CLC (ген) - CLC (gene)

CLC
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1G86, 1HDK, 1LCL, 1QKQ
Идентификаторы
Псевдонимы	CLC, GAL10, Gal-10, LGALS10, LGALS10A, LPPL_HUMAN, кристаллический галектин Шарко-Лейдена, галектин-10
Внешние идентификаторы	OMIM: 153310 ГомолоГен: 130498 Генные карты: CLC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 39,731,255 бп[1] Конец 39,738,029 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность эндопептидазы цистеинового типа, вовлеченная в процесс апоптоза • активность лизофосфолипазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание углеводов • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • Процесс апоптоза Т-клеток • регулирование выработки цитокинов Т-клетками • регулирование пролиферации активированных Т-клеток • регуляция анергии Т-клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1178	н / д
Ансамбль	ENSG00000105205	н / д
UniProt	Q05315	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001828	н / д
RefSeq (белок)	NP_001819	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 39.73 - 39.74 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Галектин-10 является фермент что у людей кодируется CLC ген.^[3][4]

Лизофосфолипазы представляют собой ферменты, которые действуют на биологические мембраны, регулируя многофункциональные лизофосфолипиды. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой лизофосфолипазу, экспрессируемую в эозинофилы и базофилы. Гидролизует лизофосфатидилхолин к глицерофосфохолин и бесплатный жирная кислота. Этот белок может содержать углевод или IgE -вяжущие мероприятия. Он как структурно, так и функционально связан с галектин семья бета-галактозид связывающие белки. Это может быть связано с воспалением и некоторыми миелоидные лейкозы.^[4]

Смотрите также

• Кристаллы Шарко-Лейдена

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105205 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Мастрианни Д.М., Эдди Р.Л., Розенберг Х.Ф., Корретте С.Е., показывает ТБ, Тенен Д.Г., Акерман С.Дж. (июнь 1992 г.). «Локализация гена кристаллического белка эозинофилов Шарко-Лейдена (лизофосфолипаза) (CLC) на хромосоме 19 и генов рибонуклеазы 2 (нейротоксин, происходящий из эозинофилов) и рибонуклеазы 3 (катионный белок эозинофилов) человека (RNS2 и RNS3) на хромосоме 14» » . Геномика. 13 (1): 240–2. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90237-М. PMID  1577491.
4. "Кристаллический галектин Шарко-Лейдена CLC [Homo sapiens (человек)]".

