CCR4-Нет - CCR4-Not - Wikipedia

Структура человеческого модуля CNOT1-CNOT2-CNOT3 (PDB 4C0D).[1]

Cарбон Cатаболит рдепрессияNотважный Оп ТБез ATA или CCR4-Нет, это мультипротеиновый комплекс это функционирует в экспрессии генов.[2][3] Комплекс обладает множественной ферментативной активностью, как поли (А) 3′-5′ экзонуклеаза и убиквитинлигаза.[4][5][6][7] Комплекс присутствует как в ядро где он регулирует транскрипцию и в цитоплазма где это связано с переводом рибосом и Обработка РНК тела.[2][3]

Подразделения

Комплекс CCR4-Not человека состоит из структурных (некаталитических) субъединиц и субъединиц, которые имеют экзонуклеаза и E3 лигаза Мероприятия. Некоторые, но не все субъединицы человека сохраняются в бутоньерки.[8]

СубъединицаМВт (кДа)[A]Ключевая особенность
CNOT1267«Эшафот» с некаталитической функцией. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[9]
CNOT260Структурная составляющая. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[9]
CNOT382Структурная составляющая. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[10][9]
CNOT464Активен как E3 убиквитин лигаза.[7]
CNOT6633′-5′ экзонуклеаза с предпочтением полиаденилированный подсостояния мРНК.[5] Имеет человеческий паралог CNOT6L.
CNOT7333′-5′ экзонуклеаза это частично дублирует CNOT7.[4]
CNOT8343′-5′ экзонуклеаза.[4]
CNOT934Выполняет некаталитическую функцию.[11]
CNOT1082Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT11, отсутствующий у грибов.[12]
CNOT1155Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT10, отсутствующий у грибов.[12]

А Молекулярный вес человеческих субъединиц от Uniprot.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Боланд, Андреас; Чен, Инь; Райш, Тобиас; Йонас, Стефани; Кузуоглу-Озтюрк, Дуйгу; Вольболд, Лара; Weichenrieder, Оливер; Изаурральде, Элиза (13.10.2013). «Строение и сборка модуля НЕ человеческого комплекса CCR4 – НЕ». Структурная и молекулярная биология природы. ООО "Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа". 20 (11): 1289–1297. Дои:10.1038 / nsmb.2681. ISSN  1545-9993. PMID  24121232.
  2. ^ а б Колларт, Мартина А. (29 января 2016 г.). «Комплекс Ccr4-Not является ключевым регулятором экспрессии эукариотических генов». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК. Вайли. 7 (4): 438–454. Дои:10.1002 / wrna.1332. ISSN  1757-7004. ЧВК  5066686. PMID  26821858.
  3. ^ а б Миллер, Джейсон Э .; Риз, Джозеф К. (15 марта 2012 г.). «Ccr4-Not complex: уродство контроля над эукариотическими клетками». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии. Informa UK Limited. 47 (4): 315–333. Дои:10.3109/10409238.2012.667214. ISSN  1040-9238. ЧВК  3376659. PMID  22416820.
  4. ^ а б c Аслам, Ахмед; Mittal, Saloni; Кох, Фредерик; Андрау, Жан-Кристоф; Винклер, Г. Себастьян (2009). Виккенс, Марвин (ред.). «Ccr4 – недеаденилазные субъединицы CNOT7 и CNOT8 имеют перекрывающиеся роли и модулируют пролиферацию клеток». Молекулярная биология клетки. Американское общество клеточной биологии (ASCB). 20 (17): 3840–3850. Дои:10.1091 / mbc.e09-02-0146. ISSN  1059-1524. ЧВК  2735483. PMID  19605561.
  5. ^ а б Чен Дж., Чанг Ю.С., Денис К.Л. (март 2002 г.). «CCR4, 3'-5'-поли (A) РНК и экзонуклеаза оцДНК, является каталитическим компонентом цитоплазматической деаденилазы». EMBO J. 21 (6): 1414–26. Дои:10.1093 / emboj / 21.6.1414. ЧВК  125924. PMID  11889047.
  6. ^ «Ген Entrez: транскрипционный комплекс CNOT6 CCR4-NOT, субъединица 6».
  7. ^ а б Альберт, Томас К .; Ханзава, Хироюки; Legtenberg, Yvonne I.A .; de Ruwe, Marjolein J .; van den Heuvel, Fiona A.J .; Collart, Martine A .; Боеленс, Рольф; Тиммерс, Х.Т. Марк (01.02.2002). «Идентификация субъединицы убиквитин-протеин-лигаза в репрессорном комплексе транскрипции CCR4-NOT». Журнал EMBO. Вайли. 21 (3): 355–364. Дои:10.1093 / emboj / 21.3.355. ISSN  0261-4189. ЧВК  125831. PMID  11823428.
  8. ^ Альберт, Т. К. (2000-02-01). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT». Исследования нуклеиновых кислот. Издательство Оксфордского университета (ОУП). 28 (3): 809–817. Дои:10.1093 / nar / 28.3.809. ISSN  1362-4962. ЧВК  102560. PMID  10637334.
  9. ^ а б c Чжэн, Сяофэн; Думитру, Ралука; Lackford, Brad L .; Freudenberg, Johannes M .; Singh, Ajeet P .; Арчер, Тревор К .; Джоти, Раджа; Ху, Гуан (2012-04-09). «Cnot1, Cnot2 и Cnot3 поддерживают идентичность ESC мыши и человека и подавляют экстраэмбриональную дифференцировку». Стволовые клетки. Вайли. 30 (5): 910–922. Дои:10.1002 / стержень.1070. ISSN  1066-5099. ЧВК  3787717. PMID  22367759.
  10. ^ Обнимать.; Kim, J .; Xu, Q .; Ленг, Y .; Оркин, С. Х .; Элледж, С. Дж. (1 апреля 2009 г.). «Скрининг РНКи всего генома определяет новый модуль транскрипции, необходимый для самообновления». Гены и развитие. Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. 23 (7): 837–848. Дои:10.1101 / gad.1769609. ISSN  0890-9369. ЧВК  2666338. PMID  19339689.
  11. ^ Паванелло, Лоренцо; Холл, Бенджамин; Airhihen, Благословение; Винклер, Герлоф Себастьян (2018-11-09). «Центральная область CNOT1 и CNOT9 стимулирует деаденилирование с помощью модуля нуклеазы Ccr4-Not». Биохимический журнал. Portland Press Ltd. 475 (21): 3437–3450. Дои:10.1042 / bcj20180456. ISSN  0264-6021. PMID  30309886.
  12. ^ а б Mauxion, Fabienne; Прев, Бриджит; Серафин, Бертран (2013). «C2ORF29 / CNOT11 и CNOT10 образуют новый модуль комплекса CCR4-NOT». РНК Биология. Informa UK Limited. 10 (2): 267–276. Дои:10.4161 / rna.23065. ISSN  1547-6286. PMID  23232451.