CYFIP1 - CYFIP1 - Wikipedia

CYFIP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3P8C, 4N78
Идентификаторы
Псевдонимы	CYFIP1, P140SRA-1, SHYC, SRA-1, SRA1, цитоплазматический белок 1, взаимодействующий с FMR1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606322 MGI: 1338801 ГомолоГен: 22628 Генные карты: CYFIP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q11.2 Начинать 22,867,052 бп[1] Конец 22,981,063 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B5 Начинать 55,841,745 бп[2] Конец 55,932,602 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • связывание актиновой нити • Связывание Rac GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание кэпа 7-метилгуанозина РНК • деятельность регулятора перевода Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • цитоплазма • синапс • проекция клетки • соединение клеток • цитозоль • СКАР комплекс • очаговая адгезия • ламеллиподиум • перинуклеарная область цитоплазмы • взъерошить • комплекс связывания кэпа мРНК • проекция нейрона • внеклеточная область • кончик филоподия • просвет секреторной гранулы • специфический просвет гранулы • тело нейрональной клетки • терминальный бутон • дендритный позвоночник • дендритный конус роста • конус роста аксонов • возбуждающий синапс • центральная область конуса роста • периферическая область конуса роста • просвет третичной гранулы • постсинапс Биологический процесс • Передача сигнала белка Rac • познание • Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе • развитие многоклеточного организма • взъерошенная организация • расширение аксона • сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов • развитие нервной системы • регулировка формы клеток • дифференциация клеток • положительная регуляция опосредованного комплексом Arp2 / 3 нуклеации актина • ламеллиподиум в сборе • клеточный ответ на стимул инсулина • дегрануляция нейтрофилов • положительная регуляция удлинения аксона • положительная регуляция аксоногенеза • ответ на электрический стимул • положительная регуляция развития дендритов • положительное регулирование сборки оборок • отрицательная регуляция рециклинга синаптических пузырьков • развитие проекции нейрона • положительная регуляция сигнального пути рецептора нейротрофина TRK • расширение дендрита • регулирование перевода • модификация синаптической структуры • клеточный морфогенез • управление аксоном • узел проекции ячейки • регуляция трансляции при постсинапсе, модуляция синаптической передачи • регуляция модификации постсинаптического актинового цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23191	20430
Ансамбль	ENSG00000280618 ENSG00000273749	ENSMUSG00000030447
UniProt	Q7L576	Q7TMB8
RefSeq (мРНК)	NM_001033028 NM_001287810 NM_014608 NM_001324119 NM_001324120 NM_001324122 NM_001324123 NM_001324124 NM_001324125 NM_001324126	NM_001164661 NM_001164662 NM_011370
RefSeq (белок)	NP_001028200 NP_001274739 NP_001311048 NP_001311049 NP_001311051 NP_001311052 NP_001311053 NP_001311054 NP_001311055 NP_055423	NP_001158133 NP_001158134 NP_035500
Расположение (UCSC)	Chr 15: 22,87 - 22,98 Мб	Chr 7: 55,84 - 55,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитоплазматический FMR1-взаимодействующий белок 1 это белок что у людей кодируется CYFIP1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

CYFIP1 был показан взаимодействовать с FMR1,^[5] за исключением FXR1 и FXR2.^[5] Он также является частью Регуляторный комплекс WAVE (WRC),^[7] и на основании кристаллической структуры WRC считается, что CYFIP1 обеспечивает сайт связывания для комплекса с Rac1.^[8]