внешние ссылки

• Человек CLC расположение генома и CLC страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Gleich GJ, Loegering DA, Mann KG, Maldonado JE (1976). «Сравнительные свойства кристаллического белка Шарко-Лейдена и основного основного белка эозинофилов человека». J. Clin. Вкладывать деньги. 57 (3): 633–40. Дои:10.1172 / JCI108319. ЧВК  436696. PMID  942977.
• Голайтли Л. М., Томас Л. Л., Дворжак А. М., Акерман С. Дж. (1992). «Кристаллический белок Шарко-Лейдена в дегрануляции и восстановлении активированных базофилов». J. Leukoc. Биол. 51 (4): 386–92. Дои:10.1002 / jlb.51.4.386. PMID  1373430. S2CID  24236041.
• Дворак А.М., Веллер П.Ф., Монахан-Эрли Р.А. и др. (1990). «Ультраструктурная локализация кристаллического белка Шарко-Лейдена (лизофосфолипаза) и пероксидазы в макрофагах, эозинофилах и внеклеточном матриксе кожи при гиперэозинофильном синдроме». Лаборатория. Вкладывать деньги. 62 (5): 590–607. PMID  2160562.
• Дворжак AM, Летурно Л., Веллер П.Ф., Акерман С.Дж. (1990). «Ультраструктурная локализация кристаллического белка Шарко-Лейдена (лизофосфолипаза) в интрацитоплазматических кристаллах в опухолевых клетках первичных солидных и папиллярных эпителиальных новообразований поджелудочной железы». Лаборатория. Вкладывать деньги. 62 (5): 608–15. PMID  2160563.
• Дворжак AM, Акерман SJ (1989). «Ультраструктурная локализация кристаллического белка Шарко-Лейдена (лизофосфолипаза) в гранулах и внутригранулярных кристаллах в зрелых базофилах человека». Лаборатория. Вкладывать деньги. 60 (4): 557–67. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12703656. PMID  2709814.
• Sieker LC, Turley S, Le Trong I и др. (1989). «Кристаллографическая характеристика кристаллов Шарко-Лейдена эозинофилов человека». J. Mol. Биол. 204 (2): 489–91. Дои:10.1016/0022-2836(88)90590-6. PMID  3221396.
• Веллер П.Ф., Бах Д., Остин К.Ф. (1982). «Человеческая эозинофильная лизофосфолипаза: единственный белковый компонент кристаллов Шарко-Лейдена». J. Immunol. 128 (3): 1346–9. PMID  6173432.
• Веллер П.Ф., Бах Д.С., Остин К.Ф. (1985). «Биохимическая характеристика человеческого эозинофильного кристаллического белка Шарко-Лейдена (лизофосфолипаза)». J. Biol. Chem. 259 (24): 15100–5. PMID  6511787.
• Gomolin HI, Yamaguchi Y, Paulpillai AV, et al. (1993). «Кристаллический белок эозинофила Шарко-Лейдена человека: клонирование и характеристика промотора гена лизофосфолипазы». Кровь. 82 (6): 1868–74. Дои:10.1182 / blood.V82.6.1868.1868. PMID  8400237.
• Акерман С.Дж., Корретте С.Е., Розенберг Х.Ф. и др. (1993). «Молекулярное клонирование и характеристика кристаллического протеина Шарко-Лейдена эозинофила человека (лизофосфолипаза). Сходство с IgE-связывающими белками и суперсемейством животных лектинов S-типа». J. Immunol. 150 (2): 456–68. PMID  8419478.
• Леонидас Д.Д., Эльберт Б.Л., Чжоу З. и др. (1996). «Кристаллическая структура кристаллического белка Шарко-Лейдена человека, эозинофильная лизофосфолипаза, определяет его как нового члена семейства галектинов, связывающих углеводы». Структура. 3 (12): 1379–93. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00275-1. PMID  8747464.
• Дайер К.Д., Ханден Дж.С., Розенберг Х.Ф. (1997). «Геномная структура гена кристаллического белка Шарко-Лейдена человека аналогична структуре генов галектина». Геномика. 40 (2): 217–21. Дои:10.1006 / geno.1996.4590. PMID  9119387.
• Сваминатан Г.Дж., Леонидас Д.Д., Сэвидж М.П. и др. (1999). «Селективное распознавание маннозы кристаллическим белком Шарко-Лейдена эозинофила человека (галектин-10): кристаллографическое исследование с разрешением 1,8 A». Биохимия. 38 (42): 13837–43. Дои:10.1021 / bi990756e. PMID  10529229.
• Ларраменди М.Л., Ниини Т., Элонен Э. и др. (2003). «Сверхэкспрессия связанных с транслокацией гибридных генов FGFRI, MYC, NPMI и DEK, но отсутствие транслокаций при остром миелоидном лейкозе. Анализ микроматрицы». Haematologica. 87 (6): 569–77. PMID  12031912.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Абедин М.Дж., Кашио Ю., Секи М. и др. (2003). «Возможные роли галектинов в дифференцировке миелоидов на три разные линии». J. Leukoc. Биол. 73 (5): 650–6. Дои:10.1189 / jlb.0402163. PMID  12714580. S2CID  21337581.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Нильсен К., Хегаард С., Ворум Х и др. (2005). «Измененная экспрессия CLC, DSG3, EMP3, S100A2 и SLPI в эпителии роговицы у пациентов с кератоконусом». Роговица. 24 (6): 661–8. Дои:10.1097 / 01.ico.0000153556.59407.69. PMID  16015083. S2CID  21026845.