CNOT6 - CNOT6

CNOT6
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT6, CCR4, Ccr4a, субъединица 6 транскрипционного комплекса CCR4-NOT
Внешние идентификаторы	OMIM: 608951 MGI: 2144529 ГомолоГен: 69187 Генные карты: CNOT6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.3 Начинать 180,494,379 бп[1] Конец 180,578,358 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.2 Начинать 49,671,503 бп[2] Конец 49,712,723 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • поли (A) -специфическая рибонуклеазная активность • активность экзорибонуклеазы • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • нуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • CCR4-НЕ комплекс • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция коактиваторной активности транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция сборки тела цитоплазматической мРНК • подавление гена с помощью miRNA • положительное регулирование пролиферации клеток • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • подавление гена с помощью РНК • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, беспрерывный распад • регулирование перевода • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57472	104625
Ансамбль	ENSG00000113300	ENSMUSG00000020362
UniProt	Q9ULM6	Q8K3P5
RefSeq (мРНК)	NM_001303241 NM_015455 NM_001370472 NM_001370473 NM_001370474	NM_001290741 NM_212484 NM_001363356 NM_001363357
RefSeq (белок)	NP_001290170 NP_001357401 NP_001357402 NP_001357403	NP_001277670 NP_997649 NP_001350285 NP_001350286
Расположение (UCSC)	Chr 5: 180.49 - 180.58 Мб	Chr 11: 49.67 - 49.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 6 транскрипционного комплекса CCR4-NOT это белок что у людей кодируется CNOT6 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей CCR4-Нет транскрипционная регуляция и деаденилаза сложный. Кодируемый белок имеет 3'-5 ' экзонуклеаза активность и предпочитает полиаденилированные состояния.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113300 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020362 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чен Дж., Чанг Ю.С., Денис К.Л. (март 2002 г.). «CCR4, 3'-5'-поли (A) РНК и экзонуклеаза оцДНК, является каталитическим компонентом цитоплазматической деаденилазы». EMBO J. 21 (6): 1414–26. Дои:10.1093 / emboj / 21.6.1414. ЧВК  125924. PMID  11889047.
6. «Ген Entrez: транскрипционный комплекс CNOT6 CCR4-NOT, субъединица 6».

внешняя ссылка

• Человек CCR4 расположение генома и CCR4 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Человек CNOT6 расположение генома и CNOT6 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Окубо К., Ито К., Фукусима А. и др. (1996). «Мониторинг физиологии клеток по профилям экспрессии и обнаружение генов, специфичных для типов клеток, с помощью составленных профилей экспрессии». Геномика. 30 (2): 178–86. Дои:10.1006 / geno.1995.9887. PMID  8586417.
• Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (5): 337–45. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.337. PMID  10574462.
• Альберт Т.К., Лемер М., ван Беркум Н.Л. и др. (2000). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (3): 809–17. Дои:10.1093 / nar / 28.3.809. ЧВК  102560. PMID  10637334.
• Дюпрессуар А., Морель А.П., Барбот В. и др. (2003). «Идентификация четырех семейств yCCR4- и Mg2 + -зависимых белков, связанных с эндонуклеазами, у высших эукариот и характеристика ортологов yCCR4 с консервативным лейцином-богатым повтором, необходимым для связывания hCAF1 / hPOP2». BMC Genomics. 2: 9. Дои:10.1186/1471-2164-2-9. ЧВК  61044. PMID  11747467.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чанг Т.С., Ямасита А., Чен С.Ю. и др. (2004). «UNR, новый партнер поли (A) -связывающего белка, играет ключевую роль в трансляционно-связанном обмене мРНК, опосредованном детерминантой основной кодирующей области c-fos». Genes Dev. 18 (16): 2010–23. Дои:10.1101 / gad.1219104. ЧВК  514181. PMID  15314026.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.