LYK5 - LYK5

STRADA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1УПК, 2WTK, 3GNI
Идентификаторы
Псевдонимы	STRADA, LYK5, NY-BR-96, PMSE, STRAD, Stlk, связанный с STE20 адаптер киназы альфа, STRAD альфа, альфа-адаптер, связанный с STE20
Внешние идентификаторы	OMIM: 608626 MGI: 1919399 ГомолоГен: 12448 Генные карты: STRADA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q23.3 Начинать 63,682,336 бп[1] Конец 63,741,986 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E1 Начинать 106,163,330 бп[2] Конец 106,202,168 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность активатора протеин-серин / треонинкиназы • активность активатора протеинкиназы • активность протеинкиназы • Связывание АТФ • связывание нуклеотидов • связывание киназы • активность протеин-серин / треонинкиназы Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • экспорт белка из ядра • клеточный цикл • фосфорилирование белков • остановка клеточного цикла • положительная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • активация активности протеинкиназы • регуляция митотического клеточного цикла • сигнальный каскад стресс-активируемой протеинкиназы • регуляция апоптотического процесса • Каскад MAPK • передача сигнала путем фосфорилирования белка • морфогенез проекции нейронов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	92335	72149
Ансамбль	ENSG00000266173	ENSMUSG00000069631
UniProt	Q7RTN6	Q3UUJ4
RefSeq (мРНК)	NM_001003786 NM_001003787 NM_001003788 NM_001165969 NM_001165970 NM_153335 NM_001363786 NM_001363787 NM_001363788 NM_001363789 NM_001363790 NM_001363791	NM_001252448 NM_001252449 NM_028126
RefSeq (белок)	NP_001003786 NP_001003787 NP_001003788 NP_001159441 NP_001159442 NP_699166 NP_001350715 NP_001350716 NP_001350717 NP_001350718 NP_001350719 NP_001350720	NP_001239377 NP_001239378 NP_082402
Расположение (UCSC)	Chr 17: 63,68 - 63,74 Мб	Chr 11: 106,16 - 106,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа LYK5, также известный как LYK5 или же STRADα, это человек белок а также обозначает ген кодируя это.^[5][6]

Функция

Эндогенный LKB1 и STRADα образуют комплекс, в котором STRADα активирует LKB1, что приводит к фосфорилирование обоих партнеров. Удаление эндогенного LYK5 с помощью малая интерферирующая РНК отменяет индуцированный LKB1 Фаза G1 арестовать.^[6] STRADα стабилизирует LKB1 белок как in vivo, так и in vitro, и способен вызывать множественные аксоны в культивируемых нейронах коры головного мозга эмбриона мыши при сверхэкспрессии с LKB1. STRADα сильно сплайсирован in vivo, и это регулируется как онтогенетически, так и тканеспецифично, но уникальные функции вариантов сплайсинга еще не поняты.^[7]

Связь с заболеванием

Мутации в гене LYK5 / STRADα связаны с многоводие, мегалэнцефалия и симптоматический эпилепсия (вместе известный как синдром PMSE).^[8]

Взаимодействия

STRADα было показано взаимодействовать с LKB1 и MO25.^[6][9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000266173 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000069631 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: протеинкиназа LYK5 LYK5».
6. Baas AF, Boudeau J, Sapkota GP, Smit L, Medema R, Morrice NA, Alessi DR, Clevers HC (июнь 2003 г.). «Активация киназы-супрессора опухолей LKB1 с помощью STE20-подобной псевдокиназы STRAD». EMBO J. 22 (12): 3062–72. Дои:10.1093 / emboj / cdg292. ЧВК  162144. PMID  12805220.
7. Велева-Роце Б.О., Смарт Дж.Л., Баас А.Ф., Эдмондс Б., Чжао З.М., Браун А., Клуг Л.Р., Хансен К., Рейли Г., Гарднер А.П., Суббиа К., Гоше Э.А., Клеверс Х., Барнс А.П. (2014). «Псевдокиназы STRAD регулируют аксогенез и стабильность LKB1». Neural Dev. 9 (5): 5. Дои:10.1186/1749-8104-9-5. ЧВК  4016016. PMID  24594058./
8. Паффенбергер Э. Г., Штраус К. А., Рэмси К. Э., Крейг Д. В., Стефан Д. А., Робинсон Д. Л., Хендриксон С. Л., Готтлиб С., Рамзи Д. А., Сиу В. М., Хойер Г. Г., Крино ПБ, Мортон Д. Д. (июль 2007 г.). «Полигидрамнион, мегалэнцефалия и симптоматическая эпилепсия, вызванные гомозиготной делецией 7 килобаз в LYK5». Мозг. 130 (Pt 7): 1929–41. Дои:10.1093 / мозг / awm100. PMID  17522105.
9. Будо Дж., Скотт Дж. В., Реста Н., Деак М., Килох А., Командер Д., Харди Д. Г., Прескотт А. Р., Ван Аалтен Д. М., Алесси Д. Р. (декабрь 2004 г.). «Анализ комплекса LKB1-STRAD-MO25». J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. Дои:10.1242 / jcs.01571. PMID  15561763.