Рекомендации

1. ENSG00000273749 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280618, ENSG00000273749 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030447 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шенк А., Бардони Б., Моро А., Баньи С., Мандель Дж. Л. (июль 2001 г.). «Семейство высококонсервативных белков, взаимодействующих с ломким белком X-психической отсталости (FMRP) и демонстрирующих селективные взаимодействия с FMRP-родственными белками FXR1P и FXR2P». Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (15): 8844–9. Дои:10.1073 / pnas.151231598. ЧВК  37523. PMID  11438699.
6. «Ген Entrez: цитоплазматический белок 1, взаимодействующий с FMR1 CYFIP1».
7. Чен З., Борек Д., Падрик С.Б., Гомес Т.С., Метлагель З., Исмаил А.М., Уметани Дж., Билладо Д.Д., Отвиновски З., Розен М.К. (25 ноября 2010 г.). «Структура и контроль актинового регуляторного комплекса WAVE». Природа. 468 (7323): 533–8. Дои:10.1038 / природа09623. ЧВК  3085272. PMID  21107423.
8. Коронакис В., Хьюм П.Дж., Хамфрис Д., Лю Т., Хорнинг О., Дженсен О.Н., Макги Э.Д. (30 августа 2011 г.). «Активация регуляторного комплекса WAVE за счет взаимодействия GTPases Arf и Rac1». Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35): 14449–54. Дои:10.1073 / pnas.1107666108. ЧВК  3167530. PMID  21844371.

дальнейшее чтение

• Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 1 (5): 223–9. Дои:10.1093 / днарес / 1.5.223. PMID  7584044.
• Кобаяши К., Курода С., Фуката М. и др. (1998). «p140Sra-1 (в частности, связанный с Rac1 белок) представляет собой новую специфическую мишень для малой GTPазы Rac1». J. Biol. Chem. 273 (1): 291–5. Дои:10.1074 / jbc.273.1.291. PMID  9417078.
• Витке В., Подтелейников А.В., Ди Нардо А. и др. (1998). «В мозге мышей профилин I и профилин II связаны с регуляторами пути эндоцитов и сборки актина». EMBO J. 17 (4): 967–76. Дои:10.1093 / emboj / 17.4.967. ЧВК  1170446. PMID  9463375.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чай Дж. Х., Локк Д. П., Грилли Дж. М. и др. (2003). «Идентификация четырех высококонсервативных генов между горячими точками BP1 и BP2 области делеции синдромов Прадера-Вилли / Ангельмана, которые претерпели эволюционную транспозицию, опосредованную фланкирующими дуплонами». Являюсь. J. Hum. Genet. 73 (4): 898–925. Дои:10.1086/378816. ЧВК  1180611. PMID  14508708.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б. и др. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Innocenti M, Zucconi A, Disanza A и др. (2004). «Abi1 необходим для образования и активации сигнального комплекса WAVE2». Nat. Cell Biol. 6 (4): 319–27. Дои:10.1038 / ncb1105. PMID  15048123.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Кавано Ю., Йошимура Т., Цубои Д. и др. (2005). «CRMP-2 участвует в кинезин-1-зависимом транспорте комплекса Sra-1 / WAVE1 и образовании аксонов». Мол. Клетка. Биол. 25 (22): 9920–35. Дои:10.1128 / MCB.25.22.9920-9935.2005. ЧВК  1280248. PMID  16260607.
• Биттел ДК, Кибирева Н, Батлер МГ (2006). «Экспрессия 4 генов между точками разрыва 1 и 2 хромосомы 15 и поведенческие исходы при синдроме Прадера-Вилли». Педиатрия. 118 (4): e1276–83. Дои:10.1542 / педс.2006-0424. ЧВК  5453799. PMID  16982806.
• Чен З., Борек Д., Падрик С.Б., Гомес Т.С., Метлагель З., Исмаил А.М., Уметани Дж., Билладо Д.Д., Отвиновски З., Розен М.К. (25 ноября 2010 г.). «Структура и контроль актинового регуляторного комплекса WAVE». Природа. 468 (7323): 533–8. Дои:10.1038 / природа09623. ЧВК  3085272. PMID  21107423.
• Коронакис В., Хьюм П.Дж., Хамфрис Д., Лю Т., Хорнинг О., Дженсен О.Н., Макги Э.Д. (30 августа 2011 г.). «Активация регуляторного комплекса WAVE за счет взаимодействия GTPases Arf и Rac1». Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35): 14449–54. Дои:10.1073 / pnas.1107666108. ЧВК  3167530. PMID  21844371.

внешняя ссылка

• Человек CYFIP1 расположение генома и CYFIP1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Человек SRA1 расположение генома и SRA1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.