CNOT6L - CNOT6L

CNOT6L
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3NGN, 3NGO, 3NGQ, 5DV2
Идентификаторы
Псевдонимы	CNOT6L, CCR4b, CCR4-NOT субъединица транскрипционного комплекса 6 подобна
Внешние идентификаторы	OMIM: 618069 MGI: 2443154 ГомолоГен: 100830 Генные карты: CNOT6L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.1 Начинать 77,713,387 бп[1] Конец 77,819,615 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E3 Начинать 96,070,333 бп[2] Конец 96,164,171 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • поли (A) -специфическая рибонуклеазная активность • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • нуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • CCR4-НЕ комплекс • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический • обработка мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция сборки тела цитоплазматической мРНК • дестабилизация мРНК • положительное регулирование пролиферации клеток • подавление гена с помощью РНК • регулирование перевода • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, зависимый от деаденилирования распад • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	246175	231464
Ансамбль	ENSG00000138767	ENSMUSG00000034724
UniProt	Q96LI5	Q8VEG6
RefSeq (мРНК)	NM_001286790 NM_144571 NM_001365006 NM_001365007	NM_001285511 NM_001285514 NM_144910 NM_178854
RefSeq (белок)	NP_001273719 NP_653172 NP_001351935 NP_001351936	NP_001272440 NP_001272443 NP_659159 NP_849185
Расположение (UCSC)	Chr 4: 77,71 - 77,82 Мб	Chr 5: 96.07 - 96.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CCR4-NOT субъединица транскрипционного комплекса 6 подобна это белок что у человека кодируется CNOT6L ген.^[5] Это паралог CNOT6 и, следовательно, потенциальная субъединица CCR4-Нет деаденилаза сложный.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138767 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034724 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: субъединица 6 транскрипционного комплекса CCR4-NOT». Получено 2020-04-15.

дальнейшее чтение

• Морита М., Сузуки Т., Накамура Т., Ёкояма К., Миясака Т., Ямамото Т. (июль 2007 г.). «Истощение CCR4b деаденилазы млекопитающих вызывает повышение уровня мРНК p27Kip1 и нарушает рост клеток». Мол. Клетка. Биол. 27 (13): 4980–90. Дои:10.1128 / MCB.02304-06. ЧВК  1951489. PMID  17452450.
• Rose JE, Behm FM, Drgon T, Johnson C, Uhl GR (2010). «Персонализированный отказ от курения: взаимосвязь между дозой никотина, зависимостью и оценкой генотипа успеха в отказе от курения». Мол. Med. 16 (7–8): 247–53. Дои:10.2119 / молмед.2009.00159. ЧВК  2896464. PMID  20379614.
• Ван Х, Морита М., Ян Х, Сузуки Т., Ян В., Ван Дж, Ито К., Ван Кью, Чжао С., Бартлам М., Ямамото Т., Рао З. (август 2010 г.). «Кристаллическая структура домена нуклеазы CNOT6L человека демонстрирует строгую поли (A) субстратную специфичность». EMBO J. 29 (15): 2566–76. Дои:10.1038 / emboj.2010.152. ЧВК  2928688. PMID  20628353.
• Нейлор М.Г., Вайс С.Т., Ланге С. (сентябрь 2010 г.). «Байесовский подход к исследованиям генетической ассоциации с семейными дизайнами». Genet. Эпидемиол. 34 (6): 569–74. Дои:10.1002 / gepi.20513. ЧВК  3349938. PMID  20818722.
• Миттал С., Аслам А., Дойдж Р., Медика Р., Винклер Г.С. (март 2011 г.). «Субъединицы деаденилазы Ccr4a (CNOT6) и Ccr4b (CNOT6L) человеческого комплекса Ccr4-Not способствуют предотвращению гибели и старения клеток». Мол. Биол. Клетка. 22 (6): 748–58. Дои:10.1091 / mbc.E10-11-0898. ЧВК  3057700. PMID  21233283.
• Чжоу В., Тиери Дж. П. (июнь 2013 г.). «Потеря Git2 вызывает эпителиально-мезенхимальный переход с помощью miR146a-Cnot6L-контролируемой экспрессии Zeb1». J. Cell Sci. 126 (Pt 12): 2740–6. Дои:10.1242 / jcs.126367. PMID  23591815.
• Полесская А., Пинна Г., Сасси Ю., Вандамм М., Бигот А., Мули В., Морозова Н., Харел-Беллан А., Дегерни С. (февраль 2016 г.). «Посттранскрипционная модуляция интерлейкина 8 с помощью CNOT6L регулирует дифференцировку скелетных мышц». Биохим. Биофиз. Acta. 1863 (2): 263–70. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2015.11.018. PMID  26608607.
• Чжан Цюй, Ян Д., Го Э, Дин Б., Ян В., Лю Р., Ямамото Т., Бартлам М. (апрель 2016 г.). «Структурная основа ингибирования деаденилазной активности человеческого CNOT6L». FEBS Lett. 590 (8): 1270–9. Дои:10.1002/1873-3468.12160. PMID  27013054.
• Морита М., Сиддики Н., Кацумура С., Руйя К., Ларссон О., Нагашима Т., Хекматнежад Б., Такахаши А., Кийонари Н., Занг М., Сен-Арно Р., Оике Y, Гигер В., Тописирович И., Окада-Хатакеяма М., Ямамото Т., Зоненберг Н. (апрель 2019 г.). «Посттранскрипционная сеть печени, состоящая из CCR4-NOT деаденилазы и FGF21, поддерживает системный метаболический гомеостаз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 116 (16): 7973–7981. Дои:10.1073 / pnas.1816023116. ЧВК  6475422. PMID  30926667.