дальнейшее чтение

• Баас А.Ф., Смит Л., Клеверс Х. (2004). "Белок-супрессор опухоли LKB1: PARtaker в клеточной полярности". Тенденции Cell Biol. 14 (6): 312–9. Дои:10.1016 / j.tcb.2004.04.001. PMID  15183188.
• Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, Williamson B, Stockert E, Gure AO, Jäger D, Chen YT, Mackay A, O'Hare MJ, Old LJ (2003). «Гуморальный иммунитет к раку груди человека: определение антигена и количественный анализ экспрессии мРНК». Иммунный против рака. 1: 4. PMID  12747765.
• Baas AF, Boudeau J, Sapkota GP, Smit L, Medema R, Morrice NA, Alessi DR, Clevers HC (2003). «Активация киназы-супрессора опухолей LKB1 с помощью STE20-подобной псевдокиназы STRAD». EMBO J. 22 (12): 3062–72. Дои:10.1093 / emboj / cdg292. ЧВК  162144. PMID  12805220.
• Boudeau J, Baas AF, Deak M, Morrice NA, Kieloch A, Schutkowski M, Prescott AR, Clevers HC, Alessi DR (2003). «MO25alpha / beta взаимодействуют с STRADalpha / beta, повышая их способность связывать, активировать и локализовать LKB1 в цитоплазме». EMBO J. 22 (19): 5102–14. Дои:10.1093 / emboj / cdg490. ЧВК  204473. PMID  14517248.
• Милберн CC, Boudeau J, Deak M, Alessi DR, van Aalten DM (2004). «Кристаллическая структура MO25 альфа в комплексе с С-концом адаптера, связанного с псевдокиназой STE20». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (2): 193–200. Дои:10.1038 / nsmb716. PMID  14730349. S2CID  18401688.
• Лискано Дж. М., Йоранссон О., Тот Р., Деак М., Моррис Н. А., Будо Дж., Хоули С. А., Удд Л., Мякеля Т. П., Харди Д. Г., Алесси Д. Р. (2005). «LKB1 - это основная киназа, которая активирует 13 киназ подсемейства AMPK, включая MARK / PAR-1». EMBO J. 23 (4): 833–43. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600110. ЧВК  381014. PMID  14976552.
• Будо Дж., Скотт Дж. У., Реста Н., Деак М., Килох А., Командер Д., Харди Д. Г., Прескотт А. Р., Ван Аалтен Д. М., Алесси Д. Р. (2005). «Анализ комплекса LKB1-STRAD-MO25». J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. Дои:10.1242 / jcs.01571. PMID  15561763.
• Велева-Роце Б.О., Смарт Дж.Л., Баас А.Ф., Эдмондс Б., Чжао З.М., Браун А., Клуг Л.Р., Хансен К., Рейли Г., Гарднер А.П., Суббиа К., Гоше Э.А., Клеверс Х., Барнс А.П. (2014). «Псевдокиназы STRAD регулируют аксогенез и стабильность LKB1». Neural Dev. 9 (5): 5. Дои:10.1186/1749-8104-9-5. ЧВК  4016016. PMID  24594058.