевдонимы	CAB39, MO25, CGI-66, кальций-связывающий белок 39
Внешние идентификаторы	OMIM: 612174 MGI: 107438 ГомолоГен: 69212 Генные карты: CAB39
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.1 Начинать 230,712,842 бп[1] Конец 230,821,075 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C5 Начинать 85,793,441 бп[2] Конец 85,851,576 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность активатора протеин-серин / треонинкиназы • активность активатора протеинкиназы • активность протеин-серин / треонинкиназы • связывание киназы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • комплекс серин / треониновая протеинкиназа • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • просвет секреторной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • гетероолигомеризация белков • передача сигнала путем фосфорилирования белка • клеточный гипотонический ответ • положительная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • отрицательная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов калия • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • фосфорилирование пептидил-серина • остановка клеточного цикла • отрицательная регуляция трансмембранного транспорта ионов калия • активация активности протеинкиназы • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51719	12283
Ансамбль	ENSG00000135932	ENSMUSG00000036707
UniProt	Q9Y376	Q06138
RefSeq (мРНК)	NM_001130849 NM_001130850 NM_016289	NM_133781 NM_001355046 NM_001355047
RefSeq (белок)	NP_001124321 NP_001124322 NP_057373	NP_598542 NP_001341975 NP_001341976
Расположение (UCSC)	Chr 2: 230,71 - 230,82 Мб	Chr 1: 85.79 - 85.85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальций-связывающий белок 39 это белок что у людей кодируется CAB39 ген.^[5]

В белок кодируется этим геном, ассоциируется с STK11 (SЭрин /Тхреонин Kinase 11) и STRAD (STE20-рприподнятый ОБЪЯВЛЕНИЕапторный белок).^[6] CAB39 усиливает образование комплексов STK11 / STRAD и стимулирует каталитическую активность STK11. CAB39 может функционировать как каркасный компонент комплекса STK11 / STRAD и регулирует активность STK11 и клеточную локализацию.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135932 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036707 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: кальций-связывающий белок 39 CAB39».
6. Boudeau J, Baas AF, Deak M, Morrice NA, Kieloch A, Schutkowski M, Prescott AR, Clevers HC, Alessi DR (октябрь 2003 г.). «MO25α / β взаимодействуют с STRADα / β, повышая их способность связывать, активировать и локализовать LKB1 в цитоплазме». EMBO J. 22 (19): 5102–14. Дои:10.1093 / emboj / cdg490. ЧВК  204473. PMID  14517248.

внешняя ссылка

• Человек CAB39 расположение генома и CAB39 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Баас А.Ф., Смит Л., Клеверс Х. (2004). "Белок-супрессор опухоли LKB1: PARtaker в клеточной полярности". Тенденции Cell Biol. 14 (6): 312–9. Дои:10.1016 / j.tcb.2004.04.001. PMID  15183188.
• Хоули С.А., Дэвисон М., Вудс А. и др. (1996). «Характеристика киназы AMP-активированной протеинкиназы из печени крысы и идентификация треонина 172 как основного сайта, по которому он фосфорилирует AMP-активированную протеинкиназу». J. Biol. Chem. 271 (44): 27879–87. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27879. PMID  8910387.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). "Идентификация новых генов человека, эволюционно сохраненных в Caenorhabditis elegans сравнительной протеомикой ». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Будо Дж., Баас А.Ф., Деак М. и др. (2003). «MO25α / β взаимодействуют с STRADα / β, повышая их способность связывать, активировать и локализовать LKB1 в цитоплазме». EMBO J. 22 (19): 5102–14. Дои:10.1093 / emboj / cdg490. ЧВК  204473. PMID  14517248.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б. и др. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Милберн С.С., Будо Дж., Деак М. и др. (2004). «Кристаллическая структура МО25α в комплексе с С-концом адаптера, родственного псевдокиназе STE20 ». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (2): 193–200. Дои:10.1038 / nsmb716. PMID  14730349. S2CID  18401688.
• Лискано Дж. М., Йоранссон О., Тот Р. и др. (2005). «LKB1 - это основная киназа, которая активирует 13 киназ подсемейства AMPK, включая MARK / PAR-1». EMBO J. 23 (4): 833–43. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600110. ЧВК  381014. PMID  14976552.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Будо Дж., Скотт Дж. У., Реста Н. и др. (2005). «Анализ комплекса LKB1-STRAD-MO25». J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. Дои:10.1242 / jcs.01571. PMID  15561763.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.