CCDC85B - CCDC85B

CCDC85B
Идентификаторы
Псевдонимы	CCDC85B, DIPA, домен coiled-coil, содержащий 85B
Внешние идентификаторы	OMIM: 605360 MGI: 2147607 ГомолоГен: 4989 Генные карты: CCDC85B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начинать 65,890,673 бп[1] Конец 65,891,635 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 5,453,180 бп[2] Конец 5,457,894 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • центросома • цитоскелет • ядро клетки • центр организации микротрубочек Биологический процесс • регулирование роста • дифференциация клеток • отрицательная регуляция дифференцировки жировых клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция роста клеток • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11007	240514
Ансамбль	ENSG00000175602	ENSMUSG00000095098
UniProt	Q15834	Q6PDY0
RefSeq (мРНК)	NM_006848	NM_001243307 NM_198616
RefSeq (белок)	NP_006839	NP_001230236 NP_941018
Расположение (UCSC)	Chr 11: 65.89 - 65.89 Мб	Chr 19: 5.45 - 5.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий домен спиральной спирали 85B это белок что у людей кодируется CCDC85B ген.^[5][6][7]

Функция

Вирус гепатита дельта (HDV) - патогенный вирус человека, РНК геном и цикл репликации напоминают таковые у растений вироиды. Было обнаружено, что дельта-взаимодействующий белок А (DIPA), продукт клеточного гена, гомологичен антигену вируса гепатита дельта (HDAg). DIPA взаимодействует с вирусным антигеном HDAg и может влиять на репликацию HDV. in vitro.^[7]

Взаимодействия

CCDC85B был показан взаимодействовать с:

• C19orf25,^[8]
• KIAA1267,^[8]
• Кератин 17,^[8] и
• Протеинкиназа N1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175602 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000095098 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бразас Р., Ганем Д. (октябрь 1996 г.). «Клеточный гомолог антигена гепатита дельта: значение для вирусной репликации и эволюции». Наука. 274 (5284): 90–4. Дои:10.1126 / science.274.5284.90. PMID  8810253. S2CID  20743492.
6. Бези О, Элабд С., Коше О, Петерсен Р.К., Кристиансен К., Дани С., Айлхауд Дж., Амри Э.З. (март 2005 г.). «Дельта-взаимодействующий белок А, новый ингибиторный партнер CCAAT / энхансер-связывающий белок бета, участвующий в дифференцировке адипоцитов». Журнал биологической химии. 280 (12): 11432–8. Дои:10.1074 / jbc.M411741200. PMID  15644333.
7. "Ген Энтреза: домен спиральной спирали CCDC85B, содержащий 85B".
8. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешняя ссылка

• Человек CCDC85B расположение генома и CCDC85B страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Робертсон HD (октябрь 1996 г.). «Как впервые собрались вместе реплицирующая и кодирующая РНК?». Наука. 274 (5284): 66–7. Дои:10.1126 / science.274.5284.66. PMID  8848724. S2CID  37715470.
• Лонг М., де Соуза С.Дж., Гилберт В. (май 1997 г.). «Дельта-взаимодействующий белок А и происхождение дельта-антигена гепатита». Наука. 276 (5313): 824–5. Дои:10.1126 / science.276.5313.824. PMID  9115212.
• Шумахер Б., Шертель С., Виттенбург Н., Так С., Митани С., Гартнер А., Конрад Б., Шахам С. (февраль 2005 г.). «C. elegans ced-13 может способствовать апоптозу и индуцируется в ответ на повреждение ДНК». Гибель клеток и дифференциация. 12 (2): 153–61. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401539. PMID  15605074.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Й. (май 2006 г.). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Du X, Wang Q, Hirohashi Y, Greene MI (декабрь 2006 г.). «DIPA, который может локализоваться в центросоме, связывается с p78 / MCRS1 / MSP58 и действует как репрессор транскрипции гена». Экспериментальная и молекулярная патология. 81 (3): 184–90. Дои:10.1016 / j.yexmp.2006.07.008. PMID  17014843.