CNOT8 - CNOT8

CNOT8
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT8, CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT субъединица транскрипционного комплекса 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 603731 MGI: 1916375 ГомолоГен: 48304 Генные карты: CNOT8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.2 Начните 154,857,553 бп[1] Конец 154,876,793 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начните 58,104,153 бп[2] Конец 58,118,594 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • поли (A) -специфическая рибонуклеазная активность • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • нуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • CCR4-НЕ комплекс • внутриклеточный • ядро клетки • П-боди • Основной комплекс CCR4-НЕ Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • положительная регуляция катаболического процесса мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • подавление гена с помощью miRNA • положительное регулирование пролиферации клеток • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • подавление гена с помощью РНК • регулирование перевода • отрицательное регулирование пролиферации клеток • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией • отрицательное регулирование перевода Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9337	69125
Ансамбль	ENSG00000155508	ENSMUSG00000020515
UniProt	Q9UFF9	Q9D8X5
RefSeq (мРНК)	NM_001301073 NM_001301074 NM_001301075 NM_001301077 NM_001301080 NM_001301082 NM_001301083 NM_001301086 NM_004779	NM_026949 NM_001356477 NM_001363084 NM_001363085 NM_001363086
RefSeq (белок)	NP_001288002 NP_001288003 NP_001288004 NP_001288006 NP_001288009 NP_001288011 NP_001288012 NP_001288015 NP_004770	NP_081225 NP_001343406 NP_001350013 NP_001350014 NP_001350015
Расположение (UCSC)	Chr 5: 154,86 - 154,88 Мб	Chr 11: 58.1 - 58.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CCR4-NOT субъединица 8 транскрипционного комплекса это белок что у людей кодируется CNOT8 ген.^[5][6][7] Это подразделение CCR4-Нет деаденилаза сложный.

Взаимодействия

CNOT8 был показан взаимодействовать с BTG2,^[8] BTG1,^[8][9] CNOT1^[6][10] и CNOT3.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155508 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020515 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фидлер К., Уэйнскоат Дж. С., Боултвуд Дж. (Май 1999 г.). «Ген POP2 человека: идентификация, секвенирование и картирование критической области 5q-синдрома». Геномика. 56 (1): 134–6. Дои:10.1006 / geno.1998.5687. PMID  10036195.
6. Альберт Т.К., Лемер М., ван Беркум Н.Л., Генц Р., Колларт М.А., Тиммерс Х.Т. (март 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (3): 809–17. Дои:10.1093 / nar / 28.3.809. ЧВК  102560. PMID  10637334.
7. «Ген Entrez: транскрипционный комплекс CNOT8 CCR4-NOT, субъединица 8».
8. Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Магауд Дж. П., Корбо Л. (март 2001 г.). «Взаимосвязь антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа». J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. Дои:10.1074 / jbc.M008201200. PMID  11136725.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

дальнейшее чтение

• Богдан Дж. А., Адамс-Бертон С., Педикорд Д. Л., Сукович Д. А., Бенфилд П. А., Корджай М. Х., Столтенборг Дж. К., Дикер И. Б. (1998). «Человеческий углеродный репрессорный белок катаболита (CCR4) - ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с белком транслокации B-клеток BTG1». Biochem. J. 336 (Pt 2): 471–81. Дои:10.1042 / bj3360471. ЧВК  1219893. PMID  9820826.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Магауд Дж. П., Корбо Л. (2001). «Взаимосвязь антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа». J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. Дои:10.1074 / jbc.M008201200. PMID  11136725.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (2000). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Морель А.П., Сентис С., Бьянчин С., Ле Романтик М., Джонард Л., Ростан М.С., Римох Р., Корбо Л. (2003). «Антипролиферативный белок BTG2 взаимодействует с комплексом CCR4 человека, существующим in vivo в трех формах, регулируемых клеточным циклом». J. Cell Sci. 116 (Пт 14): 2929–36. Дои:10.1242 / jcs.00480. PMID  12771185.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Дорфлейтнер А., Брайан Н.Б., Тэлботт С.Дж., Фунья К.Н., Реллик С.Л., Рид Дж.С., Ши Х, Роянасакул Ю., Флинн, округ Колумбия, Стехлик С. (2007). «Клеточный белок 2, содержащий только пириновый домен, является кандидатом в регулятор активации инфламмасом». Заразить. Иммунная. 75 (3): 1484–92. Дои:10.1128 / IAI.01315-06. ЧВК  1828547. PMID  17178784.

внешняя ссылка

• Человек CNOT8 расположение генома и CNOT8 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.